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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0138200 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0138200.4 |
| Related isoforms 5 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | DIS3-like exonuclease 2; TAIR: AT2G17510.1 ribonuclease II family protein; Swiss-Prot: sp|Q9SHL7|RP44A_ARATH Exosome complex exonuclease RRP44 homolog A; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2R0N8|A0A0B2R0N8_GLYSO Exosome complex exonuclease RRP44; Found in the gene: LotjaGi4g1v0138200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:20529555..20554784) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGCTTCACAACAAGTCCTTTGTTAAGAAAACCAAAGGTGGCAAAGTTTTGAAGGTGCACTGTTCTATCTCTTAAACCAA ACCCTAATTCAACTACATCTTTCTTTTCACTTTATTTAATAGTTTGTTTAATTTTTTTTTTTAATGTTTGGGAGCAGCAA GTAAGGGAGCACTATTTGCGAGATGATATATACTGCGGTGCTCCGTTTTGCACGGCTTGTGATTCCTCTGGTGCTCGCCT CGGTGCTTCGGCTTCCACGATTCTTGTTCTCGACACCAATGTTGTTCTCAACCAGGTTTGGTTTTTTTTTTTGCATTGGT TTTTGATTTGGATTGGTTATCTGTGCGGCAATGAAGTAGTGTTTATTTGAGTTGGAATACATGCTGTTATCATGGCAGAT TGATTTGCTGGAGAATCCAGCCATTGATGATGTTGTTGTGTTGTCTATTGTGCTGGAAGAGGTTAAGAACAAGAATATGT CTGTGTATAACCGGTTAAGAGCTATCTGTAGCAATTCCATGAGGAAATTCTTTGTTTTTTCCAATGAATACCACAGGTAG GTTCTTTTGTTCTTTATTCTGTTTTGTTCTTATGGTTAACTTCTTTGTATTTATGATGAAAATTTATATTACAATAGCAG CATGCAAGGAAAACTAGAAATTTTACTTTACAAAGATTAGTGAAAATCTAAGGATGCAGCAAGTCTGCTCAATCTCTTTG TACCCGATGGGATGCAAGATAAAGAGCACTTGTTGAAAGCTTATTTAGTGCGTTTTCTAGTAGATAAGCTCCAATAAGCC TGTATCCAAACGCGTTCTTTGTTGCATATCCAAAATATAACTCAACCCCAAGCAAGCTTAGGGGCAGTCAATTGACCCTA AACATATGAGCATTATGCTCTTCACACCCATGAAAAAGACTGCAAAGAATACATCTACAAATGTTCTGTTTCCTTGTTTT 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CCAGCATTGGAGGCCATATTTGCTGGGAAGGAAGTTCATTGTGTCCACGGATCAGAAGAGCTTAAAGGAATTGTTGCACC AAACCGTGGTGACATGTGGCCAACAGAATTGGGCTGCCAAATTGCTGGGGTATAATTTTGAAATTGTGTACAAGCCCGGG AAACTAAATAGAGGGGCAGATGCACTATCACGAGTAGAGGAAGACAAGGGGGAATTGCAGGCCATAACTACCTACCCACA GTGGGCAGAACAAACACTCATTGCAGCAGAAATTGCAGCTGATGCACAACTCACCAAGGTTATCAAAGATCTGCAGCAGG GAACAGGGGATCACCCTGGGTACAAAGTTCATCAGGGAATCTTGCTTTATCAGGATCGACTGGTTTTACCAAAGTCCTCT ACACTCATACCCAAGATGCTGCACGAGTTCCACACCACCCCGCACGGTGGCCACTCGGGGTTTCTCCGCACTTATCGACG CTTGGCAGCCAATTTGTACTGGAAGGGAATGAAAAATGACATACAGGAATTTGTGCGCGCGTGTGACACCTGCCAACGTA ACAAGTATATGGCAACAGCACCTGCGGGTCTCTTACAACCGTTACCAATTCCAGAAAAGGTGTGGGAAGACATTTCCCTT GACTTCATCACAGGGCTACCAAGGTCAAAAGGATTCGAGGCTATCTTGGTGGTGGTTGATCGACTGTCAAAGTATTCACA TTTCATTCCTTTGAAACACCCATATACGGCTCGAAGCATCGCTGAATTGTTTGCCAAGGAGATCGTGCGTCTACATGGTA TTCCCGCCTCAATTGTGAGCGACCGCGATCCGCTGTTCATGAGCAATTTCTGGAAGGAGATTTTCCGACTGCAGGGAACA CAATTGAGGATGAGCTCGGCGTATCACCCTGAGTCTGATGGACAAACGGAGGTGGTAAATCGTTGTCTGGAAACGTACTT ACGGTGTTTCTCCGCCGATCAGCCAAAAGCATGGGCCACCTGGCTCCATTGGGCTGAGTACTGGTTCAACACCACGTTTC ATTCAGCAACTCAACAAACCCCTTTCGAGGTGGTCTATGGACGAAAGCCACCAGTTCTAGTACGATGGGCTCTTGGGGAA ACGCGTGTGGAGGCTGTGCAAAAAGAATTAGCAGACCGAGATGAAGCATTACGCCAATTGAAGGTTCACTTGGCCAAGGC TCAAGATAGAATGCAAACCCAGGCGAATACCAAGAGGGTGGATAAATCGTTTACTATCGGGGAGTGGGTGTTTGTCAAAC TCCGAGCACGCCGACAGAATTCTGTGGTCACACGAGTGCAACCCAAGTTGGCTGCGCGCTATTATGGGCCTTATCCTATA GAAGCCAGAATTGGAGCAGTAGCTTATCGCTTGAAGCTTCCACCGGCTTCGCGGGTGCACCCTGTTTTCCATATCTCGGT GCTTAAGAAAGCAATTGGCAACTATGAAGTGGAGCCTGAATTACCTGATCACTTGGAAGGAGAGACTCAACCCGTGGTCC ACCCTGAAGCAGTGTTGGCTACTCGTTTGATTTCAAAGCATGGGGTGGAGGTTCCGCAGGTGCTCATCAAATGGGAGCAG GGCAAGACAGAGGAAGCCACATGGGAAGACGTTCTGACAATTCAAAGCCAATTTCCAGAATTTCACCTTGAGGGCAAGGA TGCAGAATCAGAAGGGGGCATTGTTAGGACTGGTTCTGCAAATGGGCCAGAGGATGCATTGATTCATTATGGACCAAGTG GGCCAAGGGTTTGGAGAGTTTATTCTAGAAGGGGTAGGAAGGGAATAGCAGGGTAGATGGTTAACAGAATGGAGAGAGAG TGAGAAAGGTTGCAACGTCATACTATAAGGAGAATAGAGAGAGGTTGAGAGGTTATCGAATCTTTTGAGCTAATTTGAGT CATGGAAAGGAAGCTGTAGCTTCCTTAGGAGCAGTGCTCTGGTCAGGATTGGAATACCATTCCTTCTCTGTAATTTTCCC TTTCACACATTAATAAGCCATCTACGTTGAGTCCTTTGGTGTTTTTCCTGACTGTTTACTTGTTGGGATTTAGCATCCTA ACAGACAACAATACGTGTATACGTCTCACAGACGTTTATAACTACCTATCTGGTTATGCTCTATGCCATTTCTTTTTTAA ATTGAGTACTGGATCATTGAAAGAGCATTTCGATTTAATTTTTATGATACATAAGACCATAACTTAATAGCTTCAAGCGG ATCTACAACCCATTTATTATTTACCATGTTGAATCCTGTTCATGCTTAGTTTGACCTACTAGTCTGTTCAAGTGTTGGTA CTGCCTTGGTCCCCAGACCCTAGAGTGTTGGCGTCTCTCCTATCTTCTAAGATGCACAATGCAGAAAGTTCATATGCATT TCTATTGGTTATTTGTTATTCTTCCTTTATTCATATGATATCTATTCTGTCTTTAACAATGTGATTAGAATATTCTCTTC GCATAATTGCTCTTGAACTTCTTACATATGTTCAGGAAATGACACCAGAAGCAGACATTATTTCCAGCAGATACACAAAA AGTGTCATAAAATCCTGTGCAGCACTGTCTTATGTTGAAGCACAAGCGAGGATGGATGATAGGTGGGCTTTTATTTCTCC TTGGATGCTTTATGTTGATATGAATTGACTTGTCTTTAATTTTGTAATATTATTTAAAGCTAGGACTGAAGAAAAAAAAG TAGGTAACGTGACATATGTTTCTCTTCTGGGATTGTGGTATCCCAGCGTATATTCCTGCTACAATTGCTAGTGAAATAGC TGTACTGACCCAATTGATTTTTGCAAAATAAACAAAAAGGTAAGACAGAGGATTGTATTCTGACAGCTATCAAACAAAAA CCCACGCTAAATGACTGGGCACATGTTTATGCCAACAATTCGAACTGATTGTTGAAATATCACCTATGCTTTCTTGTTCA ACTTTTTGTGTTAACATGATAATTTATTTTGTTGCCCCTAGGGGTTAGGCATCGTGTTGAAATGACTAATTGTTTCTTCT AGTCTATTAATGTATGCAATTTCTGTTTGGTGAAGATGTTTGGTCACTGTATTGTGTGTTCTCTTTGTACAGTCGATTGA TGGATCCGGTAACTACAGATTTGAGGAATATGAATAGTTTAGCCAAGGTATGGATTTTTGGATGCACATTTATTATTTAC TGAGATAATTATAACTATGGTTTTATTTACATGCTCTTTAATGAAATTGTCTGAAAAGTAAATCTCTGTTTATGATCCAT CAGAAAATGAGATTAAGACGTATTGACAACGGAGCTTTGACACTTGCATCTGCTGAAGTTAAATTTCAAATTGACACAGA GACTCATGACCCCCTTGATATTGGTATAATTTTCTTAACTCTTAATGTCATTTGGTATTTCTTTTTGAGGTCGTGGAAGA TGGGATTTTTTTTGTTATTCATCATTTCACTATTGAAATGTATGTCTTTTTTTCCTTTCAATCTTGTCAAATAGCCAATT ATCCCAAAAACTCAAGCTGTTGGGTACGGGTCAAATGAATGGCTTTATATCATAGTCTAACAAATCCAATCCCTAAAATT TCAGTAGTAATTTATTTGCTTTCTCTTAAGTATGTTTCCTATATTTAAATTGGGAACTTTTTTGGAGAGAGATTGAGGTT AATGATATACATTTTTAATTGCTTTTAGCTATTCATTCATGAAAGGAGAAGGGAAAGTCAGTTCCTCCTTTTTTTAAAAA TTAATTATTTTGTTTGCTTTTATTTGCAGGCATGTACCAAATCCGAGAAGCCAACCAAATGGTGGAGGAGTTTATGCTTG CTGCTAATGTTTCTGTTGCACAACAAATTCTTAGAAGTTTTCCTTTGTGCTCATTATTAAGGTTATTTTCTTATCTGGAA CTTTAACTTTTATCATTATAATGGTGTTTTACTAGGATGAGGGAAACAGTATTGATCATATGAAGAGTTATTTTCATAAA TTTTATGTAAGGACATGAGTCTGTGAACTTTGGTAGATAGACTTAACATTAGAGAGAAGGATAAAAAATTACTCCTACTC CCAAAATATGAGAATCTGATGTAAAATAAGCATTGAAGAGTATGACTATTGACATAACATGGACAATGCACAGACCCACC TACCATGTGCTGAAATTCAACTTTTTTTTATTAGAGGAATTGGGCGGCAAGGATCGAAATCTAGACCGCTTGGTCATAGA GGCTTTAATACCATGTCAAGAACCAATTATCCCAAAAGCTTAAGCTGTTGGGTAAAGGACTCCGAATGGTTTATATTATA TTTCTAACAGCTATTTTGGTAATTGTTTGTTGGATCTTGTGTAGGCGTCATCCAATTCCAACTAGAGAGATGCTTGAACC CTTTCTAAGAATTGCTACTGCGGTTGGCCTGCACTTGGATGTTTCATCATCGAAAGCATTGGCTGATTCCCTTGACCATG CTGTGGTAAATATTTTTGTATTGTTTTCCATTGACAATATAATGATTTATGGATAGTGTTATTATATATAAATAATGATG TAATGGGATCTGTATATTGTGGACCAAAAATAATTGAGCAAATTGCTAACCTCCCCTGATGTTTATCATCATTGTACTGA CCTCCCCTGTTGTTTATCATTATTGCCCTGACCTCTCCCATCTATGATTTAACCAGATACTAACTGCCATTATTTTATTG GGGACATTGCACTTACCTCTCTCGAGGTTTATCTTTATTACACTGACCTCCCTTAAGATTTATTATTAGAACAATCAACA TCCCTCTATCATTCTAAATGGTCTATAAGGAAGGGGGGTCAGTGAAATTTGTAAAATAGAGGAGAGATTAATGCAATGAT GATAAACCTCAGGGGTGGTCAGTGCAATTTGCCCAAAATAATTTGGTCCATGGGTGCACCAAGGGTATAACTGGTAATGC ATACACAATTATTACACATGCTTCAAACCGCCTTCCCTCCGTGCTCTGTCCCCCCCCCCCCCCCGACCACAATGCCGTCC TCTGTTGGCCATGGACCCGTTTTGCCCTTTACCACATTTTTCCTTCTCATTCCTCAGTGGGTGCTACAGGGCTCCATGAC CGCAGCTGTAACAAACGACATTGGTTTGTCAGCCAGATGTCTTCATCACCATTTGTCAGCAATAAAACCCCCTTTTCCCA TGCTCACCACACTCTTTCTTGAGTACCACCGCTAGCCATCGCGTCATCGTTTTTTTTCCCACTGCACACGATCACAAACT GCTGATCATTCCATTGCGAGCTTCCATGGCTGTGTTTCTATATGCCTTGCCATTCATTCAAGTCACTGCAGTACAACAGA TCTTGACCCCCGTGTTTTCTGGAATGCAGCGCCAACCTTAACGATGCCTACGCCTACCCACCGACTTCTACTTCGAACTG ACAACAAATATTCTGTTACCTTCGCTGCTGTCGACTTTCACCTTCGAGAAATTATTCCTGGAATCTTGATCCCAGTGTTA AAATCATGAGCCTACCTCATTAGTGTACTGGCAGACCAAATTATTTTTGGTCCACCCTTGATATAATAGCTTATGTTGCA ACATCTTTAATGATTGACTTTTAATACCTTACACATTGCTAGCTCAAACATTAGGTTTTGAAGGCCTTCATTTCTTTTCA ATTTCTGTTTCTCTTATGCCATGTACTTTTTCAGGGTGATGATCCATACTTCAACAAGTTAATCCGTATTATGGCAACTA GATGCATGACTCAGGTAATTGAATTTGAATGAGAACCCAGATTTACAGTTTATAAGCGAATATTAATTTTTTGTTTTGCT TTTTAGGCAGTTTATTTCTGTAGTGGGGATCTTAGCCCTCCAGAATATCATCATTATGGACTTGCAGCTCCTTTGTACAC CCATTTCACTTCACCTATAAGAAGATATGCGGGTAGGCATGTTATGATTTAATGTTTACTTGGTCAATTGTGCACGATAA TATGTTTTAGTTTTTTTTTTTTTCCTTGTAGATGTCATTGTGCACAGGCTACTTGCTGCTTCTTTAGGAATATCCAAGTT ACCATCTGTATTTCAGGACAGGCTCCAGCTGACTAGTATTGCAGACAGTATGAAATCTCTTTCATGATCTATTAGAACTT GGTCTTTTTTTCTTTTCCTTATGGAAGTTTTCTCGTGGTTAACTATATTCATCATGAATAAATTAGTACATTTTTCTTCA CTGGTCTTATTCATTGGATGTGAAATATTTAAAATCATAATAACGCTTTTCACTCAATGTGGTTTAGATTTAAATTATCG GCACAGGAATGCTCAAATGGCTGGGAGGGCCTCTATAGAGCTGCACACACTTATTTATTTCCGTAAAAGGTTTGCGACAT AACTTCCCCTCCCTGTTACTGTTAATGTTTTCTATCTATATGCACTTTGCAGCTTATTCTGGAGGTTGTTTATCTTCATT CATGCAGGCCAACAGATACGGAGGCAAGGATAGTGAAAATAAGATCTAATGGATTTTTTGTGTTTGTTCCCAAGTAATGT ATCTTATCCTTTTTCTTTTTCCTTTTTTAGTTTGGTTTTTCATATGACCAATGAAAAGGTGAATAAGGATGACAAACAAT AAAGAAAAAAAAAAGAATGTTTTGATTTATTCTAGCTAGTAGATGGTTATCTTGGAAAAATTCAATCGTTTAAGCAGCTA TTAGATGTCTTTCTACTTTGACTGAGGTTGTCATTTATAGCTTGTGCGTGAACATTTTTTTCTGCCCACAGATACGGCAT AGAAGGACCTGTATATTTGACAACACGAGCTGAAAAGGGAAATGGAGACTGGTATGTTGATGAGCAAGAGCAGAAGATTA AAAAGATGGATGGAAGCGTTTCATATAGCATTTTGCAGTCAGTCCAAATTCACATGGAGGTTGTGGAGCCCCAGCCTAAC AGGCCAAAACTTCAGCTTACTCTCATCTAG
CDS sequence (LotjaGi4g1v0138200.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCTTCACAACAAGTCCTTTGTTAAGAAAACCAAAGGTGGCAAAGTTTTGAAGCAAGTAAGGGAGCACTATTTGCGAGA TGATATATACTGCGGTGCTCCGTTTTGCACGGCTTGTGATTCCTCTGGTGCTCGCCTCGGTGCTTCGGCTTCCACGATTC TTGTTCTCGACACCAATGTTGTTCTCAACCAGATTGATTTGCTGGAGAATCCAGCCATTGATGATGTTGTTGTGTTGTCT ATTGTGCTGGAAGAGGTTAAGAACAAGAATATGTCTGTGTATAACCGGTTAAGAGCTATCTGTAGCAATTCCATGAGGAA ATTCTTTGTTTTTTCCAATGAATACCACAGGGATACGTATGTTAAGGAAATGAGTGGGGAGACTAAAAATGATAGGAATG ATAGAGCTATCCGGGTGGCTACTCAGTGGTATCAGAATCATCTTGGTGGTGCAGTGAAGGTTTTGCTTATAACTAATGAT AGAGAGAACAAACGGAAAGCTAGTGAAGAGGGGATTTGTGCAGAAACAGTTGAGTCATATGTCAAATCTTTGGACCGAAC CGATCTACTTGACTTACTGGTGCGGCCTACGTCTGAAGATGTAGACATGGAAGAGGTTGAAGATCTCAGACCATCCAAGA GGAAAGTAATCTATTCGGAGCATAAGCCGATGTCAGAAATTACTTCCGGTTTGCATCGTGGAATCTATCATCAAGGGAAA CTTCGTGTAAACCGTTACAATCCATTTGAAGCATATGTTGGCAGTGAGAGCATTGGTGATGAAATAATCATTTATGGGCG CTCAAATATGAATCGAGCTTTTGATGGTGATATTGTGGCAGTTGAACTTCTGCCACAGGACCAGTGGCATGAAGAAAAGT CTCTATCTATTCGCGGTGAAGAAGATGAGGATGACGACGAAGATGTTCATCTAGCTCCAAATAGTGCTGATGATGCACCG AGAACTATTCCCCAACAAGGTTCTACTGGAGGAATCAATGCAGTGTGCAATCGGCCATCTGGTGTTGTAGTGGGCATTAT AAAGAGAAACTGGCATTCGTATTGTGGATCTCTGGAGCCAATGCCTCTGCCTGCAGGGAGTGGTGGTGTTGCTTATGCCT TGTTTGTTTCCAAAGATCGTAGAATTCCCAAAATTCGACTCCAAACCCGCCAACTTGAAAACCTGTTGGATAAGAGGATT ATTGTGGCAGTTGATTCTTGGGATCGCCAATCTCGTTATCCATCAGGCCATTATGTGCGAACTATAGGAGATATCGGTGA TAGAGATACTGAGAGCGAGGTGGTATTGATAGAAAATGATATCAACACAAGACCGTTCTCTTCACAAGTGCTAGCATGCT TGCCACCATTGCCATGGTCTGTCTCTTCTGAGGATTTCTCCAAACCAATTAGGCAGGATTTGCGTCATCTACGTGTCTTC AGTGTGGACCCTCCAGGCTGCACGGATATTGATGATGCACTCCACTGTTATGCTCTTCCAAATGGAAACTTTGAAGTTGG AGTTCATATTGCTGATGTGACAAATTTTGTACATCCTGGAACTCCTCTTGATGATGAAGCTTCTCAGAGGGGAACATCGG TCTACCTTGTTGAGCGACGGATAGACATGCTTCCGAAACCTCTTACAGAGGACATATGTTCTCTTCGGTCTGATGTGGAA AGGCTAGCATTCTCTGTCATATGGGAAATGACACCAGAAGCAGACATTATTTCCAGCAGATACACAAAAAGTGTCATAAA ATCCTGTGCAGCACTGTCTTATGTTGAAGCACAAGCGAGGATGGATGATAGTCGATTGATGGATCCGGTAACTACAGATT TGAGGAATATGAATAGTTTAGCCAAGAAAATGAGATTAAGACGTATTGACAACGGAGCTTTGACACTTGCATCTGCTGAA GTTAAATTTCAAATTGACACAGAGACTCATGACCCCCTTGATATTGGCATGTACCAAATCCGAGAAGCCAACCAAATGGT GGAGGAGTTTATGCTTGCTGCTAATGTTTCTGTTGCACAACAAATTCTTAGAAGTTTTCCTTTGTGCTCATTATTAAGGC GTCATCCAATTCCAACTAGAGAGATGCTTGAACCCTTTCTAAGAATTGCTACTGCGGTTGGCCTGCACTTGGATGTTTCA TCATCGAAAGCATTGGCTGATTCCCTTGACCATGCTGTGGGTGATGATCCATACTTCAACAAGTTAATCCGTATTATGGC AACTAGATGCATGACTCAGGCAGTTTATTTCTGTAGTGGGGATCTTAGCCCTCCAGAATATCATCATTATGGACTTGCAG CTCCTTTGTACACCCATTTCACTTCACCTATAAGAAGATATGCGGATGTCATTGTGCACAGGCTACTTGCTGCTTCTTTA GGAATATCCAAGTTACCATCTGTATTTCAGGACAGGCTCCAGCTGACTAGTATTGCAGACAATTTAAATTATCGGCACAG GAATGCTCAAATGGCTGGGAGGGCCTCTATAGAGCTGCACACACTTATTTATTTCCGTAAAAGGCCAACAGATACGGAGG CAAGGATAGTGAAAATAAGATCTAATGGATTTTTTGTGTTTGTTCCCAAATACGGCATAGAAGGACCTGTATATTTGACA ACACGAGCTGAAAAGGGAAATGGAGACTGGTATGTTGATGAGCAAGAGCAGAAGATTAAAAAGATGGATGGAAGCGTTTC ATATAGCATTTTGCAGTCAGTCCAAATTCACATGGAGGTTGTGGAGCCCCAGCCTAACAGGCCAAAACTTCAGCTTACTC TCATCTAG
Protein sequence (LotjaGi4g1v0138200.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MLHNKSFVKKTKGGKVLKQVREHYLRDDIYCGAPFCTACDSSGARLGASASTILVLDTNVVLNQIDLLENPAIDDVVVLS IVLEEVKNKNMSVYNRLRAICSNSMRKFFVFSNEYHRDTYVKEMSGETKNDRNDRAIRVATQWYQNHLGGAVKVLLITND RENKRKASEEGICAETVESYVKSLDRTDLLDLLVRPTSEDVDMEEVEDLRPSKRKVIYSEHKPMSEITSGLHRGIYHQGK LRVNRYNPFEAYVGSESIGDEIIIYGRSNMNRAFDGDIVAVELLPQDQWHEEKSLSIRGEEDEDDDEDVHLAPNSADDAP RTIPQQGSTGGINAVCNRPSGVVVGIIKRNWHSYCGSLEPMPLPAGSGGVAYALFVSKDRRIPKIRLQTRQLENLLDKRI IVAVDSWDRQSRYPSGHYVRTIGDIGDRDTESEVVLIENDINTRPFSSQVLACLPPLPWSVSSEDFSKPIRQDLRHLRVF SVDPPGCTDIDDALHCYALPNGNFEVGVHIADVTNFVHPGTPLDDEASQRGTSVYLVERRIDMLPKPLTEDICSLRSDVE RLAFSVIWEMTPEADIISSRYTKSVIKSCAALSYVEAQARMDDSRLMDPVTTDLRNMNSLAKKMRLRRIDNGALTLASAE VKFQIDTETHDPLDIGMYQIREANQMVEEFMLAANVSVAQQILRSFPLCSLLRRHPIPTREMLEPFLRIATAVGLHLDVS SSKALADSLDHAVGDDPYFNKLIRIMATRCMTQAVYFCSGDLSPPEYHHYGLAAPLYTHFTSPIRRYADVIVHRLLAASL GISKLPSVFQDRLQLTSIADNLNYRHRNAQMAGRASIELHTLIYFRKRPTDTEARIVKIRSNGFFVFVPKYGIEGPVYLT TRAEKGNGDWYVDEQEQKIKKMDGSVSYSILQSVQIHMEVVEPQPNRPKLQLTLI
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 6 | 934 | 929 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 6 | 934 | 929 | 0.0 | – | |
| CDD | 9 | 180 | 172 | 5.1244E-85 | – | |
| Gene3D | 9 | 192 | 184 | 1.7E-68 | – | |
| SMART | 52 | 165 | 114 | 2.9E-20 | ||
| SUPERFAMILY | 53 | 186 | 134 | 3.73E-13 | ||
| Pfam | 54 | 177 | 124 | 5.1E-15 | ||
| Gene3D | 206 | 314 | 109 | 9.3E-31 | – | |
| SUPERFAMILY | 215 | 423 | 209 | 8.57E-42 | ||
| Pfam | 219 | 310 | 92 | 1.6E-13 | ||
| MobiDBLite | 296 | 331 | 36 | - | – | |
| Gene3D | 351 | 426 | 76 | 2.3E-28 | – | |
| Pfam | 372 | 440 | 69 | 2.5E-18 | ||
| SUPERFAMILY | 429 | 847 | 419 | 4.45E-130 | ||
| SMART | 471 | 802 | 332 | 9.7E-138 | ||
| Pfam | 471 | 800 | 330 | 1.6E-95 | ||
| ProSitePatterns | 769 | 793 | 25 | - | ||
| SUPERFAMILY | 851 | 931 | 81 | 3.94E-12 | ||
| Pfam | 851 | 921 | 71 | 2.5E-8 | ||
| Gene3D | 851 | 935 | 85 | 1.3E-7 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | RNA binding | Interacting selectively and non-covalently with an RNA molecule or a portion thereof. | ||
| Molecular function | Ribonuclease activity | Catalysis of the hydrolysis of phosphodiester bonds in chains of RNA. |
Expression pattern of LotjaGi4g1v0138200.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…