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LotjaGi6g1v0163900.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi6g1v0163900
Transcript ID LotjaGi6g1v0163900.1
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description DNA polymerase I; TAIR: AT1G50840.1 polymerase gamma 2; Swiss-Prot: sp|F4I6M1|POLIA_ARATH DNA polymerase I A, chloroplastic/mitochondrial; TrEMBL-Plants: tr|G7J1V4|G7J1V4_MEDTR PolI-like B DNA polymerase; Found in the gene: LotjaGi6g1v0163900
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr6:44774589..44801031) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CCACTTTTTGATCATTGTTCAAACTTCAAAGCTTCAAAGTTCAAAGTGGCAGGGTTTATGACCTCCACTTCCATCACCAT TCTCAATCTCTCTCTATTTCCTCTCATGCTCTCACTCTTCTCTGCTTCACCACCACCACCATAACCACCACACTCACTTG TGCTTGTGTTGCAACTCAAATAAAGCCTTTTGTGTCACTGCAGCCACCAAACTGGGGAGGCTTGTAGGTGTCATTGCAGC CATGGGGGTCTCTTCCCAGAGCACCCCTTTCAGACCACCTTACTACTGCCCTTCTTGCTTCCGCTTCTCACTCTCCTCTT CCCGCCCTTTCCTTCTTCCTCTCTCTTACAGGTCCTTTTCTGCTTCATCTGGTTCACTCCACCCCAGGTTCGTTTTTCCT CCAAAGTTTTTATCTTTTGTCCATTGGGTGTTGGTTTTCGCTTGCCCCATGTCTTGAAATCATGTAATGACTCAGAAATC TTTGGTGTGATAATGGGGTTTGTTATTGAATGTTGACTTGCTTTTTTGTAATATGTCATATGTGTACACCACCATGTCTG TTGTTTTAGGAACTGTTTTGAATGCCTGGAAGAATTTGATTTACTGTGTATCACTATTCAGCTAACTATCTTGTTCTTTG CTTGATGTTTATTTGTGTCTTATGTCTGTTGTGTGTTCAGAATATTTCTTTAGTGATATGTTTGGATGAAGGATTTTGGA GGGAAAGGGATGATATTTTTATTTTTGAATTAAGAGAGTTACATAGTATTTATAAATTAATCAAGGACTAGGACATTTTT TGGTCTTGGCCAAGGTATCCTTACCGTCGGTGGCCGTGAGACTAATCTCTTGCCCTATGGTCAGCTCACTAAGCAGCGGT AGGGGGCTGGCCAAGGAGTTTTTTCCATTTACAAGAGTTGAGAATCAAACCCCGAACCACTTACTTAAGAGACGAAGTGT 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TCTGATGCCGTTGGTTGGACACAGAAATTGGAGCGATATTTTGCTCTGAGAGAAGTGACTGAGGAAGAGAAGATGCAGGC AACCATGGTGGCTTTGGAGGGACGTGCACTAAGCTGGTTTCAATGGTGGGAGAGGTGCAACCCTTCACCGTCCTGGGATG CATTCAAGCTGGCTGTGGTAAGAAGATTCCAACCTTCTATGATTCAAAATCCATTTGAATTGCTGTTAGCTTTAAAGCAA GTAGGTTCAATAGAGGATTATATTGAAGAATTCGAAAAATATGCTGGAGCTTTGAAAGAAATTGATCATGATTTTGTGAG AGGAATTTTTCTGAATGGACTTAAGGAAGAGATTAAGGCTGAAGTGAGATTGTTTGAGCTTAACACTCTAGCAGAAGTTA TACAGAAGTCAATTCTGATTGAACAGAAAATTTGCTAGCAACTAAGAAGAGTGGTGGATTTGTGAGGCCTAACAATGCTT ATAGAAGCAATAACTATAACAGGACAGTTACAGTGGAACCTGTTGGTAATACTGAGAATAAACTAGGAAGCTCTAGTGGA AATAACAAGGCTGGACCAGCTCTTGAAGGGGGAAGACCCAGGGTTGGTGAGTATAAGCACTTGACAGCTGCTGAGATGAA GGATAAAAGAGAGAAAAACCTGTGCTTCAGGTGTGATGAGCCTTTTAGCAGGGACCATAAGTGCAAGAATAGACAACTTA GAATGTTAATCATGGAGGAGGAAGATGATTTGGAAGGAGGTGAGTTTGAAGATGCCTTATCTGGGGAATTTAACTCACTG CAATTATCCCTCTGCTCAATGACAGGATTTACTTCTCAGAAATCATGGAAAATGAAGGGAAGCATTAATGATCAGACAGT GGTGGTCCTCATTGATTGTGGGGCTTCACATAGTTTTGTTTCCAAGGAATTGGTGGGAAAGTTGCTGCTGCCAGTGGACT ACACCCCTTCTTACCCAGTGGAAGTAGGAGATGGTCATAAAATTAGTTGCAGGGGTAAGTGCTCTAAACTGAAGCTTATG ATACAAACTTTAGAGGTCATTCAGGACTTCTATCTATTTGGCCTCAATGGAGTAGATATGGTGCTGGGTTTGGACTGGTT AGCTAGTCTTGGTGATATAAAACCCAATTTCAGCAAGATGAAGTTGTCTTTGAAGAGAGGGGGGCAATGGATTACTTTGG AAGGGGATTCTGCTCTGACCAGAACTGAGCTATCCTATGGGGCACTCATGCAAATTTTGATTGAAGAGGGAGAAGGATTG CTAATCCACTGTGAGCAAGAGAGCATTTCTGGACTGACAACCAAGAATGTGCCAGCACAGCTAACTAAAGTTTTGGATGC TTTTGCCTCAGTTTTCCAGGATCCTGAGGGGTTACCTCCAAGGAGGAGGCATGACCATGCCATCCACTTGAAAGAAGGGG CAGAGATCCCAAATCTAAGGCCATACAAGTGTCCCCATTACCAGAAAAATGAGGTAGAAAAACTGGTGGCTGAAATGTTA GAGGGAGGGGTTATAAGGCCCAGTATTAGCCCTTATTCTAGTCCTATAATTTTAGTTAAAAAGAAAGATGGGGGATGGCG CTTTTGTGTTGATTTTAGGGCACTCAACAAGATCACCATACCCAACAAATTTCCAATTCCAATCATAGAGGAATTGTTGG ATGAAATAGGTGGAGCCAAGGTGTTTTCTAAGCTGGATTTGAAATCTGGTTACCACCAGATTAGAATGAAAGAGGAAGAC ATAGAGAAGACTGCGTTTAGAACACACGAGGGGCATTATGAATTTCTTGTGATGCCTTTTGGTCTCACTAATGCCCCCTC TACATTTCAAGCTCTTATGAATGAGGTCCTCAAGCCTTACCTTAGGAAGTTTGCTTTGGTATTCTTTGATGACATTCTGG TATACAGTCCAGATTTGTCAACTCACTCCTCACATTTACAGCAAGTTCTGACTTTGCTAGACCAGAATTCACTCAAGGCT AATAGGAAGAAGTGCACTTTTGGCCAAGACAGTCTAGAGTACTTAGGACACATTATTTCTGGGGATGGAGTTGCAGCAGA TCCATCTAAAGTTGAGGCAATGAAGAATTGGCCAACTCCTATGGATATTAAGGGATTGAGGGGTTTCCTTGGTCTAACTG GTTACTATAGGCGATTTGTGCAGGATTATGGGAAAATCGCCAGACCCCTTACTGATCTCTTAAAGAAGGATGGGTTCAAA TGGACTCTTGCAGCTACAGAGGCTTTTGAGAGCTTGAAGACAGCCATGGTCAATCTTCCTTTACTTGCAGTACCTGATTT CTCCAAGCAGTTTGTAGTGGAAACTGATGCATCCAGTAGAGGACTTGGAGCTGTTCTCATGCAGGAAGGAAGACCATTAG CATTCTGGAGTCAGGGGCTATCTCAGAGGGCACAAATGAAATCAGTTTATGAGAGGGAGTTAATGGCTCTTGTGCAGGCT ATTCAGAGATGGAGACACTACCTCATGGGAAGACATTTCATTATCAGGACAGATCAGAGGAGCCTCAAATTTCTGAATGA TCAGAGGTTGTTCACTGATGAACAATTCAAATGGGCTGTAAAATTGGTAGGAATGGATTTTGAAATCCAATACAAGCCTG GTAGTGAAAATTCTGTTGCTGATGCCCTCTCTAGGAAAATGATGTATTCTGCCCTCTATCATTTCTCCAGCTGACAAAGA GGAATGGAAGTCTGCGTTGCATCAAGATCCCAAGCTTTCTAAGGTGATCCAAGATCTCATTATCTCTCCCTCATCTCATG ATGGTTTCAGTTTTAGGAAAGGATACTTGTATTATAAGGACAGATTGGTGGTATCTAAAAATTCCAACAAGATTCCTATG ATCATTTCTGAATGTCATGCCACTCCAATGGGAGGTCACTCTGGCCATTTTAGGACTTACAAGAAGATTGCTAGTTTCCT ATACTGGGAAGGAATGAAATCTGATATCAGGAAATTTGTGGAGGAGTGTGGCATTTGCCAAAGGAGTAAATATTCCACCT TAGCTCCAGGAGGGTTGCTACAACCTCTTCCTATACCAACTCAGGTTTGGATGGATGTGTCCATGGACTTTGTTGGAGGG TTACCTAGAGTTAAGGGCAAAGACACCATTTTGGTGGTGGTGGATAGGTTGTCTAAGTTTGCTCACTTTTATGCTTTAGG CCACCCTTTTTCAGCTAAGGATGTGGCTTTAGTATTCATCAAAGAAGTGGTAAAACTCCATGGTTTTCCTACAACCATTG TTTCTGATAGAGACCCACTTTTCCTTAGCCAATTCTGGAAGGAGATGTTTAGGCTGGCTGGAACTCAATTGAAGTTAAGC ACTTCTTATCATCCTCAAACAGATGGACAAATAGAGGTTGTTAACAGGTGTTTGGAGACCTACCTCAGATGTTTTGTTGG TCCTAAGCCTAAGCAATGGTTAGAGTGGCTTTCTTGGGCTGAGTTTTGGTTTAACACCAACTACAATAGTTCTGCTGGGA TGTCACCTTTCAGGGCTTTGTATGGAAGGGACCCTCCTATTCTGTTGAAGGCTGGAGCTATTCCCTCAAGGGTGGAGGAA GTTAATCAGATGTTTCTCCATAGAGATGCAGTGCTGGAAGAGTTAAAGTTCAATCTGGCCAAAGCTCAGAACCAGATGAA AGTTCAAGCAGATAGACACAGAAGAAATGTGGAGTTTCAGGAGGGGGATTGGGTCTACTTGAAGTTACAGCCCTACAAGC TCAAGTCTTTGGCTTCCAGGCCTTTTGCTAAGCTGGCCCCAAGGTTCTATGGCCCTTATCAGATCCTCAGCAGAGTGGGA CCAGTTGCTTACAAGTTGCAGCTCCCTCCACATGCTCGGATTCACTCAGTTTTCCATGTCTCACTCCTGAAGAAAGCTTT GAAGCCAGAACAGCAGCCTCAGCCTCTACCTCCAATGCTCAATGAGGAGTTAGAATTAGAAGTAGCTCCTGCTGATGTGA TAGCTTCCATGGAAGATGCCTTTGGCAACTTGGAGGTGTTAGTGAGCTGGGATACCTTGCCTTCTTGTGACAATTCTTGG GAATCAGCTGCCAAGATTCAGGAACAATTTCCTTTGTTTCCCCTTGAGGACAAGGTCAAACTTTTAGGGGGAAGTATTGA TAGGTTTAAACATGTGTACTCTAGGAAAAGGACCAGAGTGTGAACTGGCTAAGAGTTTAGGGACTGGAAATGAATAAACA ATTAGTTAGTTAGTGTCAGCTGTTGCCAGCTGTAGGCAGTTAGAGGTAGTAACCGGTTGCAGCTATGCAACTGTTAGTAT AAAAAGGGAAAGCTAGCTTGCAGATGAAGCTATCAAAGATTAGAGTTCAGAATTCTGGTTGAGGAACCAGAGAGAGATTG AGGAATCTCTAGGAACCCTAGTTTCACTGTTCTTCCCCTTTTCCCCAATTTTCTCTGTAATTTTCCAATTCCCTGAATCA ATTCTCAAATTGATTCCAAGTTGTAACCTCAGTTTCAATTCAATAATATTCATCTGATTTACCAGTGTTATCAGTAACCA TGCCTCTAGGTGTTCAAAAATGTCTTTTTGTTAGTTTTGTATATATTCTAACAGTTTGGTAGATCAGAGCGACTGCTTTC TATGTACATTTGACATAGTTCTCTGACTTCTCAACAAAAGTACAATTAAGATATTAATAAACTGACCCTCTAACAATCTG AAATATAAGTCTTTAATGAGAGGCAGGAGGAAATATGGGAAATATATTTTTATAGAGAACTTAAACTTTATCACATATTA TGTTGTTGTGGTACCTAAGATGAGACTTCTAAAATTTTCAAGGTATTTCAATTGATATTTTCTTTCCCTGAATAAGGAAG TTGAAATCCCGTCTCATAAGATAAAGTTTCCAAGATTCTACTTCTCTATTGTGGCTATCCATAACATTCTGTCCTTTTCA CCCTTCCCCTTAATTCTCTTTTCCTGCTACACCAACAAATCCATGATGTTTCTGAGACTGATTGATCTCTGGCATTGATA TTCAACATATTGAAACAGCTCCCTCAAATCCCTTGCTGACAACCAACTTAAGAAATCCCTCTACCACCCAAAGTCTTCAC ATATTACTTCCACATCCTTTCCACTTATATTATCTCATTTTTCCTCTCATGCTTTCTGAGGATATTTATTGAAGCCATTA ATGAATATGAAGGTGAAGATGCACTCCCAAGTTTCTTCTTTGCTTTGTTCTGTCTTCTTGTGAGCTATCAATTTTTGCCT TGATTATCGTAAATACACATATACATAGTTGAGTTTTTTTTGTGCAGTTCATATCAATTTTTGACTCTTTTTTTTCTAGG ATGCCTTTGCTTCGGAAAGAAGGAAAGCCAAAATGCTTAACTTCTCAATTGCATATGGAAAGACCCCAATTGGGCTTTCT AAGGATTGGAAGGTACTGTGAATTCTATTACATATTATGAGGGGCTTTTAATGGGTGACAAGCCCTCATGATTGTTGATT TGATTGTACAAACAAGTTTATACATATTTTTCTGTCAGGTTCCTGTCAAAGATGCTAAGAAAACACGTGACCTTTGGTAC AATGATAGAAAAGAAGTGTTGAAATGGCAAGAGGAACGTAAAAGAGAAGCTTGTGAATACCACTGTGTTTACACTCTGCT TGGCCGAGCCCGGCGGTTCCCTTCAGTAGATCTAGCTACCAACTACCAGAAAGGTCACATTGAACGAGCTGCTATAAATA CTCCAGTGCAGGTCCTTAATTCTTTGAAATACATCTATGCAATTGTGTGCCGCCTTCCCTTCATGTCTTTCACTATAATC TCAAGTTTCCCTTCATGTCTTTCACTATAATCTCAAGACGTTTGATGGTCACTTATAATAAATTTAAAATATAGTGATTT CTTTATCCTAATCCTACCATAAAAAAAGGTGACTGGTTCTTACTGGAGTGGACCTATGATATAATCAGTTACATTCAGGT TTTTTGGAAGATTCTGTCTGTCTTTCCTTGCAACAAGCACCTTCTTTAAAAAGATTATCCGCTTGCTTTTAGAGATGGTT GTGGAAAGTCACTGTTATGTTTAGTTGTTGATTAAGTCGCATGTTTAGATCCCTCTCCCTGCCTCTATCAATTCACATAG TGTATGATCCATTCCTACCTTAAGGACCTTTCTTTTATGGTTTTCTGATTTTTCATGTGCAACAGGGTAGTGCAGCAGAT GTTGCCATGTGTGCCATGTTACAAATAGCCAATCATAAACAGTTGAAGGAGCTTGGATGGAAGTTACTTCTTCAGGTTAA TATTTATATCAAGAATTTTCCCATTCTGTCCTCTCTTTATGTTCCATTCAATTAATTTTGCCTGCTTGTGGTTTGATTAA AATGGTTGTAATCCGTTGATTTTGGGGAGAATGAGGTAAGTATAACTAATAAAAGAGAGCTGGCTGTTGATTGAAAAGTT ACACAGGGATTCATGACAACTTAGTTGGTGTTTGTTCCTTTCTTAACTAGTACTCCCTCCGGTCCTATTTATAAGCAACA AAAAAAAAAATTCGCATAGTTTAAGAAATGTAGTTAAACTAGATAAAATGCATTAAATTTGTCTTAAATTAAAATGAACT TCCAAAATTACCCTTTGTTATTAGTGTTGGAAAGTGGAAAAGAGAGAGAATAATTAATGAGACACATTTTACAAGTTAGA ATTAATAAGGGCATCATTGGAAAAAATTAATTAATATAGCTCAAACTTTCATTTGGTTCTTATAAAAATGACCAAGATTT TTCTTCTCTTTCATGCTTATAAATAGGACCGGAGGGAGTATTTTCCATTTTGTCATAATACTCTACACTATATACATGAT GGGAATTCATCTTCCATAACATGGATGGTTTGGATTATTTAAGTGATACATTTTGAAACTCTCATATTTTTAATTGACTT GCTGATTTTATCATCCTGGTTGTATTTTTTCCATATCTCATTTTAGTTAAAGTTGCACTACAAACATCTTAGCTTCAGTG GATAATTCCATCATACAAAATTCTGTGGTCTATTTAAAAGCTTTCTTGCTACATTTTCATTAAGATTTCAGATATGACAA AGCAGGTTCACGATGAAGTCATATTGGAAGGGCCAACAGAGTCGGCTGAGGTTGCAAAGGCCATAGTTGTCGAGTGCATG TCAAAACCCTTTAATGGCAAGAACATTCTTAAAGTCGCCCTCTCTGTGGATGCCAAGATTGCTCAAAACTGGTATGCTGG AAAATAGATTTCAGCCACACAGCATGAAAGGCTGCAAAAGAATTTGGGAGATGTTTTCTCATTCAGATAGAATTTGATGC TTGGTTTCTTTGGTGACTGTAATCAAAAGAAGCTGCTACTTGAGGTGCTTTCTATTTTCCCTGGAAAAAGTGATGCCCTT GTTGAAGTCATGTGCATTGTGATTTATTTAGTGAGCATAGTATTTTTAACTATGAAGGAGCCCAGGGCCAAAATCACTTT GTGAGGTGTATATCTCTTTGTTTTGATGTGTAAATATACACATTTCATGTCCTACAGCATTGTGTACCAACGTGGACTCT TGGCTTGATACAAGCAACTGTATCATTGTGTATAAAATGGATCCTGAATTTCTATCTCATTTGCCAACGATTACAGTTGG TTGCATACTTATATCTCTGGCGAATGTATGCATTAATAAGAACAATGCTCGTTAATACGAATGCGAAAACTTGTTTTCTT ACATTTCTTGCGTGTGAACCTCCTTAACAAGTAGCAGTATTGAGTCTTCTGACATTAATGCTTGCAGTTTTTAATTACTT TTCCCTTCACAAAAATAGCTTCTTTCTTAATCACTTTTCCTTCCAATGTGGCAGCCCGATGGTTTTTCAAACATACAATA ATTGTCTACAATAATTATGATACGGCTTTAAAGGTGTTGCTGCTTCCCTTAATTTTATCTATTTATTCGGATCAAAAGAA AACTTAGGTTAACAAATATAAGTAGTCTCTTGGAAATGTTCTTAAACTTATTTGTCTCTTGTTTTTCAAATATTAAATAG TTAAATTTAGATTATATTTGACAATATTAGGTGGATATAAAGATGTAGTTGAAAAAATTATTATAATGAATAATTAATTC TAACACGTGTAGGAGTTGTGGGTATTATTCGGATTTGAAGATG 

CDS sequence (LotjaGi6g1v0163900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGGGGTCTCTTCCCAGAGCACCCCTTTCAGACCACCTTACTACTGCCCTTCTTGCTTCCGCTTCTCACTCTCCTCTTC CCGCCCTTTCCTTCTTCCTCTCTCTTACAGGTCCTTTTCTGCTTCATCTGGTTCACTCCACCCCAGCAGAAGAAAAATCC AATCAATCCAGGTTGCTAATGACGTCCTCCACAATAGCACTGGGTCTGTTAATTGTCTTCAATCTAGAGAAGTTTCATAC TGTCTAAAGAGACCATCCTTTGGGTTGAATAAATTCAATGTCATGCGGCATAACCATAATTCTCCAGTACATATTTCAGC TATGAAATTTTCAACTACATCATGTAGCATGTTGGAGGAAAAAAATCAAATGACAGCAGGAGAAAATTTGAGTTCGTATT CCTATGAAAAACAAGTTAAGATGATGCGTGGTGGGGATGAATTAGGCTGGGCTATGCGTGTTAATGATTTGTCTAAAAGA AAAAAGGAAGTGTGTGCTCTGAACCCACGTTGTTCTTATCCATCTAATACAACTGCTTCTGATGATCAGAAACATGTTTC TAAGAAGAGGGGGCACAATCTTATGCTGCAGGATCTTGGTGTACCTGCATCATCTTCTGTTGAACGTTCTATATTAAACA ACTCGAATGCATTGATAGACACGGAAAGAGTGAGCACCCAGTCAAATGAATCTTCATTAAATATCAGTGAAGAGAAAGTT GATGGAGTTAATGGCAATCACTGTTTGGATACGAGTACAACTACAAAAGATGCAACTAATGCAACAACTGTAACGAACGC ACGGAGTGCTGATCAATCTAAACTTCGGGATAAGCTCTGTAGTATCTATGAAGACATATTGGTTGTTGATAATGTTTCTC TTGCAGAGGATGTTGCTAGGATGCTTACAGTAAATTACAGGCATCTTATTCATGCATGTGATACAGAGGTGGCCAAGATA GATGTCAAAAAAGAAACACCAGTAGATCATGGGGAAATCATATGCTTCAGTATTTATTCGGGTCCAGAAGCTGATTTTGG AGGTGGAAAGTCCTGTATCTGGGTAGATGTTCTTGATGGTGGAGGCAGAGAGATATTAAATAAGTTTGCTGAATTTTTTC AAGATCCGTCCATAAAAAAGGTATGGCATAACTATAGCTTTGACTGTCATGTTATACAAAACTATGGATTCAAGGTTTCT GGATTTCATGCTGACACAATGCACATGGCAAGACTATGGGATTCATCAAGACGTTGGGTTGGTGGTTATTCTCTTGAAGC ACTTACAAGTAACAAAGTGGTCATGTCAAGGGCTAAGCTGAACTGTGAAAAGGATTTGATCGGTAAGGTGTCAATGACAA ATATATTTGGTCTGAAAAAGTTTAAGAAAGATGGATCTGAGGGTAAAATGACTACCATTGCTCCTGTGGAAGTGCTGCAA AGAGAGGATCGTATACCTTGGGTATGTTATTCAGCCTTAGATGCTAGAAGCACTATGAAGCTTTATGAGAGCCTTAAGGG TCATCTATCAGATATGGACTGGAAAATTGATGGAGCACGTGTTTTACACAAAAACATGTATGATTTTTATGAGGAATATT GGCAGCCATTTGGTGAGCTTCTAGTAAAAATGGAATCTGAAGGAATGCTAGTTGATCAGTCATATCTTCAAAACATAGAA AAGGTGGCCAAGGCAGAGCAACTTGTAGCGGTTAATCGATTTAAAAAATGGGCATCTAAGTATTGTCCTGATGCCAAGTA TATGAATGTTGGAAGTGATGCTCAGTTGCGTGTCCTTCTCTTTGGTGGCACTGTGAACAGTAAAAACCATGATGAGGCAA TTCCAACTGAGCGGATTTTCAGAATTCCCAATGTTGATAAAGTGATTGAAGAAGGCAAGAAGGCTCCCACTAAATTTCGT GATCTGAAGTTGCATAGCATTGGCTGTAACCTTAGAACTGAGATGTACACTGCTAGTGGTTGGCCCTCAGTTAGTGGTGA TGCTTTAAAAGCCCTGGCTGGCAAAGTTTCTGCTGAATATGACTTTAATGAGGCTTGTAACTTTGATCTTGATGATGAAG ATGGAAATCCTTCTCAATTTGAAGTTGAACCTGTAGAAATAGACCAATCTGCTTATGGAACAGCCTTTGCTGCATTTCCA ACAGAGGAAGAAGGGAGAGAAGCTTGTCATGCACTTGCTGCTTTACGTGATGTCTGTTCAATTGACTCTTTGATCTCTAA CTTCATCCTTCCCCTGCAGGGACATAATATATCAGGAAAGGATAACCGTGTTCATACTTCCCTCAATCCCAACACAGAGA CTGGGCGCGTGTCAGCAAGTAGGCCAAGTCTGCAGAATCAACCTGCTTTGGAGAAGGACAGATACAAAATCCGTCAAGCA TTCATAGCTGCTCCTGGAAATTCTCTTATAGTTGCTGATTATGGACAGCTGGAACTTAGGATTCTCGCTCACCTTGCTGA TTGTAAGAGCATGTTGGAAGCCTTTGAAGCTGGTGGAGATTTCCATTCAAGAACTGCAATGAATATGTACCCATATATTC GTGAAGCAGTTCATGAAAAGCAAGTGCTTCTTGAGTGGTATCCTCAACCTGGTGAAGACAAGCCCCCAGTTCCTCTTCTG AAGGATGCCTTTGCTTCGGAAAGAAGGAAAGCCAAAATGCTTAACTTCTCAATTGCATATGGAAAGACCCCAATTGGGCT TTCTAAGGATTGGAAGGTTCCTGTCAAAGATGCTAAGAAAACACGTGACCTTTGGTACAATGATAGAAAAGAAGTGTTGA AATGGCAAGAGGAACGTAAAAGAGAAGCTTGTGAATACCACTGTGTTTACACTCTGCTTGGCCGAGCCCGGCGGTTCCCT TCAGTAGATCTAGCTACCAACTACCAGAAAGGTCACATTGAACGAGCTGCTATAAATACTCCAGTGCAGGGTAGTGCAGC AGATGTTGCCATGTGTGCCATGTTACAAATAGCCAATCATAAACAGTTGAAGGAGCTTGGATGGAAGTTACTTCTTCAGG TTCACGATGAAGTCATATTGGAAGGGCCAACAGAGTCGGCTGAGGTTGCAAAGGCCATAGTTGTCGAGTGCATGTCAAAA CCCTTTAATGGCAAGAACATTCTTAAAGTCGCCCTCTCTGTGGATGCCAAGATTGCTCAAAACTGGTATGCTGGAAAATA G 

Protein sequence (LotjaGi6g1v0163900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MGVSSQSTPFRPPYYCPSCFRFSLSSSRPFLLPLSYRSFSASSGSLHPSRRKIQSIQVANDVLHNSTGSVNCLQSREVSY CLKRPSFGLNKFNVMRHNHNSPVHISAMKFSTTSCSMLEEKNQMTAGENLSSYSYEKQVKMMRGGDELGWAMRVNDLSKR KKEVCALNPRCSYPSNTTASDDQKHVSKKRGHNLMLQDLGVPASSSVERSILNNSNALIDTERVSTQSNESSLNISEEKV DGVNGNHCLDTSTTTKDATNATTVTNARSADQSKLRDKLCSIYEDILVVDNVSLAEDVARMLTVNYRHLIHACDTEVAKI DVKKETPVDHGEIICFSIYSGPEADFGGGKSCIWVDVLDGGGREILNKFAEFFQDPSIKKVWHNYSFDCHVIQNYGFKVS GFHADTMHMARLWDSSRRWVGGYSLEALTSNKVVMSRAKLNCEKDLIGKVSMTNIFGLKKFKKDGSEGKMTTIAPVEVLQ REDRIPWVCYSALDARSTMKLYESLKGHLSDMDWKIDGARVLHKNMYDFYEEYWQPFGELLVKMESEGMLVDQSYLQNIE KVAKAEQLVAVNRFKKWASKYCPDAKYMNVGSDAQLRVLLFGGTVNSKNHDEAIPTERIFRIPNVDKVIEEGKKAPTKFR DLKLHSIGCNLRTEMYTASGWPSVSGDALKALAGKVSAEYDFNEACNFDLDDEDGNPSQFEVEPVEIDQSAYGTAFAAFP TEEEGREACHALAALRDVCSIDSLISNFILPLQGHNISGKDNRVHTSLNPNTETGRVSASRPSLQNQPALEKDRYKIRQA FIAAPGNSLIVADYGQLELRILAHLADCKSMLEAFEAGGDFHSRTAMNMYPYIREAVHEKQVLLEWYPQPGEDKPPVPLL KDAFASERRKAKMLNFSIAYGKTPIGLSKDWKVPVKDAKKTRDLWYNDRKEVLKWQEERKREACEYHCVYTLLGRARRFP SVDLATNYQKGHIERAAINTPVQGSAADVAMCAMLQIANHKQLKELGWKLLLQVHDEVILEGPTESAEVAKAIVVECMSK PFNGKNILKVALSVDAKIAQNWYAGK 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 217 1066 850 0.0
PANTHER 217 1066 850 0.0
Gene3D 289 545 257 7.1E-37
SUPERFAMILY 289 514 226 1.2E-18
CDD 306 543 238 3.20347E-37
Pfam 332 506 175 5.8E-9
SUPERFAMILY 525 1064 540 1.89E-95
CDD 660 1064 405 0.0
Pfam 736 1063 328 1.3E-69
MobiDBLite 761 785 25 -
PRINTS 763 785 23 3.8E-27
Gene3D 772 1062 291 8.5E-73
PRINTS 786 801 16 3.8E-27
SMART 796 1026 231 2.2E-49
PRINTS 808 831 24 3.8E-27
Gene3D 817 986 170 8.5E-73
PRINTS 838 851 14 3.8E-27
PRINTS 979 995 17 3.8E-27
PRINTS 1009 1022 14 3.8E-27

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Nucleic acid binding Interacting selectively and non-covalently with any nucleic acid.
Molecular function DNA binding Any molecular function by which a gene product interacts selectively and non-covalently with DNA (deoxyribonucleic acid).
Molecular function DNA-directed DNA polymerase activity Catalysis of the reaction: deoxynucleoside triphosphate + DNA(n) = diphosphate + DNA(n+1); the synthesis of DNA from deoxyribonucleotide triphosphates in the presence of a DNA template and a 3'hydroxyl group.
Biological process Nucleobase-containing compound metabolic process Any cellular metabolic process involving nucleobases, nucleosides, nucleotides and nucleic acids.
Biological process DNA replication The cellular metabolic process in which a cell duplicates one or more molecules of DNA. DNA replication begins when specific sequences, known as origins of replication, are recognized and bound by initiation proteins, and ends when the original DNA molecule has been completely duplicated and the copies topologically separated. The unit of replication usually corresponds to the genome of the cell, an organelle, or a virus. The template for replication can either be an existing DNA molecule or RNA.
Biological process DNA-dependent DNA replication A DNA replication process that uses parental DNA as a template for the DNA-dependent DNA polymerases that synthesize the new strands.
Molecular function 3'-5' exonuclease activity Catalysis of the hydrolysis of ester linkages within nucleic acids by removing nucleotide residues from the 3' end.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi6g1v0163900.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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