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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0198600 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0198600.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | DNA helicase; TAIR: AT4G32700.2 MUS308 and mammalian DNA polymerase-like protein; Swiss-Prot: sp|Q588V7|TEB_ARATH Helicase and polymerase-containing protein TEBICHI; TrEMBL-Plants: tr|K7M6P7|K7M6P7_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0198600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:41764309..41801739) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GCCAAACCCAAATCCCTAATATCAGCAACCAAGCACACCCCCCCGCTCCCCGAAAATTTTCAATTTCAATTTCTAGCCAT CAGGCAGCGCCACTCCAATAGTGCGAACAAACTGCTTCGTGCGCTCTCTCTTTCAAATTGGCGCTGGACGCGATGATTCA GAGGATCATGTGACGCCGTAACGCATGATTCTCACGACGAAGAACAAAGACCCAGACATCTTGCTTCACACTATCAACAC CTCTCTTCTATCATGGCTTCTTCTTCGCCTCGGAACCGAATCAATCAGGTCCTTCTCTACTTCCATTCCGAGTTTCCAAA CCCTAGACGATGCATTTCACTCCCACATCGCACTCCCACATTTTGAATGGAAACCTAAACGATCTATGCCAAAAGGGAAC GGAAAAAATGACAGCTTTTGAATGTCACTGCTTAATTGAGGTTTTATGATTCTTGTTGTTCATTTTTTATGATTTTTTTT TCTGACTTGCTTTGTTGTATTTTGTTGCCATTGCATACAGTTTTATGCTTCCAAGAAAAGGAAAGCAGTTTCACCTGTTC CTAAAGTTGGGAGATTTGAAAAAGGTGCAAGGCATGGGGTTGATGGGTCTCCAAGTGCTAAAGGCACTTTGGATAGTTAC TTGGTTGGGTCCCCGGATGACTGCAATGATGTTGGGCGACTGAATGCGGCTGCTTCCGGTTCAGTTAAGAGAAATTTGGC ATCAGAGATTACCAGTTCTCTTGACTATGGACTTGATAAGCAGCCTATTCCATCAGCTCACGGGCATCAGAACCCTCAAG CTACTAAGCCAGGTGTCGTTAATGAAGTGCCTAAGGCGAGTTGTGATTCGCTTGAAGACGCTATCCCGGGAAACAGCTTC AGTGGTTTTGAACATGGTGCCAAAAACTCAGAGCTTAAACAGTTTGTAGCAGACTGTGTGTCGATCTATTGCGGGTACTT 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TATGTTGATATTGTTTCCTCTTTCTCCCCTTCCCAGGGATCTGCTGCAGACATAATTAAGATTGCAATGGTAAAAATTTA CTCTGCAATTGTCCCTGAAGCTGAAAGCCCGGGTTCCAGTTCTACGGTTTCAGCTAAGTTCCACATGCTTAGAGATCGTT GCCGGATTTTATTACAGGTTAATTTCAAAGGATTTGTATTCTTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTTCTTTCGAATTTTCAATA ATTTTAGTAATTGTTAACTAGGTACACGATGAACTAGTGCTGGAAGTTGATCCTTCTGTTATAACAGAAGCTACCCTACT GTTACAGACAAGCATGGAGAATGCAGTCTCACTTCTTGGTTTGTATTCCACAGGATTTATTACTGTTATTATTGGGAGAA ATTGAGGTTCTTCTTGTTTTCTAAAATAACATATTCACTATTTATATTTATGCTTCTGCAGTTCCTCTGCATGTGAAACT TAAGGTTGGAAGAACATGGGGATCTTTGGAGCCGTTTGCACCTGATAAATATAAGAATGACACTGAATCCTGAAGCCCAA AAATTTCTTTTTGTTCATGGCAGAGTCCTCGTTGAGTAAAAGCAAAATGAGTTTCACTGCCTAGCAAGTGGCTACACTGA TATCATCTAAAATTCATTACGACCATTTTTTATGTACAGGATATTGAAATAAAAGTTTGGTGATTTGTATATATTCATTT CGATTATGGAGATGTAAGGCCGAAAACGACGTACATGATTAACTCTCCCCATAAACCGGTTCAATCAAATTGTAATGTAA ACTTAAATAAGGTTACATTTGTTAATTAGTTTGTTTGAAATTATTATTTCATACGATTTTGTATTGATCTGCCAATGTAC CAAAGTTTAAAAACAAAAATGTTAAAAAAAATGTTTGTTTTCTCTCACTGGTTTTGGTGGCACTGATGCCTTACATTTGG CAGCCACATTGCCCTCTCGCTTCCTGAAATGTAAATTAAGATGCAAGCAAACCAACCCCTATTTTAGCATCTTTAACTTT TGATTATTCCTTGAGTTTATAGTGGTCTAACCTACCTCAAAGGGTATATGATGCTTTGTTTGTTGACTCATCTCTTGCAG AAGTTTGATATTCATGCCGAGTTTTTTACTTAAAAAAGATAAGAAATGATCATAAACCTGATTGTGTAGATTGGGTGAGC TGCGTTGAAATATGTTGCATTCGCATCTTATAATTCATCCTCCTCGATCAGTGGATTGCTAGAATGTGTAGTGTTGGCAC CAATGTTGTTGGTGTGTGCATGCCACGCACCCGGCTTTACCGTTGTTGCCCGCTAATCCTGCAGGATTGGTGCCTCCTAT GTTACTGGCTCAACCATGGGTGCTATTGGCTATACCTAGACATAGTCCCCTGGTTGTCATGCTTGAAGGTTCCTATGTTC ATCAGTGTCGTGGAGCCTATGGTCTCCATGGTCTCTCTAAACCCTAAACCACACAAATCGTTGATGCCAAAAACACTTGT TGTTCTTTTGTTATAGTTGTCTGCATTTTAGCTAATGTATTGTGTGTGCCAAGATGTCGGAGAAGATGTTGTAACTTCGT GCTATGACATTTGTCACTGGAAAACATTTTGTTACTTGGCAGATTGTGTGAAGCTTTGTATTGATTACGTTATTGATCGA TCCATTTTTTGTAGCGGCATATAGTTGCATTATAGGGAACTAACATCTGACCCTATGTTGTCGAATTAAACGATGATTTT AAATTACCATGTTTTGTAATTGAATTTCAATAGCATGCTTTTCTCTTTTATACGTGGTAATTGCATGGAGTTAACCCTTT CTGTTTGTGTAACGTCCCGATTTTCAGGGGTTACGGTAACAATCTGATAAAGTAAATATGCAATGTTTTTC
CDS sequence (LotjaGi1g1v0198600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTTCTTCTTCGCCTCGGAACCGAATCAATCAGTTTTATGCTTCCAAGAAAAGGAAAGCAGTTTCACCTGTTCCTAA AGTTGGGAGATTTGAAAAAGGTGCAAGGCATGGGGTTGATGGGTCTCCAAGTGCTAAAGGCACTTTGGATAGTTACTTGG TTGGGTCCCCGGATGACTGCAATGATGTTGGGCGACTGAATGCGGCTGCTTCCGGTTCAGTTAAGAGAAATTTGGCATCA GAGATTACCAGTTCTCTTGACTATGGACTTGATAAGCAGCCTATTCCATCAGCTCACGGGCATCAGAACCCTCAAGCTAC TAAGCCAGGTGTCGTTAATGAAGTGCCTAAGGCGAGTTGTGATTCGCTTGAAGACGCTATCCCGGGAAACAGCTTCAGTG GTTTTGAACATGGTGCCAAAAACTCAGAGCTTAAACAGTTTGTAGCAGACTGTGTGTCGATCTATTGCGGTGAATTACGC CCAAGAATAAGTTCACCATCAGAGATGAAAGTGGATGGCCACAAGAGAGATGATTCACTGATGTCAGTAGAGGAAATTAG TAATACTATGGGAGATGGTTCACAACAGAAGTGTAATGACTCTAGTGAGCCACATGTTGGTGGTGAAAACATTTCCAATG ACAAGATGCCTGATGAAGTCATGGCAGGTGTTGTTGGTAATACTACAGGAGATGTTTCTGCCTGTTCTGCGAAGGATTCT GGTGATGGTGATGCTATTGCCCTTGACATGAGCCTGAGAAAATGTAGTTATACTAATACACCAAAAGCATCTAAGAGTAT GGCTGAATGCTATACACCAGGATCTTTGATTGTTAAAGCATGTATTAAGGACACTCCAAAGTCAACTCGCGGAAGCTCAA TGTTTTCACCTGGAGAGGCTTTCTGGAATGAAGCAATTCAACTTGCTGATGGTTTGTGTGTCCCCGTGGTTAATGATTCT TCTAAAGTTATAGAAGAAAGTAATGTGGCAGAAGACCAAGCTGAGGTGAAAAACTCCTGCAACTTACAAAATTATGATGG CAAGCAAAGGAAAGTGCTGGATCAAAGTAAAAGCAGGATTTGGGATAGGGAAATGAGCACTCCTTTAGGGTTGGCTAGGA TGCACACACAAGAATCTATTAAAGAAGCGTCCGGCCTTCCTGTTAAGCATTTTGATTTTTCGTTTGAGGACAAGAATTTG GATGAAAATACCCGGCAGAATTGTTGTGTTGATGACCTGGTCAATGTTGCTTGTGGAGCTGGCAGACAGTATGAATCTGG TTCTATCACAGGGCATGCATATGAAAAGATGAATGAAGTGCAAGAAAAGGCTTCAGTAGATGCATTAGGCAAGAGACTGT GTCAGGATAATGCTAGTATGACGTCTAATTCACCCCCTAATCAGGTCATGACAGCAATCGGTAGACATGCATCTGATGAA GCTAGTACTCCTTCAAGTAGCGTGAAACTAAATGATCATTTAGACCTAAGTAGCTGGCTTCCACCTGAAATATGCAGCAT ATATAGAAAGAAAGGAATTTCAAAGCTTTATAGTTGGCAGGTTGACTGCCTGCGGGTGAATGGTGTCCTACAGAGAAGAA ATCTTGTATATTGTGCTTCTACAAGTGCAGGTAAGAGTTTTGTTGCTGAGATTTTAATGCTGCGGAGAGTGATAACAACT GGAAAAATGGCAGTGCTTGTTCTTCCATATGTATCAATTTGTGCTGAAAAGGCAGAACACCTTGAACAGCTTCTTGAGCC ACTTGGTAAACATGTTCGTAGTTATTATGGAAATCAAGGTGGCGGGACACTTCCTAAAGATACTTCTGTAGCTGTCTGCA CTATAGAGAAGGCCAACTCATTAATTAATAGATTACTGGAAGAGGGCCGCCTTTCGGAAATGGGAATTATTGTGATAGAT GAACTGCATATGGTTGGTGATCAGAGTAGAGGTTATCTTCTCGAACTTATGTTGACAAAGCTTCGTTATGCAGCAGGGGA AGGTAGTACAAAATCGAGTGATGGAGAGAGTTCAGGTGGAAGCAGCGAAAAGGCTGATCCTATTCAAGGTCTGCAAATAG TTGGAATGAGTGCAACAATGCCAAACGTTGCAGCAGTTGCTGATTGGCTTCAAGCAGCACTGTACCAGACAGAGTTCCGG CCAGTTCCTTTAGAAGAATATTTTAAAGTTGGTAATTCAATATATAACAAGAGTATGGAACTTTCTAGAACAATCTCAAA AGGAGCTGACCTTGGTGGTAAAGATCCAGATCACGTTGTTGAACTATGTAATGAGGTAGTTCAAGAGGGACAATCAGTTT TAATTTTTTGCTCCAGCCGAAAGGGTTGTGAATCAACTGCAAAGCATGTTGCGAAGTTCCTTAAGAGGTTTACTTCTGAT ATTAATGAGAAAGATTGTGAGTTTGCTGATATTACTTCTGCTATTAACTCCTTGAGAAAGTGCCCTGCCGGGTTGGACCC CATATTAGAGGAAACGCTTCCAGCTGGTGTTGCATTTCACCATGCTGGACTTACGGTTGAGGAAAGAGAGATTGTTGAAA CCTGTTACCGAAAAGGGCTTTTACGTGTTTTAACTGCCACTTCGACCCTAGCAGCTGGGGTTAATCTACCCGCTAGGAGG GTAATTTTCCGCCAACCGAGAATCGGTTGTGAATTTTTAGATGGAACAAGGTACAAGCAGATGGCTGGGCGTGCAGGTCG AACTGGAATTGATACAAAAGGAGAAAGTATACTCATCTGCAAAGCTGAAGAGACAAAAAAAGTTATGGGACTTCTTAATG AAAGCTGTCCCCCGTTGCATTCCTGTTTATCTGAAGATATGAATGGAATGACTCATGCAATCTTAGAAGTGGTGGCTGGA GGAATTGTTCAAACTGCTAGTGATATTCACCGGTATGTTAGATGTACTCTTTTGAACTCCACAAAACCATTTCTTGACGT GGTGAAGTCTGCACAAGAGTCCCTTCGATGGTTGTGCCAAAGAAAATTTCTTGAATGGAATGAAGAGACGAAACTGTACA GTACCACACCTCTTGGACGTGCAGCTTTTGGCAGTTCTCTCTGTCCAGAAGAATCACTTATTGTTTTAGCCGATCTTTCG AGGGCAAGGGAAGGATTTGTGCTCGCATCAGATTTGCATTTAGTTTACTTGGTGACACCAATCAATGTTGATGTTGAGCC AGATTGGGAATTGTACTATGAGCGTTTTGTGAAATTGTCTCCTATTGATCAGTCAGTTGGTAATCGAGTGGGTGTGACCG AACCATTCCTGATGCGTATGGCACATGGTGCACCGTTACGTTCTTCAAACAAGTCCAGAAATAATACAAGATGGTTGAAC AATAAACGACAAAATCAACTTGGGATTTCCAATGGATCAAACAACTCCGATGATCAAACACTTCGTGTTTGTAGAAGATT CTATGTTGCTCTCATTTTGTCACTTCTAGTTCAGGAAACCTCTGTGGGTGAGGTTTGCGAAGCATTTAAAGTTGCCAGAG GAATGGTTCAAGCCTTGCAAGAGAATGCTGGTAGGTTTGCATCTATGGTTTCTGTGTTCTGTGAGAGGCTTGGGTGGCAT GATCTTGAAGGCTTAGTTGCTAAGTTTCAAAATCGTGTATCATTTGGAGTTAGGGCAGAGATTGTAGAGCTTACCACCAT TCCCTATGTTAAAGGCTCTCGAGCCAGAGCACTCTACAAAGCAGGCCTACGTACGCCTCTTGCAATTGCTGAAGCATCCA TTCCTGAAATAGTAAAAGCACTTTTTGAATCTTCATCATGGGCCACCGAAGGTTCTGCACGGAGGAGCGTACAATTTGGT GCTGCAAAGAAGATAAAGAATGGTGCTCGCAAGATAGTTCTTGATAAAGCTGAAGAGGCAAGGGTTGCTGCTTTTGAAGC CTTTAAGTCTCTTGGATATAATGTCCCACAGTTTGCTCCCCCAATATTGTCCACTGCTGCATGCGATTCTATCAGGCTAG AACCTGAAAGTACCTCTGGAAGGGACACAGCCGATACTAGTCTTAGCTTTGTTGATGCAAACCACGTTGATAAATCTTAT AAGTTTGCTTTCAAAAAAGAAAAAGAAGATTTGATTAAATCTTCTGAAAATGATGCTCTTGCTTCTGTTGAAGGAAAATC AAGCAGGGTGATGCCATGTAGCTTGTCTACTGTTCCAGTCGTAGGACCTACAAAGAATGAGCTCAATGCGACTTTGGACC CTTCCAAAGATCCCGATGTGACAATCCTTTCTGTTGAATTACAGAAAACAAATGATAAATCCAGTAAAGATGATGGATGC CATACTTGTGGTACAGAGGAGAAACATCAGAGTAGAATTTTCGCTGAGGCTAATGTCGATAGTTCCAGCCAGAAAGGCCC CATTAATGCAGTTAGTAGTCCTGGAGGGCTTGATTCATTTTTGGATCTGTGGGACACTAAGCCAGAGTTCTACTTTGATA TCCATTACATTAAACGATTGGAATTGCACACTAGTGCCCCTTTTGAAGTAAATGGCATAGCAGTCTGTTGGGAAAACTCC CCTGTGTACTACCTTAATCTTCCCAGGGATATTCTGTTGTCTGCCAATGGAAAAGATGACTGTGTTTCCTTGACTGCATG CAGTTTTAGGCAGAAGCTTTCATCTTCTAATTCTAAGCAAGATTTGGCTCATGCTATGTCTAGATGGAGCAGGATTAGTA AAATAATAGGGAAAAGTAATGTCAGAAAGTTCACCTGGAATTTGAAGATTCAGATTCAGGTGCTGAAAAAGCCTGCAGTT TCAGTTCAGAGATTTGGTTGCTTGAACACTCTTGGAAAAGTAATGGACCTTGAAGTTGTAGATAATTCTTACATATTATT GCCCCCGATCTTTGTTAAAGATGCAATTGACATGTGCATTGTGGCTTGGATTCTGTGGCCAGATGAAGAGAGGAGTTCTA ATCCAAACTTGGATAAGGAGGTAAAGAGACGGTTATCCTCTGAAGATGCTGCAGCAGCTAATCAGTGTGGCAGGTGGAGG AATCAGATGCGGAGAGCTGCTCATAATGGTTGTTGTCGTCGGGTTGCTCAAACACGGTCGTTATGTTCTGTTCTTTGGAA ATTACTTGTTTCTGAGGAACTTCTTGAAGTGCTTATGGGAATAGAAATCCCATTGGTGAATGTCCTTGCTGACATGGAGC TTTGGGGAATTGGTGTTGATTTGGAGAGATGCATTCAGGCTCGTAAGTTGTTGGTAAAAAGGCTGAAGCATCTTGAGAAG GAAGCTTATAAACTGGCTGGGATGACATTTTCATTACATACGCCAGCGGATATTGCTAAGGTGCTCTTTGATCACTTGAA GTTGCCCATACCTGATGGGCGAAATAAGGGAAAACATCATCCAAGTACGGACAAGCACTGTTTGGATGCACTAAGGCATG AACATCCCATTGTTCCAATCATCAAAGAGCATCGAACAATGGCAAAGCTCTTGAACTCTACCCTAGGATCAATTTGTTCT CTGGCTAGACTTTCTGTAAATACACAAAAATACACATTACATGGTCATTGGCTCCAGACATCCACCGCAACTGGTCGGCT TTCAATGGAGGAACCTAATCTTCAGTGTGTTGAGCATACAGTGGAATTCAAAATGAAAGCGAATGAAAATGGAGGTGATG TTCTTGAGAATCATTGCAGAATTAATGCCCGTGACTTCTTTGTCCCTACTCAGGACAACCGGTTACTGTTAACAGCAGAT TATTCTCAGATAGAATTGAGGTTGATGGCACACTTCTCTAAAGACTCCTCGCTTGTTGAACTTCTCAGTAAGCCTGATGG AGATGTCTTCAAAATGATAGCAGCAAGATGGATTGGGTGTCCTGAGGTTTCTGTGAATTCTCAACAGAGAGACCAAACAA AAAGGATGGTGTATGGCATTCTTTATGGTATGGGTGCCAATAGCCTTGCTGAACAACTGGATTGCACCTCGGATGAAGCT GCTGAAAAGATTGCGAACTTCAAAAGCTCTTTTCCTGGTGTTGCTTCCTGGCTTCATGAAGCTGTTGCATTTTGTCGTAG TAAAGGATACGTGAAGACTCTTAAGGGAAGAAAACGATTTTTGTCAAAAATAAAATTGGGCAGCGGTTCGGAAAAATCAA AAGCTCAGAGGCAAGCTGTGAATTCCATATGTCAGGGATCTGCTGCAGACATAATTAAGATTGCAATGGTAAAAATTTAC TCTGCAATTGTCCCTGAAGCTGAAAGCCCGGGTTCCAGTTCTACGGTTTCAGCTAAGTTCCACATGCTTAGAGATCGTTG CCGGATTTTATTACAGGTACACGATGAACTAGTGCTGGAAGTTGATCCTTCTGTTATAACAGAAGCTACCCTACTGTTAC AGACAAGCATGGAGAATGCAGTCTCACTTCTTGTTCCTCTGCATGTGAAACTTAAGGTTGGAAGAACATGGGGATCTTTG GAGCCGTTTGCACCTGATAAATATAAGAATGACACTGAATCCTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0198600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MASSSPRNRINQFYASKKRKAVSPVPKVGRFEKGARHGVDGSPSAKGTLDSYLVGSPDDCNDVGRLNAAASGSVKRNLAS EITSSLDYGLDKQPIPSAHGHQNPQATKPGVVNEVPKASCDSLEDAIPGNSFSGFEHGAKNSELKQFVADCVSIYCGELR PRISSPSEMKVDGHKRDDSLMSVEEISNTMGDGSQQKCNDSSEPHVGGENISNDKMPDEVMAGVVGNTTGDVSACSAKDS GDGDAIALDMSLRKCSYTNTPKASKSMAECYTPGSLIVKACIKDTPKSTRGSSMFSPGEAFWNEAIQLADGLCVPVVNDS SKVIEESNVAEDQAEVKNSCNLQNYDGKQRKVLDQSKSRIWDREMSTPLGLARMHTQESIKEASGLPVKHFDFSFEDKNL DENTRQNCCVDDLVNVACGAGRQYESGSITGHAYEKMNEVQEKASVDALGKRLCQDNASMTSNSPPNQVMTAIGRHASDE ASTPSSSVKLNDHLDLSSWLPPEICSIYRKKGISKLYSWQVDCLRVNGVLQRRNLVYCASTSAGKSFVAEILMLRRVITT GKMAVLVLPYVSICAEKAEHLEQLLEPLGKHVRSYYGNQGGGTLPKDTSVAVCTIEKANSLINRLLEEGRLSEMGIIVID ELHMVGDQSRGYLLELMLTKLRYAAGEGSTKSSDGESSGGSSEKADPIQGLQIVGMSATMPNVAAVADWLQAALYQTEFR PVPLEEYFKVGNSIYNKSMELSRTISKGADLGGKDPDHVVELCNEVVQEGQSVLIFCSSRKGCESTAKHVAKFLKRFTSD INEKDCEFADITSAINSLRKCPAGLDPILEETLPAGVAFHHAGLTVEEREIVETCYRKGLLRVLTATSTLAAGVNLPARR VIFRQPRIGCEFLDGTRYKQMAGRAGRTGIDTKGESILICKAEETKKVMGLLNESCPPLHSCLSEDMNGMTHAILEVVAG GIVQTASDIHRYVRCTLLNSTKPFLDVVKSAQESLRWLCQRKFLEWNEETKLYSTTPLGRAAFGSSLCPEESLIVLADLS RAREGFVLASDLHLVYLVTPINVDVEPDWELYYERFVKLSPIDQSVGNRVGVTEPFLMRMAHGAPLRSSNKSRNNTRWLN NKRQNQLGISNGSNNSDDQTLRVCRRFYVALILSLLVQETSVGEVCEAFKVARGMVQALQENAGRFASMVSVFCERLGWH DLEGLVAKFQNRVSFGVRAEIVELTTIPYVKGSRARALYKAGLRTPLAIAEASIPEIVKALFESSSWATEGSARRSVQFG AAKKIKNGARKIVLDKAEEARVAAFEAFKSLGYNVPQFAPPILSTAACDSIRLEPESTSGRDTADTSLSFVDANHVDKSY KFAFKKEKEDLIKSSENDALASVEGKSSRVMPCSLSTVPVVGPTKNELNATLDPSKDPDVTILSVELQKTNDKSSKDDGC HTCGTEEKHQSRIFAEANVDSSSQKGPINAVSSPGGLDSFLDLWDTKPEFYFDIHYIKRLELHTSAPFEVNGIAVCWENS PVYYLNLPRDILLSANGKDDCVSLTACSFRQKLSSSNSKQDLAHAMSRWSRISKIIGKSNVRKFTWNLKIQIQVLKKPAV SVQRFGCLNTLGKVMDLEVVDNSYILLPPIFVKDAIDMCIVAWILWPDEERSSNPNLDKEVKRRLSSEDAAAANQCGRWR NQMRRAAHNGCCRRVAQTRSLCSVLWKLLVSEELLEVLMGIEIPLVNVLADMELWGIGVDLERCIQARKLLVKRLKHLEK EAYKLAGMTFSLHTPADIAKVLFDHLKLPIPDGRNKGKHHPSTDKHCLDALRHEHPIVPIIKEHRTMAKLLNSTLGSICS LARLSVNTQKYTLHGHWLQTSTATGRLSMEEPNLQCVEHTVEFKMKANENGGDVLENHCRINARDFFVPTQDNRLLLTAD YSQIELRLMAHFSKDSSLVELLSKPDGDVFKMIAARWIGCPEVSVNSQQRDQTKRMVYGILYGMGANSLAEQLDCTSDEA AEKIANFKSSFPGVASWLHEAVAFCRSKGYVKTLKGRKRFLSKIKLGSGSEKSKAQRQAVNSICQGSAADIIKIAMVKIY SAIVPEAESPGSSSTVSAKFHMLRDRCRILLQVHDELVLEVDPSVITEATLLLQTSMENAVSLLVPLHVKLKVGRTWGSL EPFAPDKYKNDTES
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 50 | 50 | - | – | |
| MobiDBLite | 90 | 111 | 22 | - | – | |
| MobiDBLite | 189 | 208 | 20 | - | – | |
| MobiDBLite | 189 | 216 | 28 | - | – | |
| Gene3D | 499 | 721 | 223 | 1.1E-50 | – | |
| CDD | 500 | 721 | 222 | 1.35245E-100 | – | |
| SMART | 512 | 727 | 216 | 1.4E-14 | ||
| ProSiteProfiles | 526 | 718 | 193 | 17.645 | ||
| PANTHER | 527 | 2164 | 1638 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 527 | 2164 | 1638 | 0.0 | ||
| SUPERFAMILY | 529 | 922 | 394 | 5.55E-42 | ||
| Pfam | 529 | 702 | 174 | 3.9E-16 | ||
| MobiDBLite | 667 | 686 | 20 | - | – | |
| MobiDBLite | 670 | 685 | 16 | - | – | |
| CDD | 720 | 921 | 202 | 1.89163E-60 | – | |
| Gene3D | 731 | 930 | 200 | 2.8E-60 | – | |
| Pfam | 758 | 909 | 152 | 8.0E-9 | ||
| ProSiteProfiles | 758 | 951 | 194 | 13.103 | ||
| SMART | 827 | 909 | 83 | 5.0E-16 | ||
| Gene3D | 1096 | 1240 | 145 | 1.5E-20 | – | |
| SUPERFAMILY | 1137 | 1254 | 118 | 1.05E-35 | – | |
| Gene3D | 1469 | 1733 | 265 | 6.6E-28 | ||
| SUPERFAMILY | 1714 | 2160 | 447 | 4.67E-109 | ||
| Gene3D | 1735 | 1851 | 117 | 2.6E-22 | – | |
| CDD | 1736 | 2160 | 425 | 3.05793E-165 | – | |
| Coils | 1741 | 1761 | 21 | - | – | |
| Pfam | 1744 | 2158 | 415 | 2.4E-116 | ||
| PRINTS | 1853 | 1875 | 23 | 1.2E-25 | ||
| Gene3D | 1862 | 2157 | 296 | 1.0E-91 | – | |
| SMART | 1900 | 2125 | 226 | 2.6E-67 | ||
| Gene3D | 1924 | 2068 | 145 | 1.0E-91 | – | |
| PRINTS | 1970 | 1995 | 26 | 1.2E-25 | ||
| PRINTS | 2007 | 2018 | 12 | 1.2E-25 | ||
| PRINTS | 2029 | 2040 | 12 | 1.2E-25 | ||
| PRINTS | 2108 | 2121 | 14 | 1.2E-25 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Nucleic acid binding | Interacting selectively and non-covalently with any nucleic acid. | ||
| Molecular function | DNA binding | Any molecular function by which a gene product interacts selectively and non-covalently with DNA (deoxyribonucleic acid). | ||
| Molecular function | DNA-directed DNA polymerase activity | Catalysis of the reaction: deoxynucleoside triphosphate + DNA(n) = diphosphate + DNA(n+1); the synthesis of DNA from deoxyribonucleotide triphosphates in the presence of a DNA template and a 3'hydroxyl group. | ||
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Biological process | DNA replication | The cellular metabolic process in which a cell duplicates one or more molecules of DNA. DNA replication begins when specific sequences, known as origins of replication, are recognized and bound by initiation proteins, and ends when the original DNA molecule has been completely duplicated and the copies topologically separated. The unit of replication usually corresponds to the genome of the cell, an organelle, or a virus. The template for replication can either be an existing DNA molecule or RNA. | ||
| Biological process | DNA-dependent DNA replication | A DNA replication process that uses parental DNA as a template for the DNA-dependent DNA polymerases that synthesize the new strands. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0198600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…