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LotjaGi2g1v0459200.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0459200
Transcript ID LotjaGi2g1v0459200.1
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Serine/threonine-protein kinase; TAIR: AT1G50030.1 target of rapamycin; Swiss-Prot: sp|Q9FR53|TOR_ARATH Serine/threonine-protein kinase TOR; TrEMBL-Plants: tr|I1LFQ6|I1LFQ6_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0459200
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:95265424..95310480) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CACCTTTTAAGTGGGTGAAAAGAAAGAGTGAAATTAGATGAGATTAACCATTACCTTTATTTAATTAATCCACTACATTT TGATTTTGATTTTGATTTCTTTGATATTTTGAACACACATGACTGACTCGGTTTTCGATGAAGGATACGACAATTGAAAA CGCATTAAGGGCAAACCCGGACGGACATGAAATAAAATTTGGGGTTAAATTGGCTGGGAATGGGATCGTAATGAAATAGC TCTGCTTGGGATTGGGAAAGACACAAGAAGTTGGTCGTCTGAGTCTCAGGCATGGCGATACGCGATGTCTGAGCTGCTAC TTGTTCTTCATTACGAATTGAGGTTGTATTATTATTATTATTAGTATTAGGGCTTAGATTAAGTTAGGTTTGCCACAAAT GGCCGCAGTGGTTCAGTCCCATCCCCACCGCTATATCGGCCCTCCGTCCGTCGGCCCCAGCCCCGGCGATGCTCTCAACC GCATCCTCGCCGACCTCTGCACTCGTGGCAACCCCAAGGTACTGTACTGTCATGCTTCAATTGAAATTTAGTTGCATCAC TTCACTCTTGTCATTTTCCATTTGCTTCAACCACGCAGGAGGGTGCTTCTCTAGCTTTCAAGAAGCACCTAGAGGAGGAA GCTCGTGACCTTAGCGGTGAAGCCTTTTCCCGGTTCATGGATCAGCTGTATGACCGTATCTCGAGTCTTTTGGAGAGCAC CGATGTTGGTGAGAATCTCGGAGCTCTCAGGGCCATTGATGAGTTGATTGATGTCACGCTTGGGGAGAATGCTTCCAAGG TTTCCAGATTTTCAAGTTACATGCGTACTGTTTTTGAGGCCAAACGTGATCCCGAGATTCTTGTTCATGCTAGCACCGTG CTCGGCCACCTTGCCAGAGCTGGCGGAGCTATGACCGCCGATGAAGTTGAACGCCAGGTTACTCGCTGCACCTTGTCTCT 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CDS sequence (LotjaGi2g1v0459200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

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Protein sequence (LotjaGi2g1v0459200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MAAVVQSHPHRYIGPPSVGPSPGDALNRILADLCTRGNPKEGASLAFKKHLEEEARDLSGEAFSRFMDQLYDRISSLLES TDVGENLGALRAIDELIDVTLGENASKVSRFSSYMRTVFEAKRDPEILVHASTVLGHLARAGGAMTADEVERQVKIALEW LRGTRVEYRRFAAVLILKEMAENASTVFNVHVPEFVDAIWVALRDPALPVRERAVDALRACLRVIEKRETRWRVQWYYRM FEATQDGLGKNAPVHSIHGSLLAVGELLRNTGEFMMSRYREVAEIVLRYLDHRDRLVRLSITSLLPRIAHFLRDRFVTNY LSMDFLQICMNHILSVLKVPQDRDSGFIALGEMAGALDGELVHYLPTIITHLREAIAPRRNKPSLEALTCVGSIAKAMGP AMESHVRGLLDIMFSTGLSTVLVDTLEQISISIPSLLPTIQDRLLDNISMILSKSHYNLGRLTQSMGRAATINAPQQFSE LSGSALMQVALQTLARFNFKGHDLLEFARESVVVYLDDEDGATRKDAALCCCKLIAHSVSGLACAHFGSSRLTRSGGKRR RLVEELVEKLLISAVADADVTVRHSIFTALLGDRGFDEYLAQADNLSAVFAALNDEDFDVREYAISLAGRLSEKNPAYVL PALRRYLIQLLTYLEQSADSKCKEESAKLVGCLIRNCERLILPYIAPIHKALVARLTDVNANTGIISGVLVTVGDLARVG GFAMRQYIPELMPLIVDALLDGSSVSKREVAVATLGQVVQSTGYVITPYNEYPQLLGLLLKLLNGELVWSTRREVLKVLG IMGALDPHLHKRNQKTLPGPHGEVARPASDSSQQIQSMDEFPMDLWPSFASSDDYYSTVAINSLMRILRDPSLASYHLKV VGSLMFIFKSMGLGCVPYLPKVLPDLFHTVRTCEDSLKDFITWKLGTLVSIVRQHVRKYLPDLLSLIAEFWSSFTLPAPA RPALGYPVLHLVEQLCLALNDEFRTYLPVILPGCIHVISDAERCNDYTYVLDVLHTLEVFGGTLDEHMHLLLPALIRLFK VDASVDIRRAAIKTLTRLIPRVQVTGHISSLVHHLKLVLDGKNDELRKDAVDALCCLAHALGEDFKIFIPSIHKLLLKYR LRHKEFEEIEGRLQRREPLILGITAIQRLNRRPPVEVVSDPLDEVEIDPYENGSDAHKLKGHQVNDGRLRTAGEASQRST KEDWAEWMRHFSIQLLKESPSPALRTCARLAQLQPFIGRELFAAGFVSCWAELNEPTQKHLVRNLEMAFSSPHIPPEILA TLLNLAEFMEHDEKHLPIDIRLLGALAEKCRAFAKALHYKEMEFEEARSKKMEANPVSVVEALIHINNQLHQHEAAVGIL TYAQQHLDFQLKESWYEKLQRWDDALKAYTVKASQATSPNILLEATLGRMRCLAALARWEELSNLCNEYWTPAETNARLD MAPMAANAAWNMGEWDQMAEYVSRLDDGDDTKLRGTGNNNTSNSDGSSNGTFYRAVLFIRRGKYDEAREYVERARKCLAT ELAALVLESYERAYSNMVRVQQLSELEEVIDYRTLPIGDRVAEERRALIRNMWTQRIEGAKSNVEVWQALLAVRALVLPP VEDIETWLKFASLCRKSGRICQARSTLVKLLQYDPESSPENVRYHGPPQVMLAYLKYQWSLGEDSKRREAFIRLQNLTME LSSIPHIQPITPSGFTSGSVPSVPLLARVYLNLGSWQWSLSPGLVDESIKDILNAFTKATQYANKWAKAWHKWALFNTAV MSHYTLRGFPDVAAQFVVAAVTGYFHSIACAANSKGVDDSLQDILRLLTLWFNHGSTAEVQMALKKGFSLVNINTWLVVL PQIIARIHSNNHAVRELIQSLLVRIGQNHPQALMYPLLVACKSISNLRKAAAQEVVDKVRKHSGVLVDQAQLVSKELIRV AILWHEQWHEALEEASRLYFGEHNIEGMLKVLEPLHEMLEEGAKKNNVTIKERVFIEAYRQELLDAYECCMNYKRTGKDA ELTQAWDIYYHVFRKIDKQLQSLTTLDLESVSPELLECRNLELAVPGTYRADAPVVTIASFARQLVVITSKQRPRKLTIH GSEGDDYAFLLKGHEDLRQDERVMQLFGLVNTLLENSRKTAEKDLSIERYAVIPLSPNSGLIEWVPNCDTLHHLIREYRD ARKITLNQEHKCMLSFAPDYDHLPLIAKVEVFEHALNNTEGNDLAKVLWLKSRTSEIWLERRTNYTRSLAVMSMVGYLLG LGDRHPSNLMLHRFSGKILHIDFGDCFEASMNREKFPEKVPFRLTRMLVKAMEVSGIEGNFRSTCENVMQVLRTNKDSVM AMMEAFVHDPLINWRLFNFNEVPQMSLLTSNLVTPVVNTEESAPDRELSHPQRGARERELLQAVNQLGDANEVLNERAVV VMARMSNKLTGRDFSTCSSVSNSSPQHAVDHNSLISVDTREVDHALSVKLQVQKLIGQATSHENLCQNYVGWCPFW
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Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER
PTHR11139
30 2475 2446 0.0 –
PANTHER
PTHR11139:SF9
30 2475 2446 0.0
IPR026683
SUPERFAMILY
SSF48371
42 590 549 1.23E-35
IPR016024
Gene3D
G3DSA:1.25.10.10
255 433 179 3.3E-7
IPR011989
SUPERFAMILY
SSF48371
343 1431 1089 6.67E-120
IPR016024
Gene3D
G3DSA:1.25.10.10
502 818 317 3.1E-14
IPR011989
Pfam
PF11865
765 933 169 2.7E-52
IPR024585
SMART
SM01346
765 933 169 9.4E-77
IPR024585
Gene3D
G3DSA:1.25.10.10
928 1135 208 4.8E-10
IPR011989
ProSiteProfiles
PS51189
1302 1883 582 43.025
IPR014009
Pfam
PF02259
1442 1809 368 1.2E-100
IPR003151
SMART
SM01345
1916 2019 104 1.7E-54 –
Pfam
PF08771
1916 2018 103 4.0E-40
IPR009076
Gene3D
G3DSA:1.20.120.150
1919 2016 98 1.1E-37
IPR036738
SUPERFAMILY
SSF47212
1920 2017 98 6.15E-36
IPR036738
SUPERFAMILY
SSF56112
2001 2340 340 2.75E-97
IPR011009
Gene3D
G3DSA:3.30.1010.10
2017 2145 129 1.6E-16 –
CDD
cd05169
2058 2336 279 0.0 –
ProSiteProfiles
PS50290
2087 2476 390 63.091
IPR000403
Pfam
PF00454
2087 2335 249 5.8E-75
IPR000403
SMART
SM00146
2088 2390 303 3.9E-100
IPR000403
ProSitePatterns
PS00915
2091 2105 15 -
IPR018936
Gene3D
G3DSA:1.10.1070.11
2187 2360 174 1.4E-38
IPR036940
ProSitePatterns
PS00916
2228 2248 21 -
IPR018936
ProSiteProfiles
PS51190
2444 2476 33 16.959
IPR003152
SMART
SM01343
2444 2476 33 1.3E-14
IPR003152
Pfam
PF02260
2445 2476 32 1.6E-14
IPR003152

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
GO:0004674
Molecular function Protein serine/threonine kinase activity Catalysis of the reactions: ATP + protein serine = ADP + protein serine phosphate, and ATP + protein threonine = ADP + protein threonine phosphate.
Subterm of
GO:0005515
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).
Subterm of
GO:0016301
Molecular function Kinase activity Catalysis of the transfer of a phosphate group, usually from ATP, to a substrate molecule.
Subterm of
GO:0044877
Molecular function Protein-containing complex binding Interacting selectively and non-covalently with a macromolecular complex.
Subterm of

Genome browser

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0459200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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