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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0131200 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0131200.2 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH; TAIR: AT2G40770.1 RING-finger, DEAD-like helicase, PHD and SNF2 domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q149N8|SHPRH_HUMAN E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH; TrEMBL-Plants: tr|I1JH54|I1JH54_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0131200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:21048478..21070075) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CAAACACAAAAACAGAAACTGAGTTCTATCGGTTCCTCAATTCATGCTCTGTTCACTTCACTGATTCTCTTCCTCTTGTC AGGTTCCAATTCCAATCCCTTTCCCTTTTTCTCATGCACAAAATTCACGTGCAACAGTAATTGTTGCATTGGTTCCTGCA AGGTTAGGGACTTTTGGGATTAGACTATTGGCTATGGTGGTGTTGTCCCCATTCCTTGTTTTTGTGCCTACCCTTTTATT CAATTATGTTAAATTTCACTTAAATTTTTGTTCTTTCTTACCCTTTGCTGCATAATTGCATTTGCCAGCTTTTGAATGGT TCTGCATTCAATCTTTACCTTTTGAGCTCATGTTGGACTATTGTTTAATTTGTTACTAACTTGTTGTTGTTATATATTTA TGGTGTTTCCTCTGGTTTGGTGCTTATGCAGGTTGAAAATCGAATTCTAAATGCTAAATCTGAGTTCTAGGGTCTTCATG TTGAACTTCAGTTTCAATTTTGTAGAATCATGAGTGATCTTTGGCATTATGTTAATATAGCTTAGCTTTTTCTAAAAAAA GAAGTTTTTTTTTTTTTAATTTGGTGAAGGTAACAAGTGATGGGTAGACGAAAAAGTAAACCGCGTAGATCAGGTGGGGT AATACTAGAAACAAATGCTACTGCTGACACAGAATTTGATAAAGAGAAGGTTGGAGAAGCAGGGGAAGAAGCAAGGGATA ATTCTGGTGACATTGATGAACCTTATTTTGTTGAGGTTGACCGGTCCAGTTGGTTGTCAAGTGAACATCTTGATATTTCT GAAGTTATTTTAAGTGATTTAAATTTGAGAGAAGGTTTTTCTGGGTTTGAACTATCTGAGGGGTTTTATCAGGATCCCCA GTACTCGTTAAGATTTCGGGTGTGTAATGTCAATAATGTTCTTGGTAGAATTAAATTAGGCCATTGGCCTGTGTTACCCT 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TCATGTTTTATGCTGCGTATTGTCAGTGATGTTCTGTGCCACTATTCAATATTTAACTATATGACAGGTCAACCAATTTT TTCATTGCATTAATTGCTTGGTTCAGGTAAATCTTTCTAGTCAAATTTAACTAGTGATGAAATCCGGTGTTAAAAGGGGG TCAATATGTGAGTTTTTACTTTTTATGATTAATTACTAAACTTAATAAATATATTAAATTAACCAACACAAGATCAAACC TTCACTACATCCAATGTCTAATGACATCACACACCTCACTTTCAAAGGTTACCTGGACCACACAACCACATTCCATAAAA TTAACCCAGCTCTTTTAGATTTATTTTCCTTTCAATAGAATAAAAGGTAATTTGCAAATTTTGTAGGAACGTTTAGTTGT AAAAGAAAAGGGAAAAACTTAGGTACGGTTCCGTACATGCTTTTTTTACTGTTGTCCAATTACAGCATGACATGTGGGCT AAAACAAGAGAAGTTGAGAATCACAATAAAAAATTAATAAAAGGGCAATACCTTTATTAAAAAATTTATAGATGTTGAAA TTAAAGTTAAAAACTCAACGTGTTATTTTCTAATTTGAACTGAGCTTTCTCCCTAAGATTTCTTAGAATCTATGATATTT TCTTTTCTGCTTTGGACATTCACCCTAAGCTGAACCTTTTTTCAGGGTTTGGTGCAGTCCAAGCAAAAACTGTCATTGGA ATCTCCAGATAGTTCTTCATTCATTCAAGAGACAACTAAAATATCAAACACTAAGGAAGAGAAGGGTGCGCTCATATCTA AAACTGATGAGGAAACATGCCCAGTTTGCCAAGAAAAGCTAGGCAATCAGAGAATGGTATTTCAGTGTGGGCATTTTACA TGCTGTAAATGTAAGTATTATACTACCATACTTTATACTATCATTCTTTAATATGTTAAATATGTAATGAGTCATTGCTA ATTCTTTACCGAATAGTATAAGCTTTTAGCAGAGTTAATTTTATCAGAGGTTCAATGATCAAGTCATCAAGAGTTGGATA TTTGTTGTCCCTATTCTTCTAAATAAAATATTTGAATTTCAGATGCGCATGTGCATTGTCTTCACTTTAAGGTCATTAAA GGTTCTTTGGTGATGGTTCTTTTGTCATTTGTACGTAGACCAGCATAATACTTCAGTCAGTGTTACCAGACATAGAGTTG CTTCTGTATAATACAGAAAGTCTTTTATGTTCCAATTCCATTTGTTCTTTATGCACTTTAAAAACAGTGATATATTGAAT TTGCATTGGTCGTTTGCTTTTCATCATGTCTATGTAAAACAAGAGGTAAAGCAAATAATAGCTGTATGCATAGTGCATAC TTGTTTAGTGTTGCTCTCGACAATCTCTATTCAACAGACATTCAAGTTAATGGTTAAGAATTGAGACTTTTAAATAAATA TGATATGAAATATAACCATCCCTATATTTCTTACAGGTTTATTTGCGATGACTGAGCAAAGACTTCAACATAGCAAGACT CATAATTGGGTGATGTGCCCTACATGTCGACAACATACTGATTTTGGAAACATTGCCTATGCTGTTGATGCACATAATGA ATCTTCCAATTCTTCAATGCAGCATACAGTTGACAGCTGTGAAAAATGTGAAACATCCATTAGTGTTAAAGGCTCATATG GAACTAAGGTGTTTCTCCACATAACAACTTAAGTGTATTTATACCTTAGTCCTTAGGATGAATAAGTTTGTTTCTTTTCT TCATTTATAAATTCCACTACCTCAGGATTTGCTTGCGATGCCTTAATATTATCTTTTGATTGTTTTAAAACTTAATATAT ATTATAATTGCAAAACGTTTTGTATGATATATTCTTTCTTCATGTCACATTTCACATTTTAATTTGCACGTTCAGCAGAT AAGTCATGCTTTGGCATATTTGCTTTATACCATATGTTTATGCCCTTTAAATCTTGTATTCGTCATCTTTTTCTTGCTTT GGATGTTTGTAGATTGAAGCCGTCACAAGAAGAATCTTGTCAATAAAGGCTACAGATCATAAAGAAAAAGTTCTTGTATT TTCAAGCTGGAATGATGTACTTGATGTATTGGAACATGCCTTTGCTGCCAACAACATTACCTTCGTCCGGATGAAAGGAG GCAGGTATGGTAACCTATCCAGTTCCTATGTCTATTTGTAAATTTATGCTGGACTAGAAGACATTTGAAGGGGAGGAAAA CTTAGAGCGACAAGATAGACAGAGAAAACTGACTAAATTTTGGTCCCTCACATTTGATTTCTTTCTCAATGTGTCCTTGA CATTTCATTAATTCATTTCAATTTGATCCCTCTGTCTATGTTTTCTTTAATCACCTAATGTAAGTGATGACAGACCATCA ATAACTAAGATGTAGCATTCAACATGCCATTTGGACCATGACATGGAAATCACAGCTGTACTTTTGTTACTGGTAACACT TGGTCAATAAAAAAATTCTTTATTTCTACCATTTTTTACTTGTTATATATGGTTAGGTGTCTTTTCTATCACTTCAACTT TATGCTTTAATCTCGAATACCAGTTGCTTGCAAATCTAGGGATAGGGAATTGTTGTGCTGGTTATTCTGTTTTGAGCATT GTAGCGCATGAATTTAGCTCAGGATTATTGTCTTATGGATCCATATAGGCTTTTTGTGTTAGTTAATACGGTTGATTGAT TACGACAATAAGCCACTTACTCAAATGTTATTTTGGTTATGAATTTGCGAGTCCAGAAAGGCACAAGTTGCCATCAATCA ATTTAGGGGAAAGCAGAATGGCACAAAAGGATGTGAGAAGTCAACACCAAAATCTATTCAAGTATTATTGCTTTTAATCC AACATGGAGCCAATGGCCTCAATCTTTTGGAAGCACAGCATGTAGTCCTTGTAGAGCCATTGCTCAATCCAGCTGCTGAA GCACAAGCAATCAGCCGTGTACATCGTATTGGACAAAAGAATAAGACCCTCATTCATCGTTTCATTGTAAGTCTCTCCTA TGAGTTCTTACTCAATCATCATTATTGTTAGAAATATAATATGAAACCATTCACGTATCTTCACTGAGTTCACCTAAGAA CTCTAGCTTTTGGAATAGATGATTCATGACATAGTATCAGAGCCTGTATGATCAAGTGGTCTAGAGTTCGATCCTTGTTA CCTCTTTTGTTCTAATAAAAAATTTGAATTTAAGTACAGTATAGGTGGACCTGTGTATTGTCCACGTTTCAAGCCCATTG GGCTTTTGCATGAGGGGACGTGTTAAAAATATAATATATAAAAACATTCATGTGTCTTTACCCAACAACTTAAGCTTTTG AGATAGTTTGTGACAATGATCAACTTTGAATGTGCTCAACCGTAAATATTCTCTGAATGTGCTCTTCCCTTTCTGTTTGA ACTTTGCTTGATGTTACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAATACTTCTAGTATGCATCAACTATTGATTTT GCCTCATTGTTCTCTATCCCGTGTCTGTTCTTTACTTTATATCAGAACACCATCTGCTATCTCCATTACTATAGCTATAA ATTTTTGTGAGTGCTTACGAATTCAGTAGTTTCATTGATTAGCTAATAATCTTTTTTTCGGGTGAGACAATGAAAAGTTT CTGTGAGTAGCCAAGGTTTGTCTTATAAATCAAACTCAAACATGAAGAATTGTTCTTATAATTTTGTTCTTGCATGTGTT AGGTAAAAGACACAGTTGAAGATAGCATATATAAATTGAACAGGAGCAGGAGCAACCATTCATTCATTAGTGGGAACACA AAAAACCAAGATCAACCTGTTTTGACCCTGAAGGATGTTGAGTCCTTGCTGTCAAGAACACCAGTAACCATGCCAGAAAG TGATGAAAATCCTATTGCAAATGCAGACCTGAGAAACTTTCCACCATCAATGGCTGCGGCTATAGCTGCTGAGAGGAGAC TTAATGATCATAGGACATGATTTTGTTTTTCTCCTCATCTCAGATGGTTCAAAAGATGCTGGTAGAGTAGGCACGTGTGC AACCGTGCAATAATCAGTTGGCGATGTCGTTGCAGTTGACAAGATCCCATCCATTAGCGGTATGCACACTTTTACTCATA AGATTGTTCATTGTATTTTGATTTGCGTTTTGATGAAAGAATTATGTGTGATTTATTTGCATAATTATTGTAGTCGTTGT ATTTTTTCCCTTTACATTAGAAGATATTCAAATTAATTAGTCATTAGTTCTCTTTAAGACAAATTCAAACATTATTTT
CDS sequence (LotjaGi1g1v0131200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGGTAGACGAAAAAGTAAACCGCGTAGATCAGGTGGGGTAATACTAGAAACAAATGCTACTGCTGACACAGAATTTGA TAAAGAGAAGGTTGGAGAAGCAGGGGAAGAAGCAAGGGATAATTCTGGTGACATTGATGAACCTTATTTTGTTGAGGTTG ACCGGTCCAGTTGGTTGTCAAGTGAACATCTTGATATTTCTGAAGTTATTTTAAGTGATTTAAATTTGAGAGAAGGTTTT TCTGGGTTTGAACTATCTGAGGGGTTTTATCAGGATCCCCAGTACTCGTTAAGATTTCGGGTGTGTAATGTCAATAATGT TCTTGGTAGAATTAAATTAGGCCATTGGCCTGTGTTACCCTATACTGATATTCATCTAGAGTTAGTAAAATGGGACACAG TAGACAATGTGGAAACATGTACAGTGTTATTATCTGGTATTTTTGATGGACCTGATGAAGGTGTTTCTGGTCTTCTTCAC TTGGCAAGTTTAAAATTTGTAACATTGAGGACAGTTCTTGGGGTTAGGCTTTCTGAGGACATTCATTCCCTCAGGATAAG GGTTGAGGTACTAAAGAGTGCCTTCGATGCATGCGAGTCGCTTCTCGAGGCTTCTAGACAATTATGGAAAAAGAGTATGA TGAATGTCATGTCTTGGCTACGTCCAGAAATAATGATTTCCGAAGTTAGGTATGGGTTTGGTAACTGCAAGAAAATGGAA GTTGACCAGAAGACAGAGACGGGAGACGGCAGGAAATATTCGAGGTTTGATCCTGCAGGTTTTTATGAGGCCATTAAGCC TTCAAAATCCGAGCCAATGCTCGAAGATGAAATACCAGAGTTACTTCCTGAACTGAGGCCATATCAACGGCGTGCAGCTT TCTGGATGGTAGAACGGGAGAAAGCACTGAAAGAAAGTCAGGGTGAAAGAGAAAGAAATCAGTTTCATTCTCCATTATGT GTGCCTGTGGATTTTCTGGACACAAGGTCTAAAATGTTTTTCAATCCATTCAGTGGAAATATTTCATTGTGCCCAGAGAC TCCTTCACCTTATGTACTTGGAGGCATTCTTGCTGATGAGATGGGCTTGGGTAAAACTGTTGAATTGCTCGCTTGCATCT ATGCTCACCGGAGATCAGCATCTGGAAGCGACACACTAATTGAGTCAGTGCCCCAAGTTAACGGGGACCAAAATATCACT TTAAAAAGACTCAAAAGAGAACGAGTGGAGTGCATATGTGGGGCTGTGAACGAAAGTATCAAATATCAAGGGCTATGGGT TCAATGTGACATTTGCGATGCTTGGCAACATGCAGATTGTGTTCGTTATTCACCTAAAGGAAAATCACTGAAATCAAAAC AAGGATCTGAAAGCAAGACATATAAAACTACCATAGCTGTGAGGGATGGGGAATATGTATGTCAGATGTGCTCTGAACTA ATACAAGCTACTGAATCTCCTATTGCCTCCGGTGCCACTCTCATTGTCTGCCCTGCTCCTATTTTGCCCCAGTGGCATGA TGAAATTATACGTCATACACGTCCAGGCTCCTTGAAAACTTGTATTTATGAAGGCGTGCGGGACACATCTTTCTCCAATA CGTCTCTGATGGATATCAGTGATCTTGCAAGTGCTGACATTGTAATAACTACATATGATGTGCTTAAAGAGGATTTGTCC CATGATTCTGATAGACACGAAGGTGATCGACACTTATTGAGATTTCAAAAAAGATACCCGGTTATCCCAACTCTTCTTAC CAGAATATACTGGTGGAGGGTTTGTTTGGATGAGGCTCAAATGGTGGAGAGTAATGCTACTGCTGCCACTGAAATGGCTC TGAGACTCCATTCGAAGCATCATTGGTGCATTACAGGGACCCCGATTCAGCGAAAGCTTGATGACTTATATGGACTTCTA AGATTCCTTAAAGTTAGTCCTTTCAATACATACAGGTGGTGGGCTGAAGTTCTTCGAGATCCTTATGAGAAAGGAGATAT TGGAGCTATGGAATTTACACACACAATTTTCAAGCAAATCATGTGGCGTTCTTCTAAAAAACATGTTGCAGATGAATTGG ACCTTCCATCCCAAGAGGAGTGCCTCTCTTGGCTTACACTCTCACCAGTAGAAGAGCACTTTTACCAGAGGCAACATGAA ACTTGTGTTAGAGATGCCCATGAAGTTATTGAAAGTTTGAGAAATGATATTCTAAATAGAAAAGTCCCAGGTTCTGAATC TTTGAATGATTCCTCTGATCCTTTAATCACCCACACAGAGGCAGGGAAGCTACTGAATGCTTTACTGAAACTTCGTCAGG CTTGTTGTCATCCCCAGGTTGGAAGTTCTGGTTTGCGTTCCCTGCAGCAGTCACCTATGACCATGGAGGAAATACTAATG GTTCTTATAAATAAGACCAAGATCGAAGGGGAGGAAGCTCTTAGGAGGTTAGTTGTTTCTCTGAATGGGCTTGCAGCAAT AGCTACAATTCAACAAGATTTTTCTCAAGCTGCATTATTGTACAATGAAGCCCTTACTTTGACTGAAGAGCATTCTGAAG ATTTCCGCCTGGATCCTTTGTTAAATATTCACATTCATCATAATCTTGCTGAAACACTCCCGCTGGCAGAAAATGTTGCA TTGATATTGCCTTCCAAAGGAAAGCAATTCTCTGGAACTTCTGCAGTTAAGTCAACCAGAAAGCATTTTATTGCAAAGGT TGATCGTTGTCTTGTGAAGAGGCAAAAAATAAGTGGCTGCGATGATAAAAATTTAGAAGTGGCTTCTGCAGAACCATCAC ATATTGCATCCAGCCTTTCAGAAAATGACTTAAATGAGGATTTGAAATTTGATGATTTATCAGCCAGTCCTGTCAAATCT CTGATAGCAGAATGTGAAGATTCAAAAAAGAAATACTTATCTGTGTTTAATTCAAAATTATCTGCTGCTCAACAAGAGTT TCAGAATTCTTCCACGCAGGTTCGTAATGCATATCGCGAAAGCAGAACAGATCAAAATACATGTTGGTGGTTAGAAGCAC TTCATCATGCTGAGCAGAACAAGGATTTCTCAACTGAGTTGATTAGAAAGATTGAAGAAGCCATCTCAGGAAATTCAAAC AATTCAAAATCATCAAGGATAGCTGCTCGTTTTCGGGGCATAAGCTCTCTGAAGTATCAAATTCAGACAGGTTTAGACCA GTTAGAGGCATCTAGGAAAGTGCTACTAGAACGACTGTTAGAAATCGATCACACGATGGAAAATCCGAAGGGTGAAGATA TTGAACGTGTGGGTAAATGTCGAAATTGTCAACCTAATTGTGATGGTCCCCCATGCGTTCTGTGTGAGCTAGACGAACTG TTTCAGGGCTATGAAGCAAGACTTTTTGTTCTCAAGAACGAACGTGGAGGGATTATTTCATCTGCTGAGGAGGCAGTAGA TCTTCAGAAGAAAAAATTTGCATTGAATCATTTCCTCTCAAAGCTATCACAATCTAATCACAGTTCAACAGTATCAGATA TTGATAATGAGGAATCAAAAAAACGGAATGTCGGACAAAGAGTTGTGGTTTCAAGATCAGCATCTGAGTTGGAGCTTATT CTTGGAGCTATGAAGAACTATTGCAAGGCTCGGTTAGGCAGGGGCAGTGTCTCAGCAGCCACTAGGCATTTACATATGCT TGAGGGAATGCGAAAGGAGTTTGCCCATGCAAGGTCTTTAGCATTAGCTCAAGCTCAATATCTACGTGCGCATGATGAAA TAAAGATGGCAGTTTCCCGTTTGCACCTAAGGGCAAATGAGGATGATAAATCTCTTGATGCTTTAGGTGAAAATGAATTA GTTGCGGCTAGTTCAGACTTTTCCCATGAGAAGTATATGTCATTGGCCTTGTTGTCACAGATAAAGGGAAAACTGCGCTA CTTACAGGGTTTGGTGCAGTCCAAGCAAAAACTGTCATTGGAATCTCCAGATAGTTCTTCATTCATTCAAGAGACAACTA AAATATCAAACACTAAGGAAGAGAAGGGTGCGCTCATATCTAAAACTGATGAGGAAACATGCCCAGTTTGCCAAGAAAAG CTAGGCAATCAGAGAATGGTATTTCAGTGTGGGCATTTTACATGCTGTAAATGTTTATTTGCGATGACTGAGCAAAGACT TCAACATAGCAAGACTCATAATTGGGTGATGTGCCCTACATGTCGACAACATACTGATTTTGGAAACATTGCCTATGCTG TTGATGCACATAATGAATCTTCCAATTCTTCAATGCAGCATACAGTTGACAGCTGTGAAAAATGTGAAACATCCATTAGT GTTAAAGGCTCATATGGAACTAAGATTGAAGCCGTCACAAGAAGAATCTTGTCAATAAAGGCTACAGATCATAAAGAAAA AGTTCTTGTATTTTCAAGCTGGAATGATGTACTTGATGTATTGGAACATGCCTTTGCTGCCAACAACATTACCTTCGTCC GGATGAAAGGAGGCAGAAAGGCACAAGTTGCCATCAATCAATTTAGGGGAAAGCAGAATGGCACAAAAGGATGTGAGAAG TCAACACCAAAATCTATTCAAGTATTATTGCTTTTAATCCAACATGGAGCCAATGGCCTCAATCTTTTGGAAGCACAGCA TGTAGTCCTTGTAGAGCCATTGCTCAATCCAGCTGCTGAAGCACAAGCAATCAGCCGTGTACATCGTATTGGACAAAAGA ATAAGACCCTCATTCATCGTTTCATTGTAAAAGACACAGTTGAAGATAGCATATATAAATTGAACAGGAGCAGGAGCAAC CATTCATTCATTAGTGGGAACACAAAAAACCAAGATCAACCTGTTTTGACCCTGAAGGATGTTGAGTCCTTGCTGTCAAG AACACCAGTAACCATGCCAGAAAGTGATGAAAATCCTATTGCAAATGCAGACCTGAGAAACTTTCCACCATCAATGGCTG CGGCTATAGCTGCTGAGAGGAGACTTAATGATCATAGGACATGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0131200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MGRRKSKPRRSGGVILETNATADTEFDKEKVGEAGEEARDNSGDIDEPYFVEVDRSSWLSSEHLDISEVILSDLNLREGF SGFELSEGFYQDPQYSLRFRVCNVNNVLGRIKLGHWPVLPYTDIHLELVKWDTVDNVETCTVLLSGIFDGPDEGVSGLLH LASLKFVTLRTVLGVRLSEDIHSLRIRVEVLKSAFDACESLLEASRQLWKKSMMNVMSWLRPEIMISEVRYGFGNCKKME VDQKTETGDGRKYSRFDPAGFYEAIKPSKSEPMLEDEIPELLPELRPYQRRAAFWMVEREKALKESQGERERNQFHSPLC VPVDFLDTRSKMFFNPFSGNISLCPETPSPYVLGGILADEMGLGKTVELLACIYAHRRSASGSDTLIESVPQVNGDQNIT LKRLKRERVECICGAVNESIKYQGLWVQCDICDAWQHADCVRYSPKGKSLKSKQGSESKTYKTTIAVRDGEYVCQMCSEL IQATESPIASGATLIVCPAPILPQWHDEIIRHTRPGSLKTCIYEGVRDTSFSNTSLMDISDLASADIVITTYDVLKEDLS HDSDRHEGDRHLLRFQKRYPVIPTLLTRIYWWRVCLDEAQMVESNATAATEMALRLHSKHHWCITGTPIQRKLDDLYGLL RFLKVSPFNTYRWWAEVLRDPYEKGDIGAMEFTHTIFKQIMWRSSKKHVADELDLPSQEECLSWLTLSPVEEHFYQRQHE TCVRDAHEVIESLRNDILNRKVPGSESLNDSSDPLITHTEAGKLLNALLKLRQACCHPQVGSSGLRSLQQSPMTMEEILM VLINKTKIEGEEALRRLVVSLNGLAAIATIQQDFSQAALLYNEALTLTEEHSEDFRLDPLLNIHIHHNLAETLPLAENVA LILPSKGKQFSGTSAVKSTRKHFIAKVDRCLVKRQKISGCDDKNLEVASAEPSHIASSLSENDLNEDLKFDDLSASPVKS LIAECEDSKKKYLSVFNSKLSAAQQEFQNSSTQVRNAYRESRTDQNTCWWLEALHHAEQNKDFSTELIRKIEEAISGNSN NSKSSRIAARFRGISSLKYQIQTGLDQLEASRKVLLERLLEIDHTMENPKGEDIERVGKCRNCQPNCDGPPCVLCELDEL FQGYEARLFVLKNERGGIISSAEEAVDLQKKKFALNHFLSKLSQSNHSSTVSDIDNEESKKRNVGQRVVVSRSASELELI LGAMKNYCKARLGRGSVSAATRHLHMLEGMRKEFAHARSLALAQAQYLRAHDEIKMAVSRLHLRANEDDKSLDALGENEL VAASSDFSHEKYMSLALLSQIKGKLRYLQGLVQSKQKLSLESPDSSSFIQETTKISNTKEEKGALISKTDEETCPVCQEK LGNQRMVFQCGHFTCCKCLFAMTEQRLQHSKTHNWVMCPTCRQHTDFGNIAYAVDAHNESSNSSMQHTVDSCEKCETSIS VKGSYGTKIEAVTRRILSIKATDHKEKVLVFSSWNDVLDVLEHAFAANNITFVRMKGGRKAQVAINQFRGKQNGTKGCEK STPKSIQVLLLLIQHGANGLNLLEAQHVVLVEPLLNPAAEAQAISRVHRIGQKNKTLIHRFIVKDTVEDSIYKLNRSRSN HSFISGNTKNQDQPVLTLKDVESLLSRTPVTMPESDENPIANADLRNFPPSMAAAIAAERRLNDHRT
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 44 | 44 | - | – | |
| PANTHER | 3 | 1627 | 1625 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 22 | 44 | 23 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 269 | 679 | 411 | 2.1E-39 | ||
| SMART | 281 | 654 | 374 | 2.5E-18 | ||
| CDD | 285 | 684 | 400 | 7.33991E-94 | – | |
| Pfam | 288 | 780 | 493 | 4.5E-87 | ||
| Gene3D | 349 | 400 | 52 | 4.7E-6 | ||
| Gene3D | 404 | 477 | 74 | 2.0E-11 | ||
| SUPERFAMILY | 407 | 479 | 73 | 1.32E-9 | ||
| SMART | 410 | 478 | 69 | 3.6E-8 | ||
| ProSitePatterns | 411 | 477 | 67 | - | ||
| CDD | 412 | 477 | 66 | 2.27251E-8 | – | |
| Gene3D | 478 | 705 | 228 | 4.8E-32 | ||
| ProSiteProfiles | 483 | 646 | 164 | 9.836 | ||
| SUPERFAMILY | 686 | 1640 | 955 | 1.38E-34 | ||
| Gene3D | 1339 | 1420 | 82 | 5.6E-8 | ||
| SUPERFAMILY | 1349 | 1406 | 58 | 2.26E-10 | – | |
| SMART | 1354 | 1401 | 48 | 1.6E-4 | ||
| ProSiteProfiles | 1354 | 1402 | 49 | 10.94 | ||
| Gene3D | 1421 | 1641 | 221 | 1.6E-40 | – | |
| CDD | 1445 | 1582 | 138 | 5.88541E-37 | – | |
| ProSiteProfiles | 1451 | 1622 | 172 | 9.065 | ||
| Pfam | 1452 | 1571 | 120 | 3.4E-6 | ||
| SMART | 1479 | 1571 | 93 | 1.8E-4 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0131200.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…