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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0529500 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0529500.2 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Histone-lysine N-methyltransferase; TAIR: AT1G05830.1 trithorax-like protein 2; Swiss-Prot: sp|P0CB22|ATX2_ARATH Histone-lysine N-methyltransferase ATX2; TrEMBL-Plants: tr|A0A151TCT2|A0A151TCT2_CAJCA Histone-lysine N-methyltransferase ATX2; Found in the gene: LotjaGi1g1v0529500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:105622284..105654909) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AATTCACTTCAATACCTTTCACGTGCTGATAGTGTCACCACATTCATGCTCCAATCTGATATCTCACTTTCAATTGTGAT TGATAATTGATAATTGATTTTTCAGTTCAAACCATAACAAAAACAGCACCACCCTCCTTTCTTTGATTCTGAACTTGCAA GTTTGAACACACAAGAGAGTGAGAGAGTGATAGTGCGGGAAACAGATTAATTTGGTGAATAACTCTCCTCCCTCCAAAAC GCAATAATCCACTTTTTTTCATTCTTCTATTTTCTCTCTCCCTCTCTTTCTCTCTCTGAAAAACCCTAACATTCTCGAAT TTCTCTCTCTTCATTCATCCATGGCATTCCTCTCTCCTCAATCCCAAGAACAAGGAGGCGCCACCGTCGCCGTCGCCGTC GCCGCCACCGGCGAAGAAGACACCAACATCGATATCCACACCACGCGTGGCACCCCCATTCGCTACCTCCCCCTCGATCA CCTCTACTCCTCCACCTCACCTTGCAGTGGCTCCACCATGTCCAAAAAGGTCAAGGCTCACCGCAAACTCGAACCCGCAA TCAGCAGCGACGACATCAGTACCACCACAACCAGCAGCAATAGCGACGACGGTGACCCGCCGCTCGAGAAACCGGCGTCG GATGCTCTGAAGCCACCTCTTATCTATGTCTACTATCGCCGACGTAAGAGGCGTCCGTCGCCAACGACGCCGTCGAGGGA GAATGGGGTTTCTGAGAGTAAGGTGCTGAAGAGGAGGAAAATTGGGACCGCTGAGTTGGAGAAATTGGGGGTGGATTTGA ACGGTGTTAGGAACCACCTTGACGGGCCGAGATTGAGGGAATGTCGCACTCAAATTGGGAATTCTGGTACTGGCAACAAC AGTAGCAACACCAAGTGTGGTGGTGGTGGTGCTTCCTTGGAGAATTTTCCTAAGCTGATTCCTGAATCTCGCACTGCGAA 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0529500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCATTCCTCTCTCCTCAATCCCAAGAACAAGGAGGCGCCACCGTCGCCGTCGCCGTCGCCGCCACCGGCGAAGAAGA CACCAACATCGATATCCACACCACGCGTGGCACCCCCATTCGCTACCTCCCCCTCGATCACCTCTACTCCTCCACCTCAC CTTGCAGTGGCTCCACCATGTCCAAAAAGGTCAAGGCTCACCGCAAACTCGAACCCGCAATCAGCAGCGACGACATCAGT ACCACCACAACCAGCAGCAATAGCGACGACGGTGACCCGCCGCTCGAGAAACCGGCGTCGGATGCTCTGAAGCCACCTCT TATCTATGTCTACTATCGCCGACGTAAGAGGCGTCCGTCGCCAACGACGCCGTCGAGGGAGAATGGGGTTTCTGAGAGTA AGGTGCTGAAGAGGAGGAAAATTGGGACCGCTGAGTTGGAGAAATTGGGGGTGGATTTGAACGGTGTTAGGAACCACCTT GACGGGCCGAGATTGAGGGAATGTCGCACTCAAATTGGGAATTCTGGTACTGGCAACAACAGTAGCAACACCAAGTGTGG TGGTGGTGGTGCTTCCTTGGAGAATTTTCCTAAGCTGATTCCTGAATCTCGCACTGCGAAGAAATGGGTCACGTTGAGTT TTGATAATGCTGATCCTGAGGCATTTGTTGGGTTGCGATGCAAGGTTCATTGGCCCATGGATTTAAAATCGTATGCTGGC TATGTCAAAGGTTATGATATAGAAGCCAAGATACATCATATCAAGTATGATGATGGTGAGGAGGAAAATTTAATTCTTTC AAATGAAAATGTAAAATTCCATGTTTCCCGTGACGAGATGAAGCATTTAAAATTGAGCTATGCCAAAGTTCGTGACAGTA ATGTCTCTGATTATGATGTTGAAGAGATGCTTGCACTGGCTGCAAGTTTGGATGATTGTCAAGACTTTGAGCCCGGGGAT ATCATATGGGCCAAGCTAACAGGCCATGCAATGTGGCCAGCTGTTGTTCTGGATGAATCACTTGCTAGCAACTGTAGGGG TTTAAGAATGTTTATAGGAGGAAGATCGGTTCCTGTCCAATTTTTTGGCACCCATGACTTTGCAAGGGTTAGATTGCAAC AGGTGAAATCATTTCTTAGTGGACTTCTTACTGATCTACACTCAAAGTGCAAAAAACTTAGTTTTATTGAAGGATTAGAA GAGGCAAAAAGGTATTTAAGTCAACAGAAGCTTCCCTTGGAGATGCTAGAATTGCAGAAAAGATGTACAGCTGATGAATA TAACAATGTAAGTGGAGAAGATGGAGGATGTACAGATTCTGGTGAAGATTGTTTAAATGATAAAGGAACTTGCGCATCAC TTCAAAACATCGAAACTTTTCCTTATGAAGTAGGAGCAGACTTGCAGATTCTAAGACTTGGAAAAATAGTTGAAGGTAGT GCATCTTTTGGAGATGGAAGATCCATCTGGCCTGAAGGGTACACAGCAGTGAGAAAGTTTATGTCACTTACTGATCCTAA AGTATCTGTCCCTTATAAGATGGAGGTGCTGAGAGATCCAGAATCCAAATTCCGACCTCTATTTAGAGTGACAGTTGATG GTGGTGAGCAGTTCAATGATTGTACACCATCTGCTTGCTGGAATCAAGTATACAAAAGGATAAAGAAAATGGAAAAGGAT ATCTGCAATGGTTCTGTTGCTGAAGGCGGGATTGAAAGGGGCTATGAATCTGGGTCTGATATGTTTGGGTTCTCCAATCC TAGAGTGGCTAAACTTATACAGGGATTATCTAAATCTAAAGTCTCTTCGAAGAACTCAAAGTGCAAGTTAGGTTCCAGAA GTTATAATGGCTTGCCTGTTGGTTATAGACAGGTTCATATTAATTGGTTTGATCTTGATAAGTGCAATGTGTGCCACATG GATGAGGAGTACGAGAACAATCTGTTTCTGCAGTGTGACAAATGCAGAATGATGGTCCATGCTAGATGCTACGGAGTACT GGAACCTGTTAATGGAGTACTATGGTTGTGTAACTTGTGTCGTTCGGGTGCTCCTCCCCCACCTTGTTGCTTATGCCCCC TCATAGGTGGTGCCATGAAGCCTACGACTGATGGCCGATGGGCTCATTTGGCTTGTGCCATGTGGATACCTGAAACTTGC TTAGCTGATATCAAGAGAATGGAGCCTATTGATGGTTTGAGTAGAATTAGTAAGGACCGCTGGAAGTTGTTATGCAGTAT ATGTGGTGTATCATATGGTGCCTGCATCCAATGTTCAAACAGTTCATGTCGGGTAGCTTATCATCCACTCTGTGCTCGTG CTGCTGGTCTCTGTGTTGAGCTTGAGGATGAGGACAGACTCTATCTACTTTCTGTTGATGATGATGAAGATCAGTGCATT CGCTTACTTTCTTACTGCAAGAAACATAGGCAGCCATCTCATGAACCATCTGGTGCTGATGAACGCATTGTTCGAGTTGT GGCTCCGTGCTCAGACTATGAACCACCACCCAATGCATCTGGTTGTGCTCGAAGTGAGCCATATGATTACTTTGGAAGGA GGGGCCGAAAAGAACCTGAAGCACTTGCAGCTGCATCTTTGAAACGTTTGTTTGTAGAGAATCAATCTTACTTAGTTGGT GGACTCTGCCAGCATGGATTGCTAAACAACCCAGAGCCTTCTGGCAGAGGAGTTTGCCCTAAATTCTTTTGTAGCCAACA AAGGCTGAGAACCTCTCTGATTGACTCTTCAAACAGCATACTTTCTACTGCTGAGAAATATAAGTACATGAGGGAAACCT TTCGGAAACAGCTAGCGTTTGGGAAATCAAGAATTCATGGATTTGGCATCTTTGCAAAGCATCCATATAAAGGCGGAGAC ATGGTGATTGAATATACCGGTGAACTTGTTCGACCTACTATAGCTGACCGCAGAGAGCACTTTATATACAATTCTTTGGT GGGTGCTGGAACATACATGTTTCGGATTGACGATGAACGAGTCATCGATGCTACTAGAGCCGGAAGCATTGCTCATTTAA TTAATCATTCTTGTGCACCAAATTGCTATTCAAGAGTTGTAAGTGTTGATGGCGATGAACATATTATAATATTTGCAAAG AGGGACATTAAACAATGGGAAGAGCTTACATATGATTACAGATTTTTCTCAATTGACGAACGACTTCCTTGTTACTGTGG CTTCCCAAAATGCCGAGGTGTAGTAAATGATACTGAGGCAGAAGAGCGAGCTGCTACCCTATTTGCACCACGGAGTGAAT TAATAGATTGGACAGGAGAATGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0529500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAFLSPQSQEQGGATVAVAVAATGEEDTNIDIHTTRGTPIRYLPLDHLYSSTSPCSGSTMSKKVKAHRKLEPAISSDDIS TTTTSSNSDDGDPPLEKPASDALKPPLIYVYYRRRKRRPSPTTPSRENGVSESKVLKRRKIGTAELEKLGVDLNGVRNHL DGPRLRECRTQIGNSGTGNNSSNTKCGGGGASLENFPKLIPESRTAKKWVTLSFDNADPEAFVGLRCKVHWPMDLKSYAG YVKGYDIEAKIHHIKYDDGEEENLILSNENVKFHVSRDEMKHLKLSYAKVRDSNVSDYDVEEMLALAASLDDCQDFEPGD IIWAKLTGHAMWPAVVLDESLASNCRGLRMFIGGRSVPVQFFGTHDFARVRLQQVKSFLSGLLTDLHSKCKKLSFIEGLE EAKRYLSQQKLPLEMLELQKRCTADEYNNVSGEDGGCTDSGEDCLNDKGTCASLQNIETFPYEVGADLQILRLGKIVEGS ASFGDGRSIWPEGYTAVRKFMSLTDPKVSVPYKMEVLRDPESKFRPLFRVTVDGGEQFNDCTPSACWNQVYKRIKKMEKD ICNGSVAEGGIERGYESGSDMFGFSNPRVAKLIQGLSKSKVSSKNSKCKLGSRSYNGLPVGYRQVHINWFDLDKCNVCHM DEEYENNLFLQCDKCRMMVHARCYGVLEPVNGVLWLCNLCRSGAPPPPCCLCPLIGGAMKPTTDGRWAHLACAMWIPETC LADIKRMEPIDGLSRISKDRWKLLCSICGVSYGACIQCSNSSCRVAYHPLCARAAGLCVELEDEDRLYLLSVDDDEDQCI RLLSYCKKHRQPSHEPSGADERIVRVVAPCSDYEPPPNASGCARSEPYDYFGRRGRKEPEALAAASLKRLFVENQSYLVG GLCQHGLLNNPEPSGRGVCPKFFCSQQRLRTSLIDSSNSILSTAEKYKYMRETFRKQLAFGKSRIHGFGIFAKHPYKGGD MVIEYTGELVRPTIADRREHFIYNSLVGAGTYMFRIDDERVIDATRAGSIAHLINHSCAPNCYSRVVSVDGDEHIIIFAK RDIKQWEELTYDYRFFSIDERLPCYCGFPKCRGVVNDTEAEERAATLFAPRSELIDWTGE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 28 | 1100 | 1073 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 28 | 1100 | 1073 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 53 | 136 | 84 | - | – | |
| MobiDBLite | 75 | 91 | 17 | - | – | |
| Gene3D | 306 | 420 | 115 | 5.4E-19 | – | |
| SUPERFAMILY | 312 | 413 | 102 | 9.53E-21 | – | |
| SMART | 316 | 379 | 64 | 3.0E-7 | ||
| Pfam | 316 | 406 | 91 | 1.1E-13 | ||
| ProSiteProfiles | 318 | 381 | 64 | 14.039 | ||
| ProSiteProfiles | 460 | 519 | 60 | 23.572 | ||
| Gene3D | 460 | 602 | 143 | 2.2E-27 | – | |
| Pfam | 467 | 516 | 50 | 5.4E-12 | ||
| SMART | 475 | 519 | 45 | 1.8E-7 | ||
| ProSiteProfiles | 523 | 609 | 87 | 21.362 | ||
| Pfam | 525 | 600 | 76 | 4.1E-11 | ||
| SMART | 527 | 616 | 90 | 6.0E-11 | ||
| Gene3D | 624 | 685 | 62 | 8.3E-10 | ||
| SUPERFAMILY | 627 | 696 | 70 | 7.97E-11 | ||
| ProSiteProfiles | 632 | 683 | 52 | 8.867 | ||
| CDD | 634 | 680 | 47 | 1.38957E-25 | ||
| SMART | 634 | 681 | 48 | 1.3E-6 | ||
| ProSitePatterns | 635 | 680 | 46 | - | ||
| Pfam | 646 | 681 | 36 | 3.0E-12 | – | |
| ProSiteProfiles | 686 | 810 | 125 | 35.923 | ||
| Gene3D | 686 | 812 | 127 | 7.2E-24 | ||
| Pfam | 688 | 809 | 122 | 1.1E-33 | – | |
| CDD | 695 | 809 | 115 | 1.12356E-60 | ||
| SMART | 744 | 810 | 67 | 0.029 | ||
| Gene3D | 897 | 1087 | 191 | 1.1E-49 | – | |
| SUPERFAMILY | 934 | 1073 | 140 | 7.85E-44 | – | |
| ProSiteProfiles | 936 | 1054 | 119 | 16.759 | ||
| SMART | 936 | 1060 | 125 | 4.8E-33 | ||
| Pfam | 947 | 1053 | 107 | 4.9E-16 | ||
| ProSiteProfiles | 1060 | 1076 | 17 | 9.79 | ||
| SMART | 1060 | 1076 | 17 | 7.3E-4 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). | ||
| Cellular component | Nucleus | A membrane-bounded organelle of eukaryotic cells in which chromosomes are housed and replicated. In most cells, the nucleus contains all of the cell's chromosomes except the organellar chromosomes, and is the site of RNA synthesis and processing. In some species, or in specialized cell types, RNA metabolism or DNA replication may be absent. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0529500.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…