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LotjaGi6g1v0134200.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi6g1v0134200
Transcript ID LotjaGi6g1v0134200.1
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description ATP-dependent RNA helicase family protein; TAIR: AT3G46960.2 RNA helicase, ATP-dependent, SK12/DOB1 protein; Swiss-Prot: sp|F4JAA5|SKI2_ARATH DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH11; TrEMBL-Plants: tr|I1N032|I1N032_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0134200
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr6:38727012..38752561) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TGATAACACATTTGCATATAAGAAAAAAATTGATACCTTCCTTAGGTAAATTGTCATTGCAATTTGCAACCACCTAAAAC CCGCGAAAATCAAAACCCTGCTTTGTTCTCCAAATCAAAACGAAAAAGCCAAAAGGAGTGAAATTAAAAGTGAATTATCA TTATTATTATCATTGAACAAAGCGAGAACACTGTGCCGCCCTAATGGATCCGATCCAAGCATCCAACGAGCTCTCTTTCC GGGTCGGGTTCACCGGCCACAGCGGCCACCTCCGCCTGGAGCCGCTGTCCACGGTGGAGCGTGACAACCCGCTGCGCTCC ATTCCCGACTTTATTATGGTCAGTCCCCTTAGCTCCATTTTCATACTCCTTAGGTTTTTGCTGCAATTTGTTAATTCATA GCAGCACTTGAATTGCAACCTCTAATCTTTCTGATTAATTTTCAATTATTTTGCCTTAATTGCTTTTTATGTGCTCACTA TTGTTGATTTGTATCACTGTTCAGTAATTATTCATTGGTTTTTTGAACATATTCAATTCAATTATAGACTCTATGAGGTT TTCTCAACCTGTTATCTATAGTAGGTTTTCGTAGAGGACTGGTTATAGCATAGAATTCATAGTAAAGATAAAAAAATTAT GATGTTCAGTATTCAGTTCCAAAACCCTGTGTTGCTGTTAGGTTGTGATGTGTGTAGTGTCGTGGAAAATTACAGACAAA TGCGACTAATATGACAGCAATTATGATTGTGGACTGCAATTTAAAACCATGCTTATAGGTAAACTATAGACCATTGTAGT CAAAATCCTGATTTAGTCCTACGATTATGTGATTAAAGTACACCTGGGCGATTAAAATCTGCCGCATAATCATTTTCTTG CTAAATCTCATCTTACACGTGATTAAAATCACATAACCGCACCTTAGTCCCGATTATGCGATTAAGCTCGGTCCGTTTGA 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ACAGTTCAAGTGGATTTCTAAGCTCTCAGGTTATGATTTTGAAATACAATACAAACCTGGAAAGGACAACTCTGCAGCTG ATGCCATGTCTAGGAGAAGTTCTTACTGTGCACTCTCAGTCCTCAAGGTTAATGACTATGAGGAATGGCAAACTGAAGTG TTACAGGATCCTAAATTGCAAGCAATAGTGCAGGATCTGATTCTGGATCCAGAAGCTCACAAAGGCTACTCTCTAAGAGA CCACAAGCTGTTCTACAAAGGGAAGCTGGTGCTGTCCAAGCAATCCTCTAGGATTCCCATTTTGTGTAAGGAATTCCATG CTACCTTGTTGGGGGGGCATTCTGGTTTTTTCAGAACTTATAGGCGGTTGGCTGCAGTGGTCTATTGGGAGGGCATGAAG AAAGACATTAAGGACTATGTAGCTGGCTGTGACACTTGCCAGAGGAATAAATTTGACAATTTATCCCCAGCAGGTCTCCT TCAGCCATTGCCAATTCCTACACAAGTATGGACCGATGTGTCTATGGATTTTATTGGTGGTCTACCTAAATCCAAGGGCA AGGATACAATCCTAGTGGTGGTGGACAGGTTGACTAAATATGCCCATTTTATTGTTTTTGCAAGAAATTGTGAGACTACA TGGGTTCCCTGCAACAATAGTCTCAGATAGGGATTCTCTGTTTCTCAGCAGCTTTTGGAAAGAATTATTTCGAGTTTCTG GTACCCAGTTGAGGTTCAGTACTGCCTACCATCCTCAAACTGATGGTCAGACTGAAGTGGTAAATAGATGCTTAGAGGTC TACTTGAGGTGTCTTACTGGTTCCAGACCAAAGAAATGGGTCACTTGTCTACCTTGGGCTGAGTTCTGGTTCAACAGCAA TTATAATAGGTCTACTAAGATGTCTCCTTTTCAAGCCCTTTATGGTAGGGAACCACCACTGCTACTACAGGGCACTACAA TTCCCTCCAACATTGCTGCAGTGAATGAATTGCAGGAGGGTAGGGATGAGTTGATAGCTGATCTCAGGGCTAACCTTCTG AAGTCCCAAGATATGATGAGAACCTATGCTAATAAGCATCGAAGGGATGTGGAATACCAGATTGGGGACTTGGTTTACCT TAAGTTGCAGCCTTATAGAAGAAGGTCTTTGGCTAGGAAACTGAATGAAAAGCTGAGTCCTAGATATTATGGTCCTTATC CTATTGCAGCTAAAATTGGAGCAGTAGCTTACAAATTGGACTTACCAGCCCATAGTAGGGTGCACCCTGTCTTTCATGTC TCTCTCTTAAAGAAGGCCATAGGGACTGATTTTCAAGCTCAACCTTTACCTGAGGTTTTGAATGAGGACCATGAGCTGGT CGCTGAACCTGAAGCTGTAGTGGCTGTTCGGGAGGATACTATGGGGCACATTGAGGTGTTGATTCAGTGGACTTCTCTAC CTGCTTGTGAGAATAGTTGGGAATCTGCTGCTCAGCTCCATGAAGCTTTCCCCACTTTTCCCCTTGAGGACAAGGTGAAG CTTTTAGGGGGGGTATTGATGAGTATAGGCCTCCAATGAAGAAGGTGTATGAGAGAAAGAACAAGGGGAAAGCCACAGCT TAATGTGTTTGTTATAGTTAGTTAGTATCCAGCTGGCAAGTTAGTTGTTTCTGTTAGTGGCCAGCTGGCAATTTCTGTTA GAGATGCATTCTGTTAGCATCTGGGAGATAGTATAAATAAAGGGAAGGGGGTAGTTAACGAGTAGTTATTCAGTTAGTAG GTAATTGTGGAGAGACTGGTCTCTCGAACAACCAGAGGAAGAACTAGGGTTCATTCCACCATTTCTGTACCTTGAGCTCT GGTTCTCATTGAGAATCTGAGTCTCTATTTTCATTCAAATTCAATCTAGTTTCAGTTCAGAGTTCTACAGTGTTCATCAA TAATTAGATCTGTTTGGGATAAGCTATCTGCCTATCTTCAATAATTGCTCTAGATCATTGGGGGAGGGGGGTATCCTCTA ATATACCGATCCTTCCTTCTGAAGATCAATTAGTTTTAGCCCTCCTTCATTCATATCTTAATTTGCAAATATTTGTACGT TAACTTCTGAAAGCTTCTCTGGATTAAGTTCTTTCAAAATCTGATTGACAGACACTTGTCAATTATAATTTCTGGAAAAT CATGAAAGAGTATTGTGTATCCAACTTTTCTGTTTGAAGGGCAAGATTCAATGATTGTGATATACATTTATAGATAACAG TTAGTGAATGTTAGAGTCTGTTAGTCAGTTAGTTAAGGAGTTGGTTAGAGTTAGAGAAGTTATAAATAACAAGAAAGGGA GCTGTTTTCCGTTCATTAAGAAAGGAGACATTCTTGAAGAAGTAGGAAAAGAGATGGCAACTTCCAGGAGGGGACTCAAG GAGAGACGTTAGGAAATTCCAACATTTGCAATTTTACATGACAAATGAGTTATTGGTGGCTCATCAACATGTTGCAGCAT TTTAAGCCTGTTAAGGTCCCACATTGACCGGGGATATGGTTAAATAAGTCTTTATATATGGTGGAGCAATTCTCACCCCT GAGCTAGCTTTTGAGGTAGAGTTGCTAGCTTAAGGTTCAGGATTCGTCTACCCTATATAAAGACTATTTTTGCCATATCT CTAGTCAATGTGAGACCTTAACAATTTTATCATAGAAATTTTAACTCTCTTGATGAATTGTTACCAAATTGGGTGAGAAA TTGGGTTGCAGGTAGAGGACATGCTTAAAAGAAGTTTTGCAGAATTCCATGCACAGAAAAAACTTCCAGAAATGCAACAG ATTTTGAAGCTAAAGCTTAATCAGCCTACAAAAGCTATTGAGTATGTCAATTATCTGTCCCCGTCTCTTCAATATTGTTG TGTCAGTGTTCAGATAATTTCTTTCATATTACAATCTTGCTGTCATTGTGATATTCACTCATTATTTAGCTGTTCATGAT GTCTAACGAAAGGATTGCTATCAGTATTAGCTGTTACTCTCTCTATTCCTATTTATAAGTCACTTTTACCTAATTCACTT AGATAAAGAAAATTAGTTAAGAGTTGTTGTTAGTGTCAAATTTTAAAAATATTCTGTTAAACTTTCCTGAATTACCCCAT ATTGGGAAACTTAAAGAATTTATTATTGAGTGTTAGATGATTAAAGATGAAGCATTAAATATAAGGGTACGTTTGTAAAA AAAATTAATGTTTCATAGATATTTTAAAATGACTTATATAAAGGAACATGAAGAGCTTCTGAAATGTGACTTATAAATAG AAACATATGATGTATCTTTTAATTTATCTTATTTTTTTATTTATGAGCTGCATATTTGTCTGTAGTTTCACTAGCACGAC ATTTTTTTTTCTTCAGATGTATAAAGGGTGAACCAACCATTGAAGAGTACTATAATTTATATTCAGAAGCTGAGAAGTAC AGCAACCAAATATCAGAGGCTATTTTACAGTCCCCCAATGTCCAACCGTTTCTCAATACTGGAAGAGTTGTAATTGTAAA ATCAGAATCAGTGAGTTCTTATATTTATGATTTACATTTGTATCTGTTGGAAACATTGGTGAAAACTAATATACCATAGG GAATTATGGGAGTTAATATATTGTTTGAAAAACTAGTCATAGGAAACAGTTTAGTGCTTTATTATTGTTTTTTTCTTATT GGAGTATACCCAATTGTATCATGTCTCACCGTAGGAGTTTGATACAGTTAGTTTTACAGTTAGGCTTAGGGTTAGCAGTT AGGTGCAGTTGCTTATATTTGTTGCTGGCTTGGTGCATATTATATGCTCCATCTCCTGTGAGTGTTGGAAATAGAGGCAG GCCGTAGAAATTAATATGCCCTTGGGAATTCTGGGAGTTGATGTATCATTGGAATGATTAGTCATGGGAAATAGTTTACA TTTATATTCTTGGTTCTATAAATGTTAGATGTATTTATTTATTGTTTTGAAGTATATAAATATAAATATCAAGAATTCTC AGTGCTACTCAAACTTTTTCCTAGTCTATACTCAAACCTTAATCTATTCTCAAGTGCATCATTTTAAATCTACAAGATGT TAGAGTCTCATCTTAGGTGGTCTGGGCATGTATGGTGAAGACCTATAGAAGCACCTGAGGAGGTTGATCAGATGGAAGAG TCCAGTGGTTAGCGGTAGAGGTAGACTTGTCAAAGCTATAGGCCCAATCATTAAGTGGGATTACGATTAAATAATCTGTC TATAAACTTAATATATGATAGAGCATTATGACATAGACCAATCCATGAAGCTGACTCCACCTAGTGAGGTGTATTGTTAT AGAATTTGAATACTTCAGTAGATATTGAGCTAATTGATGCAGCAACAACCAACAGGTACTTATATCATAATTTATTTGCA GACTCAGGACCACTTGCTTGCGGTGGTTGTGAAAACTCCTTCTCAGAATAATAAGCTGTACATTGTTTTTATGATTAAAC CTGACATGCCATCACCAGTGGAAAAGGCCTCGAGTAGTGGTAATTTCCAGGATAAAAGCAGTGCATTTGACCAAGGTTAT TTTGTAAAGCCAAAATCAAGACGTGATGTTGAAGATCAATATACTATATCTGTTTCTGCTCGCAAAGCAAAAGGGGTCAT CAACATCAAATTGCCATATCGTGGATCTGCGTGTGGAATGAGCTATGAAGTCCGAGAAGTTGACAGTAAAGAGTTTCTAT GTATATGCAATAGAAAAATTAAAATCGACCAAGTTGGACTTCTTGAAGATGTTAACAAATCTGTTTACTCAAAGACAGTT CAGCTGCTCTTGGATTTGAAATCAGATGGAAATAAGTATCCTCCTGCTCTGGATCCTGTGAAAGGTATTGCCATTTTGGT TTACTGATGATATATATTTTGATAGTGTGTCCAACTTTTATAAATTGGACCTATGTTTGGCCAAAAAATATTTTCAAAAT AATAAAAAGAAAAGTATCATAATAAGTTTCTCTGAGGGATACCATCACTTTTACAAGTTTTTGCATGACGAGGTAATGGC ATATTAGAATTATAGAAGCCGTTTTTGGTCAATTAATTTTAAATAAAATTCTTTCCGTCCTACAATATTGATGTTTATCT AAGGTGTTGTCCATGTTCATTTAAAATTAATCTCTTAATTTTTTCAATTGTTACAAGTCCCTTCACCATGTTCCTTCTAC TTAAAATTCTCATTGTTATTTTCCAATCAAAAGTTTCACATGTTGAATTAATTAAATCATTTTAAACCTTATTTTAACAA ATTTCACCAACCAAAACTTTAAATCTTACTATAAAAAATTCCTAAATTTCCCCATTCTTCAAACCCTATTTTTCATCCTA CAAAATCTTTAAAATTTGATCAAAATTAGAATTAAATTTTATACTTTAATTGTTTTACTTCACAAATACATAAAACCCCA ATTTTTTTTATAGAATATGAGGATTTGAGAATTTTTTGTTGAAAAAAATTGATGGCAAGATCAAATTCTCTTAAATTTAA AAATAGAGGATTTGATTAGCTTAAAAAAACTTGTGGACTAAACTATCACAGCTGAAACAAGAGGGACTATAAGTGCAATT AAACATTTATTTTATTTTAACACTTTATTTCAAACCTATAGTAAGCCATCATTACTTTCATCCTTTTTTTTTCAGATCTA AAATTGAAAGATGTGGAACTTGTGACAACATACCGGGAGTGGACTAAATTATTGGAGAAGATGTCCCAGAATCAGTGTCA TGGGTGTATAAAATTGGAAGAACACCTAAAGTTAGCAAAAGAGATAAAAACACACAAAGATGAAGTTTATGAACTTCAGT TTCAAATGTCAGATGGTGCACTTAAACAGATGCCAGACTTTCAGGGCCGGGTACCACATTCATCTTCTTTTGGAGTTATG CTTGAAAAGAAATTCTGATAGTTTGTTTTATTCCTCAATCTTATGATGTCTTGTATTTCTTTGTACTATTTCTCCAGATA GATGTTTTGAAGGAAATTGGGTGCATTGATGAAGACCTCGTCGTTCAAATGAAAGGCCGTGTAGCTTGTGAGATGAATTC TGGGGAGGAATTGATATGTACTGAATGCTTGTTTGAGAACCAACTGGATGATCTGGAACCAGAAGAAGCAGTGGCGTTAA TGTCAGCTTTTGTGTTCCAGCAGAAGAATACGTCTGAGCCTTCACTCACACCCAAGCTGGCTGAAGCGAGACATAGGTAA ATTGCAATTGTCTATTTTTATGAAATGAAGTCTTCAAAAGATAAACATCCATACATAAGCTAAGTAAAAACCTAGATAAT TATTTTTATGATGCACGTTTGGAACCACATTATCAGCCATATGTATGGGGGTAAGAATCATGTTAATGTCAAAGCTCTCC CTCATAGCTTCTGGCTTGACGTGCCTACATTAGGATCCAGACACACTATATGCTGTCATTTTGTCTTTCTGCATCTTCAA AATTCAGATTGGAATCAAGATATGGATCCTAAAATGTGTTTGTTTCAGATTGTTCAAAACAGCAATAAGACTTGGAGAGC TTCAGGCGCATTTTAATTTACCAATAAGCCCTGAGGAGTATGCCCAAGAAAATCTCAAATGTGGTCTCGTTGAAGTGGTT TATGAATGGGCAAAGGTTTCCCTTCTACCAAAAATACTCCACTATTTAGTTCCATATTTTTCCATTGATTTCTGAGGAAC CAATCTATGTCTTTAATGCAGGGTACTCCGTTTGCTGAGATATGTGAGCTCACTGATGTTCCTGAAGGCCTAATTGTAAG GACCATTGTCCGGTTGGACGAGACGTGTCGGGAGTTCAAAAATGCTGCAGCTATTATGGGTAATTCTGCTCTGTGCAGAA AAATGGAAATTGCTTCTAATGCAATAAAGCGTGATATTGTATTTGCAGCTAGCTTGTATGTTACCGGTGTATGATCATTT GTTCAGCATGTTATTGTTTATTTGAACTTAATGCAGTCAATAGTCAATATCAAGGGGTGCTTTTGTATATAATGATCTCA TTTCATTTCATGCAAACCTTGTTTGTTCCTCATGTATGTTACCTTTTCTTTTTCGACGGTCTATTACTAAAAAAATGTTG TACTCATTCTGTAGAATACTTATTTCAATTGGCAATGCAACAGTTCACTGTTTTGTTTTGTGCATGTTTCTATGGCTTTA CCTAAGTATTCATAAATAGTTAAGTACCTAATTTAATATTATGATCATGTTTGAGAGGGTTTAGATCCAGTCATCAAAAT TTTAAGAACATGAATGTTATGAAGAAATTC 

CDS sequence (LotjaGi6g1v0134200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGACATCAGGAGCAGAAGAGTCTGGGCCATTACCACGCACTTCTGCGAAGGACTTTGTTAGGGGAAGCATCAATAATCG CCCTTTTCGACCAGGAGGTTTGGATGATTCCCAAGGTTTAGAAAGAACTCTTCCACCAGGTGCTTCTAATGGTGAATGGG TGCTTGAAATTTTCAATGGTGGTCCTGCCCAGACAATTCCACCGAGTTCAAAGCAAGGACTGGATCTTGGTTTCCTCAAG CCATATCCATGCTCATGGAATGTTTACAAGGAAGCCAATTCACGCCAGGGCTCATCAGACGAAAATTTGAGTGGATTGTC AGTACAGTTTGATGACTTATTTAAGAAGGCTTGGGAAGAGGACGCTGTTGGAGAGCAGGAGGAAGATGGCCATTTATCAG AAGTGGTGCCTGTTAAGTTGGAAGCTGAAGTTGATACAACTGAGATATCCAGCAGAGAACGTGAGAGTGAAATGTCACTT GATGATATTTTGTCAGCTGACTCAGAAGGATCAAAACTGCATTTGGATGGATTTAGTGATGAAGTTGGACAGCAGCGGAA GGAAGCTTGGGCTATGTATGAAGATAGTGAGCGAATTGCAGATCGCTTTCATGAACTTGTTCCTGATATGGCACTTGACT TTCCCTTCGAGTTGGATGCATTTCAGAAGGAGGCTATTTATTATCTTGAAAAAGGGGAATCTGTTTTTGTGGCCGCTCAC ACATCAGCTGGAAAGACAGTAGTTGCTGAATATGCATTCGCTCTAGCATCAAAACACTGCACTAGAGCTGTGTACACTGC CCCAATAAAAACCATCAGCAATCAGAAATATAGAGATTTCTGTGGGAAGTTTGATGTTGGGCTTCTTACTGGTGATGTAA GTTTGAGGCCAGAGGCTTCTTGTCTCATCATGACCACTGAAATTTTAAGATCAATGCTCTACCGGGGTGCAGATATAATT CGAGACATTGAATGGGTTATATTTGACGAGGTTCACTATGTCAATGATGTTGAGAGAGGTGTTGTTTGGGAAGAAGTAAT TATCATGCTTCCAAGACACATCAATATCATCCTCCTTTCTGCCACGGTTCCTAATACTATTGAATTTGCCGATTGGATTG GAAGGACAAAACAAAAGAAAATACGGCTGACAGGGACAACAAAAAGACCCGTCCCGTTGGAGCACTGCCTGTTTTATTCT GGAGAACTGTACAAAATTTGTGAAAGTGAAACATTTCTGCCTCAGGGATTGAAAGCTGCTAAAGATGCTTCAAAAAGAAG GCATTTAACTGCTGGTGGTGGTTCTGGATCAAAGCCAGGGTCAGCAAGTCATGATAATGCTCGAGTTCAAAAAGGAGAAA ACACATCTCGAGTGAAACAGCATGGAACTAATTTCTCTAGGACTGGCAAAGGCTATCAAAATAATGGCAATGGCCAGAGC AATTGGAGAGCAGAAGCTTCAATGTGGTTGATGTTTATCAACAAACTCTCCAAAAAGTCCTTATTGCCTGTGATTATATT TTGTTTTTCTAAGAATCGCTGTGATAGATCAGCTGATAGTATGACTGGAACTGACCTCACTAGTAGCTCAGAGAAAAGTG AAATCCGTCTTTTCTGCGACAAAGCGTTTTCACGCCTGAAGGGGTCTGATAGAAATTTACCACAGGTCGTTCGAGTCCAA AATCTTCTTCGTAGAGGGATTGGTGTACATCATGCTGGCCTTCTTCCAATTGTAAAGGAAGTTGTTGAAATGCTATTTTG CCGTGGTGTTGTCAAGGTCTTGTTTTCAACAGAGACATTTGCAATGGGAGTGAATGCACCTGCTAGGACGGTAGTCTTTG ATACTCTAAGGAAGTTTGGTGGCAAGGAATTTAGGCAGTTACTGCCAGGAGAATATACTCAAATGGCAGGTCGCGCTGGC AGAAGAGGACTTGATAAGATTGGTACTGTTATTTTGATGTGCCGTGACCGCGATGAACTCCCAGAAGAGAGTGATTTAAA AGATGTTACTGTTGGAAGTGCAACTCATCTTGAATCTCAATTTCGGCTAACCTATATTATGATCTTACATCTTCTTCGAG TCGAAGAATTAAAGGTAGAGGACATGCTTAAAAGAAGTTTTGCAGAATTCCATGCACAGAAAAAACTTCCAGAAATGCAA CAGATTTTGAAGCTAAAGCTTAATCAGCCTACAAAAGCTATTGAATGTATAAAGGGTGAACCAACCATTGAAGAGTACTA TAATTTATATTCAGAAGCTGAGAAGTACAGCAACCAAATATCAGAGGCTATTTTACAGTCCCCCAATGTCCAACCGTTTC TCAATACTGGAAGAGTTGTAATTGTAAAATCAGAATCAACTCAGGACCACTTGCTTGCGGTGGTTGTGAAAACTCCTTCT CAGAATAATAAGCTGTACATTGTTTTTATGATTAAACCTGACATGCCATCACCAGTGGAAAAGGCCTCGAGTAGTGGTAA TTTCCAGGATAAAAGCAGTGCATTTGACCAAGGTTATTTTGTAAAGCCAAAATCAAGACGTGATGTTGAAGATCAATATA CTATATCTGTTTCTGCTCGCAAAGCAAAAGGGGTCATCAACATCAAATTGCCATATCGTGGATCTGCGTGTGGAATGAGC TATGAAGTCCGAGAAGTTGACAGTAAAGAGTTTCTATGTATATGCAATAGAAAAATTAAAATCGACCAAGTTGGACTTCT TGAAGATGTTAACAAATCTGTTTACTCAAAGACAGTTCAGCTGCTCTTGGATTTGAAATCAGATGGAAATAAGTATCCTC CTGCTCTGGATCCTGTGAAAGATCTAAAATTGAAAGATGTGGAACTTGTGACAACATACCGGGAGTGGACTAAATTATTG GAGAAGATGTCCCAGAATCAGTGTCATGGGTGTATAAAATTGGAAGAACACCTAAAGTTAGCAAAAGAGATAAAAACACA CAAAGATGAAGTTTATGAACTTCAGTTTCAAATGTCAGATGGTGCACTTAAACAGATGCCAGACTTTCAGGGCCGGATAG ATGTTTTGAAGGAAATTGGGTGCATTGATGAAGACCTCGTCGTTCAAATGAAAGGCCGTGTAGCTTGTGAGATGAATTCT GGGGAGGAATTGATATGTACTGAATGCTTGTTTGAGAACCAACTGGATGATCTGGAACCAGAAGAAGCAGTGGCGTTAAT GTCAGCTTTTGTGTTCCAGCAGAAGAATACGTCTGAGCCTTCACTCACACCCAAGCTGGCTGAAGCGAGACATAGATTGT TCAAAACAGCAATAAGACTTGGAGAGCTTCAGGCGCATTTTAATTTACCAATAAGCCCTGAGGAGTATGCCCAAGAAAAT CTCAAATGTGGTCTCGTTGAAGTGGTTTATGAATGGGCAAAGGGTACTCCGTTTGCTGAGATATGTGAGCTCACTGATGT TCCTGAAGGCCTAATTGTAAGGACCATTGTCCGGTTGGACGAGACGTGTCGGGAGTTCAAAAATGCTGCAGCTATTATGG GTAATTCTGCTCTGTGCAGAAAAATGGAAATTGCTTCTAATGCAATAAAGCGTGATATTGTATTTGCAGCTAGCTTGTAT GTTACCGGTGTATGA 

Protein sequence (LotjaGi6g1v0134200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MTSGAEESGPLPRTSAKDFVRGSINNRPFRPGGLDDSQGLERTLPPGASNGEWVLEIFNGGPAQTIPPSSKQGLDLGFLK PYPCSWNVYKEANSRQGSSDENLSGLSVQFDDLFKKAWEEDAVGEQEEDGHLSEVVPVKLEAEVDTTEISSRERESEMSL DDILSADSEGSKLHLDGFSDEVGQQRKEAWAMYEDSERIADRFHELVPDMALDFPFELDAFQKEAIYYLEKGESVFVAAH TSAGKTVVAEYAFALASKHCTRAVYTAPIKTISNQKYRDFCGKFDVGLLTGDVSLRPEASCLIMTTEILRSMLYRGADII RDIEWVIFDEVHYVNDVERGVVWEEVIIMLPRHINIILLSATVPNTIEFADWIGRTKQKKIRLTGTTKRPVPLEHCLFYS GELYKICESETFLPQGLKAAKDASKRRHLTAGGGSGSKPGSASHDNARVQKGENTSRVKQHGTNFSRTGKGYQNNGNGQS NWRAEASMWLMFINKLSKKSLLPVIIFCFSKNRCDRSADSMTGTDLTSSSEKSEIRLFCDKAFSRLKGSDRNLPQVVRVQ NLLRRGIGVHHAGLLPIVKEVVEMLFCRGVVKVLFSTETFAMGVNAPARTVVFDTLRKFGGKEFRQLLPGEYTQMAGRAG RRGLDKIGTVILMCRDRDELPEESDLKDVTVGSATHLESQFRLTYIMILHLLRVEELKVEDMLKRSFAEFHAQKKLPEMQ QILKLKLNQPTKAIECIKGEPTIEEYYNLYSEAEKYSNQISEAILQSPNVQPFLNTGRVVIVKSESTQDHLLAVVVKTPS QNNKLYIVFMIKPDMPSPVEKASSSGNFQDKSSAFDQGYFVKPKSRRDVEDQYTISVSARKAKGVINIKLPYRGSACGMS YEVREVDSKEFLCICNRKIKIDQVGLLEDVNKSVYSKTVQLLLDLKSDGNKYPPALDPVKDLKLKDVELVTTYREWTKLL EKMSQNQCHGCIKLEEHLKLAKEIKTHKDEVYELQFQMSDGALKQMPDFQGRIDVLKEIGCIDEDLVVQMKGRVACEMNS GEELICTECLFENQLDDLEPEEAVALMSAFVFQQKNTSEPSLTPKLAEARHRLFKTAIRLGELQAHFNLPISPEEYAQEN LKCGLVEVVYEWAKGTPFAEICELTDVPEGLIVRTIVRLDETCREFKNAAAIMGNSALCRKMEIASNAIKRDIVFAASLY VTGV 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
MobiDBLite 1 46 46 -
PANTHER 2 1202 1201 0.0
PANTHER 2 1202 1201 0.0
PIRSF 3 1201 1199 0.0
Pfam 14 80 67 6.1E-9
Gene3D 187 389 203 1.9E-68
CDD 211 387 177 5.59135E-105
SMART 214 394 181 3.1E-26
Pfam 221 367 147 7.1E-15
ProSiteProfiles 226 381 156 21.21
SUPERFAMILY 230 655 426 1.44E-41
Gene3D 390 678 289 1.9E-84
MobiDBLite 424 478 55 -
MobiDBLite 456 478 23 -
CDD 492 655 164 1.06367E-47
ProSiteProfiles 495 692 198 10.768
SMART 557 643 87 1.3E-14
Gene3D 685 1192 508 1.3E-121
Pfam 700 999 300 6.2E-42
Gene3D 707 1000 294 1.3E-121
Gene3D 775 929 155 1.3E-121
SMART 1023 1201 179 2.8E-86
Pfam 1027 1196 170 1.1E-50

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Nucleic acid binding Interacting selectively and non-covalently with any nucleic acid.
Molecular function RNA binding Interacting selectively and non-covalently with an RNA molecule or a portion thereof.
Molecular function RNA helicase activity Catalysis of the reaction: NTP + H2O = NDP + phosphate, to drive the unwinding of a RNA helix.
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process RNA catabolic process The chemical reactions and pathways resulting in the breakdown of RNA, ribonucleic acid, one of the two main type of nucleic acid, consisting of a long, unbranched macromolecule formed from ribonucleotides joined in 3',5'-phosphodiester linkage.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi6g1v0134200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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