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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0498400 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0498400.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Protein kinase family protein; TAIR: AT3G59410.4 protein kinase family protein; Swiss-Prot: sp|Q9LX30|GCN2_ARATH eIF-2-alpha kinase GCN2; TrEMBL-Plants: tr|A0A151RUS1|A0A151RUS1_CAJCA Putative serine/threonine-protein kinase GCN2; Found in the gene: LotjaGi3g1v0498400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:91698883..91716600) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
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CCGGTACCTACCCGTTCCAAAAAAAAAATGGTTCCTGGGCTCAAAACGACGACGTTTTGCTTTTCTTTTTTTATTTTTTT TTTCCTGGCTCAAAACGACGTCGTTTTGGCCTTTATATTTTTTTTTTCCTGGCTCAAAACGACGACGTTTTGCCTTTTTT TTTGCATAATTTATTTATATTTAAATATTATGTATATTTTATTATATATTATATTAAAAAAAATATACATATATCTAACG TACCCGTACCCTTGTTTTTTCAAAAATCGCGTACCCAATACCGTACCGGGTACCGTACCCGTACCCGTGCAACACAGATG TTTTGTTTCTTTATACATTGCATTTTTTTGTCGAATTATTACATTATATTTCACCTTTGGCTGAGAGAAGAAAATGAGTG AGAGAACTATTAATATGGTTTCACAATCAGAGAACTAT
CDS sequence (LotjaGi3g1v0498400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGGACACAGTTCCAAGAAGAAGAAGCGCGGAGGAGGCGGAGGCAGTGGTCGCCGGAGCAAGGGAAGAACACCTTCCAA AGACCACGCTTCTCCCTTCGCCGCCGATGATAACGAGCAACTCGCCGAGGAGATTACTGCATTATGTGCAATTTTCGAAG AGGATTGCAAAATTGTTCCCGGTTCGCATCCTCAAATAGTTGTCAAGATCAGGCCTTACTCCAAGGACATGGGCTATGAG GATTTAGATGTTTCTGCTGTTCTTGTTGTTAGGTGCTTGCCAGGGTATCCCTATAAATCTCCCAAGTTGCAGATTACTCC TGAGAATGACTTATCAGAAGCTGATGCTAATAGACTCCTGTCACTCCTTAACGATCAGGCTAATTTAAATGCTAGGGAGG GACGAGTAATGATCTTTAATTTGGTTGAGGCTGCTCAAGAATTTCTGTCTGGAATTGAGCCAATTGCCAAGTCAACTGAA TCTAAGCATTTACACTCAACTACGGAAAGCAATGAAGAATTGTTTCTCAAGGATATCGCATCTTCAAATAAGAATAGGTC TTTTGTTTATGGCTTCATTGACCTTTTCAGTGGCTATGGAGAGTCATGGACTTGGGGTTTTGGAATAGGTGAAACTTCTG GAAAAAGTTCTTCCCTTCCTCCCTCCAAGTTAGATGCCTCAAAACCACGTTTTGAGGTTCAGGAAAAGAAATCCAATAGT AAGGAAAAACTATACACAATGCCAGAACTTCCTGCCAAATTAGATACTGTTGGAGAAGTTAGTGAAGATGACAACACTAG CTTATCTTTGACTCATTCAAGCAAATCTCTGGTGGAGGATTATGCAGGGAGCGACAGTGAAGGTGAGAAAGAGTATTTTA TTGGCGATGAGTATACAACAGAGGATAACGAAGATATGTATGGAAGTGAGTCTTCAGAATCTGTGTCTTCTGCCTCCCCT CGTCTGCAAGCATCTCAAACAGTAGAAAAGGATCTAATAATGGTTCACATCCTTCGTCTTGTTTGTGCTTCAAATGGAAC ATTGGCTGACTCTTTGCCACAATTAGCAACAGAGATGTACAATTTAGGGATCTTTTCTAGTTCGGCACGTGAGATGGCAT CTAAGCCGCCTTCCCTTTTTAACAAATCCTTTGATCGTGTCGTCCAGAAACACCTGGCATCATCCGGAATATCACAATTT TGGAAACCATCTGATCTTGGAGGCTCTAATAGGACTCCCCATAGTTCTCGATATTTGAATGATTTTGAGGAGCTACAACC TCTTGGTCATGGTGGTTTTGGTCGTGTTTTGCTGTGCAAAAATAAACTCGACGGAAGGCAGTATGCGGTAAAGAAAATTC GCCTTAAAGACAAAAGCATGCGTGACCGAATATTAAGGGAAGTAGCTACACTTTCTCGTTTACAGCATCAACATGTTGTT CGGTATTATCAGGCATGGTTTGAAACTGGAGTTGCAGACTCTGATGGTGACCTTTCCTGGGGTTCATCGACTCCAGTGAG CTCTACTTTTAGCTATAAAGCTGCAAGCTCCAATAATGCCACCGGGCATGAAAATCAGCAGGAATCAACGTACCTCTACA TACAAATGGAGTACTGTCCCAGGACACTTCGCCAGGTGTTTGAATCATATAATTTTGACAAAGAACTGGCATGGCATTTG TTTCGCCAAATAGTGGAAGGATTGGCACACATACATGGACAAGGAATAATTCATCGGGACTTAACACCAAGTAACATATT CTTTGATGCTCGCAATGATATTAAAATTGGTGATTTTGGTCTTGCCAAGTTCTTGAAGTTGGAGCAGCTGGATCAGGATC TAGGTCATGTGGCTGATACTGGAGTTTCCGTTGATGGTACTGGCCAAGTTGGAACATATTTCTACACAGCTCCTGAAATT GAGCAAGGATGGCCCAAGATTGATGAAAAGGCTGATATGTACAGCTTAGGGGTGGTTTTCTTTGAGCTTTGGCACCCATT TGGGACAGCAATGGAGAGACATGTTGTTTTATCTGATCTGAAACAAAAAGGGGAACTTCCACCTACTTGGGTTGCTGAGT TTCCAGAACAGGAATCCTTATTGAGGCGGTTAATGTCTCCAGGTCCTTCAGATCGCCCTTCTGCCACAGAACTTCTCCGG AATGCATTTCCCCCACGGATGGAGTCTGAATTATTGGATGATATCCTACGAACAATGCAGAAATCAGAGGATACAAGCAT TTACGACAAAGTTTTAAATGCTATTTTTGATGAAGAGATGTTAAGCACAAAACACATTCGTCCGATTGGTAGATTGAGCT CAGTTGGAGATAACAGTTCATCCCTTCAGTATGCAGATTTTGTAACTGAGGTTCGGGATTATGTTGTAGACATCCACAGG GAAATTTTCAGACAGCATTGTGCAAGGCATCTAGAAATATCAACAATGCGATTATTGGATGATTGCCCACAGTTTAATAG AAATGCAGTTAAACTTCTGACCCATGGAGGAGACATGCTTGAACTTTGCCATGAACTGCGTTTGCCTTTTGTGAACTGGA TTATATCCAACCAGAAATCTTCATTCAAACGATATGAGATATCATGTGTTTACAGAAGAGCAGTTGGACACTCAGCACCA AACCGCTACCTTCAGGGAGATTTTGACATTATTGGTGGTGCCTCAGCTTTGACAGAGGCAGAGGTCATTAAGGTCACAAG GGACATAGTCACTTGTTTTTTCCATGCAGACTTATGTGACATTCATCTAAACCATGCTGACCTCCTGGATGCAATTTGGT CATGGATTGGAGTCAAGGTAGAACACAGACTTAAAGTAGCAGAGCTTCTTTCAATGATGGGTTCTTTGCGTCCACAATCC TCAGAAAGGAAATCAAAATGGGTAGTTATAAGGCGGCAGCTTTTGCAGGAACTGGATTTGGCAGAAGCTACAGTAAATAG GTTGCAGACAGTAGGTTTAAGATTCTGTGGTTCTGCTGATCAGGCTCTTCCCAGACTAAGAGGAGCTCTTCCATCTGATA AGCGTACATTGAAGGCCCTTGATGAGTTGTCTGAGCTTGTCAGTCTCTTGAGAATTTGGAGGATTGATAAAAATGTCTAT ATAGATGCATTAATGCCACCAACTGAAAGTTATCATAGAGATATGTTTTTTCAGGTATACTTAAGGAAGGAAAACAATCC CGGATCACTCACTGAAGGTGTCTTGCTGGCTGTTGGTGGCCGATATGACTATTTGCTTCATCAGTTGTGGAATAATGACT ATAAAGGGAATCCTCCAACTGGTGTGGGGACTAGTCTTGCACTAGAGACAATAATTCAGAACTGTCCAGTAGATTTTCGG CCCAATAGAAATGAAGCCAGCACCAATATTCTTGTCTGTTCAAAAGGAGGAGGCGGTCTGTTGGAGGAGCGCATGGAACT AGTTGCTGAATTATGGGAGGAGAACTTCAAGGCTGAATTTGTGCCCACCCATGATCCTAGTCTTACGGAGCAGTATGAGT ATGCTAATGAACACGATATCAAGTGTCTTGTCATTATGACGGATACCGGTTTCTCTCTGACAGATTCTGTTAAGGTTCGA CACCTTGAACTTAAGAAGGAGAAAAGTATCGAGAGAAAAAACCTTGTCAAGTTTCTATCGGATGCTATGGCAACACAATT TAGAAACCCCTCCATCTGGATTTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0498400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MGHSSKKKKRGGGGGSGRRSKGRTPSKDHASPFAADDNEQLAEEITALCAIFEEDCKIVPGSHPQIVVKIRPYSKDMGYE DLDVSAVLVVRCLPGYPYKSPKLQITPENDLSEADANRLLSLLNDQANLNAREGRVMIFNLVEAAQEFLSGIEPIAKSTE SKHLHSTTESNEELFLKDIASSNKNRSFVYGFIDLFSGYGESWTWGFGIGETSGKSSSLPPSKLDASKPRFEVQEKKSNS KEKLYTMPELPAKLDTVGEVSEDDNTSLSLTHSSKSLVEDYAGSDSEGEKEYFIGDEYTTEDNEDMYGSESSESVSSASP RLQASQTVEKDLIMVHILRLVCASNGTLADSLPQLATEMYNLGIFSSSAREMASKPPSLFNKSFDRVVQKHLASSGISQF WKPSDLGGSNRTPHSSRYLNDFEELQPLGHGGFGRVLLCKNKLDGRQYAVKKIRLKDKSMRDRILREVATLSRLQHQHVV RYYQAWFETGVADSDGDLSWGSSTPVSSTFSYKAASSNNATGHENQQESTYLYIQMEYCPRTLRQVFESYNFDKELAWHL FRQIVEGLAHIHGQGIIHRDLTPSNIFFDARNDIKIGDFGLAKFLKLEQLDQDLGHVADTGVSVDGTGQVGTYFYTAPEI EQGWPKIDEKADMYSLGVVFFELWHPFGTAMERHVVLSDLKQKGELPPTWVAEFPEQESLLRRLMSPGPSDRPSATELLR NAFPPRMESELLDDILRTMQKSEDTSIYDKVLNAIFDEEMLSTKHIRPIGRLSSVGDNSSSLQYADFVTEVRDYVVDIHR EIFRQHCARHLEISTMRLLDDCPQFNRNAVKLLTHGGDMLELCHELRLPFVNWIISNQKSSFKRYEISCVYRRAVGHSAP NRYLQGDFDIIGGASALTEAEVIKVTRDIVTCFFHADLCDIHLNHADLLDAIWSWIGVKVEHRLKVAELLSMMGSLRPQS SERKSKWVVIRRQLLQELDLAEATVNRLQTVGLRFCGSADQALPRLRGALPSDKRTLKALDELSELVSLLRIWRIDKNVY IDALMPPTESYHRDMFFQVYLRKENNPGSLTEGVLLAVGGRYDYLLHQLWNNDYKGNPPTGVGTSLALETIIQNCPVDFR PNRNEASTNILVCSKGGGGLLEERMELVAELWEENFKAEFVPTHDPSLTEQYEYANEHDIKCLVIMTDTGFSLTDSVKVR HLELKKEKSIERKNLVKFLSDAMATQFRNPSIWI
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 16 | 16 | - | – | |
| MobiDBLite | 1 | 37 | 37 | - | – | |
| Gene3D | 30 | 162 | 133 | 3.1E-25 | ||
| SUPERFAMILY | 37 | 149 | 113 | 5.49E-20 | ||
| Pfam | 39 | 149 | 111 | 1.0E-15 | ||
| ProSiteProfiles | 43 | 152 | 110 | 19.258 | ||
| SMART | 43 | 152 | 110 | 1.0E-22 | ||
| MobiDBLite | 213 | 241 | 29 | - | – | |
| MobiDBLite | 300 | 321 | 22 | - | – | |
| Gene3D | 410 | 538 | 129 | 2.0E-33 | – | |
| CDD | 415 | 719 | 305 | 4.56491E-135 | – | |
| SUPERFAMILY | 418 | 736 | 319 | 1.73E-68 | ||
| ProSiteProfiles | 422 | 724 | 303 | 42.195 | ||
| Pfam | 422 | 722 | 301 | 5.9E-49 | ||
| ProSitePatterns | 428 | 452 | 25 | - | ||
| Gene3D | 540 | 731 | 192 | 3.7E-46 | – | |
| ProSitePatterns | 576 | 588 | 13 | - | ||
| PANTHER | 771 | 1233 | 463 | 1.8E-216 | – | |
| PANTHER | 771 | 1233 | 463 | 1.8E-216 | – | |
| Gene3D | 783 | 1115 | 333 | 3.1E-60 | – | |
| SUPERFAMILY | 789 | 1113 | 325 | 1.22E-30 | – | |
| Pfam | 868 | 1111 | 244 | 1.7E-12 | ||
| Coils | 971 | 991 | 21 | - | – | |
| Gene3D | 1125 | 1225 | 101 | 7.6E-20 | ||
| Pfam | 1129 | 1226 | 98 | 4.8E-8 | ||
| SUPERFAMILY | 1130 | 1224 | 95 | 3.08E-9 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein kinase activity | Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP. | ||
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). | ||
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Biological process | Protein phosphorylation | The process of introducing a phosphate group on to a protein. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0498400.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…