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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0600400 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0600400.2 |
| Related isoforms 14 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Elongation factor G; TAIR: AT2G45030.1 Translation elongation factor EFG/EF2 protein; Swiss-Prot: sp|F4IW10|EFGM2_ARATH Elongation factor G-2, mitochondrial; TrEMBL-Plants: tr|A0A0S3RVP1|A0A0S3RVP1_PHAAN Elongation factor G, mitochondrial; Found in the gene: LotjaGi1g1v0600400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:114473527..114505407) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CAATACTAGTAAAAATAAACACACGAGACAATACATGGTCCATGAAAAAAAGTCGGCACTCGAACCCGACCCAGGTGAAA AATCCGACCCAGTTTCGTTTCATCATTTCTCTCGATCAAGGGTTTTACTTCGAAACCCCATTTCTCAAAACCCTGAACCC GACACCACCAACCACCATCCATGGCTCGCAGGTCCTCGGCGCCGCGCCTCCTCTACGCACTCTACACCTCAGCCTCAGCC TCGGCCTCACCGTCTCCGGCGTCGTCTCTCCTCGGCGGCGCATTCCACCTCCGGCACTACTCGGCGGGGAGCGCGGCTCG CGCGAAGACGGAGGATAAGGAGTCATGGTTGGAGTCGATGGCGAAGCTGCGGAACATTGGAATCTCGGCGCACATAGACT CCGGGAAGACGACGCTGACGGAGCGGGTGCTGTTCTACGCGGGTCGGATCCACGAGATCCACGAGGTGAGGGGCAGGGAC GGCGTCGGCGCCAAGATGGACTCCATGGACTTGGAGAGGGAGAAAGGAATCACCATCCAGTCTGCCGCCACCTATTGTTC TTGGAAAGACTGTAAGGTAGTTACTGTTACATGCTCTCTATCAATTATTCATTCTTTGTTTTGTCTTTGCTCAATTCAAC TTGAATTGAATTTTGAAGGGGTGATGAGCTTTTTTAGAATGATAAGAATCAAGGGAAAAAGGATAATTCTTGTTGCTCCA ATGAAAAACAGTTGGTAATTTTTGCTCAAGCTTTAGTTGAAAATAATTTTATATTTTTTTCTTTCCCTTACTTTAATTTG AAAAATTACAAGCTAATAACTATTATGAAGTCCTAGGAGGATAGCTCAAGTGGTAGGAGCTGGGAGACATACGGGTTGGG TAGGGAGAGGTCCAGGGTTAGATTACTGGCGGGTGCAATTTATCTTTCCGATGTAACAAAAAAAAACTATTATGAATGAT 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ATTGGTTGTAAAACTGAATAGTACAATTGATAATCTCTCTATTTATAGAGAGCTAACAAGCTTGCATAAGAAGCTAACTA ATTCTGTTATGCCAGCTCAGCTTGACAGCTAAGCTTAACAACTAACTCTGTTATACTAACAACTAATCTTGACAGCTAGG ATAACTAACTTCATAGCAGTAACTTATCAGTTACCTATCAGAAACTATATAGTATACTCTAATACCATTCAATGGTGGAT GCCAGTTGTATTGTTTCACGTCTTCCCTAATCCCACTTCTATTTCTTGATGACATATTTGCTATTCAATGTGGTCACAGG TATATTGAACCACTTCCTGCAGGGTCACCAACAAAGTTTGAATTTGAAAACATGATTGTTGGTCAGGCTATTCCATCAAA TTTTATCCCTGCAATTGAAAAAGGTTTCAAAGAAGCTGCCAACTCGTGAGTTAAATTTATTAGTTTGGCAATCGTGCTTT CAGCATTCAAATTTCATTTTTGTGATTCATCATGTAGTGTTTTGTAATAACGTAATAGGCAAGATCTCATTGTTTATACA ATTTTGCTGCATGCCAATACGATAAAACTGTTGGGTATGAAAACCAATTTTGCTCTCCATACAGTGGTGCTTTAATTGGA CATCCAGTTGAAAATCTTCGAGTTGTCTTGACGGATGGTGCTGCCCATGCTGTTGATTCCAGTGAACTTGCATTTAAGTT GGCTTCTATCTATGCTTTTAGACAGGTACTTTTCATTTCTATTATCCATATTTTATAATATTATTGCACATATTCTTTTG ACTCCTTCAGATAATAATGATGGTCCCATTCGTTGAAATTTTATTGTACTATCTTTTGTAACAGTGTTATCCAGCTTCTA GACCAGTTATATTAGAACCTGTTATGCTTGTTGAGCTGAAAGTACCAACAGAATTTCAGGGAGCTGTTGCTGGTGACCTC AACAAGTGAGGGTTCTTTATTTATTTTTTAATGGATGTTGTTGTAAAAATTCTTAATTTTCTGACATGTTTTTGCATCCG TAAAAAGGAGAAAAGGTGTGATTGTTGGCAACGATCAGGAAGGAGATGATTCTGTCATTACTGCTCATGTAAGTACCTAA CTAATCTTAGTTGGCAACCTCTGTATTAGTTCCAATAGTTGATCATTGAAACTGTGACATAATGCTTTATATGATTTGAA ACTTGAATGTGCATCTACATTTTTCTTTGTTCTCTTTTTTCGTGTTCATTAGAAGGTTTACGTCAGTGTTTTTAGAGTAG TTGGCTATTGTTACATGTTTGATGATTCAATTTGGATTGGTGCTTTCGGAAAATATGCCTTTTGGTTCTTGATATGATGC TGGATTTTAGAACATGGCTCTTAGCCTAACTCTTCCCAAAAGCTGGATGAGGGGTGCACTACCTTTTATAAGTACTACCT TGGTTATATCTCTAGTCAATGAGGACCTCAATATACCCCTTCACGCCTAGGGCTGAACTTTCGGAGCATGAAGTTTGTAG GTCTTAGAATTTGGGTTAAGCCTAACTCTACCCCAAAAGTTTGCTTAGGAGTGAGGGTTGCCAGGATTATTTTGGCCATA TCTCCAGTCTATGTGATACTTCTCAGCAGTAGGAATAGACAGGCTGGAAAATTGTTATTCTGGATCAGTAAAATGTTTGT TAGTGGTTTCATTTTGGTTTTATCTCACAAGTTTACTTCAAAGGCTGTTCTAGTTCTTGAACCTTTGGCATTAGTTGTTT ATCCGTGAGTCCTTTTTAAATAGGTTGCTGTTAATTATTTCAGGTCCCTCTTAACAACATGTTTGGGTATTCTACATCTC TGCGTTCCATGACACAGGTGAATATCACTTCATCAAGAACATTTCACGTTTTTGTATAAACTTATATTTGTTCTGTAATT 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ACAAATTTGAACAATTTTCCTTCCAAATAGAATCTCTCGAGCTACATTTTTTCCAAGTTAAGCGAATTGAACGACCATGA AGCTAACATCCTCGGAAAAATTCTTTTGGACAACATGTTGCCTAACTCATCCATTGAGAGGGTATAATATGGTTCAGGAG ATGCCTCATGTTGCTACACAACACTTTTAGACGGTTTAGAC
CDS sequence (LotjaGi1g1v0600400.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTCGCAGGTCCTCGGCGCCGCGCCTCCTCTACGCACTCTACACCTCAGCCTCAGCCTCGGCCTCACCGTCTCCGGC GTCGTCTCTCCTCGGCGGCGCATTCCACCTCCGGCACTACTCGGCGGGGAGCGCGGCTCGCGCGAAGACGGAGGATAAGG AGTCATGGTTGGAGTCGATGGCGAAGCTGCGGAACATTGGAATCTCGGCGCACATAGACTCCGGGAAGACGACGCTGACG GAGCGGGTGCTGTTCTACGCGGGTCGGATCCACGAGATCCACGAGGTGAGGGGCAGGGACGGCGTCGGCGCCAAGATGGA CTCCATGGACTTGGAGAGGGAGAAAGGAATCACCATCCAGTCTGCCGCCACCTATTGTTCTTGGAAAGACTGTAAGATCA ACATAATTGACACACCTGGACATGTTGATTTCACGATTGAGGTTGAGAGGGCTTTACGTGTCCTTGATGGTGCCATTCTT GTTCTGTGTAGTGTTGGTGGGGTGCAAAGTCAGTCCATTACTGTTGATCGTCAAATGAGAAGATATGACGTCCCGAGACT TGCATTTATCAACAAGCTTGATCGGATGGGTGCAGATCCATGGAAAGTTTTAAATCAGGCTAGATCTAAGCTTCGGCATC ATAGTGCTGCAATACAAGTTCCAATAGGCTTAGAAGATGATTTTAAGGGACTTATTGATCTTGTGGAGTTAAAGGCCTAC TATTTTCATGGTTCAAATGGTGAAAATATTGTCATTGAAGAAGTACCTGCAGATATGGAAGCCCTGGTGGCAGAAAAAAG ACGTGAACTCATAGAAACTGTGTCAGAGGTAGATGACGTACTTGCTGAAGCTTTTCTCGGTGATGAGACCATATCACCTG CTGATCTTGAGGGTGCAATTCGTAGGGCTACCATAGCGCAGAAATTCATACCAGTATTCATGGGTAGTGCTTTCAAAAAT AAGGGGGTACAGCCACTTCTGGATGGTGTAGTTAATTATTTGCCATGTCCAATTGAAGTTAAAAATTATGCTCTTGATCA AACCAAGAACGAGGAGAAGGTGGAGTTGCTCGGAAATCCTAATGGACCACTTGTGGCATTGGCTTTCAAGTTGGAGGAAG GACGGTTTGGCCAGTTAACATATCTAAGAGTCTATGAGGGTGTTATTCGAAAGGGTGATTTTATTATTAATGTAAACACC GGCAAGAAGATCAAGGTCCCTCGCTTGGTTCGGATGCACTCAGATGAGATGGAGGACATTCAGGAGGCTCATGCCGGCCA AATAGTTGCTGTATTTGGTGTTGATTGTGCATCAGGAGATACTTTTACTGATGGGTCAGTTAAATACACAATGACTTCTA TGAATGTTCCTGAGCCCGTGATGTCCTTAGCTGTACAGCCAGTCTCAAAAGATTCTGGAGGGCAATTTTCAAAAGCTTTG AATCGCTTCCAGAGAGAGGATCCTACTTTCCGTGTTGGCTTAGATCCAGAGAGCGGGCAGACGATCATTTCTGGAATGGG GGAACTTCATTTAGATATCTATGTTGAACGCATTAGGAGAGAGTATAAGGTTGATGCTTCAGTTGGAAAGCCCCGTGTGA ACTTCAGAGAAACTGTTACTCAGCGTGCTGATTTTGATTATTTACATAAGAAGCAATCTGGAGGGCAAGGGCAATATGGA CGGGTAACTGGGTATATTGAACCACTTCCTGCAGGGTCACCAACAAAGTTTGAATTTGAAAACATGATTGTTGGTCAGGC TATTCCATCAAATTTTATCCCTGCAATTGAAAAAGGTTTCAAAGAAGCTGCCAACTCTGGTGCTTTAATTGGACATCCAG TTGAAAATCTTCGAGTTGTCTTGACGGATGGTGCTGCCCATGCTGTTGATTCCAGTGAACTTGCATTTAAGTTGGCTTCT ATCTATGCTTTTAGACAGTGTTATCCAGCTTCTAGACCAGTTATATTAGAACCTGTTATGCTTGTTGAGCTGAAAGTACC AACAGAATTTCAGGGAGCTGTTGCTGGTGACCTCAACAAGAGAAAAGGTGTGATTGTTGGCAACGATCAGGAAGGAGATG ATTCTGTCATTACTGCTCATGTCCCTCTTAACAACATGTTTGGGTATTCTACATCTCTGCGTTCCATGACACAGGGAAAG GGTGAATTCACAATGGAATACAAGGAACATTCCCCAGTTTCTCATGATGTACAGACGCAATTGATAAACACGTACAAGGG CAACAAGGCAGCTGAATAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0600400.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MARRSSAPRLLYALYTSASASASPSPASSLLGGAFHLRHYSAGSAARAKTEDKESWLESMAKLRNIGISAHIDSGKTTLT ERVLFYAGRIHEIHEVRGRDGVGAKMDSMDLEREKGITIQSAATYCSWKDCKINIIDTPGHVDFTIEVERALRVLDGAIL VLCSVGGVQSQSITVDRQMRRYDVPRLAFINKLDRMGADPWKVLNQARSKLRHHSAAIQVPIGLEDDFKGLIDLVELKAY YFHGSNGENIVIEEVPADMEALVAEKRRELIETVSEVDDVLAEAFLGDETISPADLEGAIRRATIAQKFIPVFMGSAFKN KGVQPLLDGVVNYLPCPIEVKNYALDQTKNEEKVELLGNPNGPLVALAFKLEEGRFGQLTYLRVYEGVIRKGDFIINVNT GKKIKVPRLVRMHSDEMEDIQEAHAGQIVAVFGVDCASGDTFTDGSVKYTMTSMNVPEPVMSLAVQPVSKDSGGQFSKAL NRFQREDPTFRVGLDPESGQTIISGMGELHLDIYVERIRREYKVDASVGKPRVNFRETVTQRADFDYLHKKQSGGQGQYG RVTGYIEPLPAGSPTKFEFENMIVGQAIPSNFIPAIEKGFKEAANSGALIGHPVENLRVVLTDGAAHAVDSSELAFKLAS IYAFRQCYPASRPVILEPVMLVELKVPTEFQGAVAGDLNKRKGVIVGNDQEGDDSVITAHVPLNNMFGYSTSLRSMTQGK GEFTMEYKEHSPVSHDVQTQLINTYKGNKAAE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SignalP_GRAM_NEGATIVE | 1 | 22 | 22 | - | – | |
| Phobius | 1 | 9 | 9 | - | – | |
| Phobius | 1 | 22 | 22 | - | – | |
| SignalP_GRAM_POSITIVE | 1 | 27 | 27 | - | – | |
| Phobius | 10 | 17 | 8 | - | – | |
| Phobius | 18 | 22 | 5 | - | – | |
| Phobius | 23 | 752 | 730 | - | – | |
| PANTHER | 49 | 744 | 696 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 57 | 346 | 290 | 8.8E-108 | – | |
| TIGRFAM | 59 | 746 | 688 | 1.1E-281 | ||
| Hamap | 59 | 745 | 687 | 107.785 | ||
| SUPERFAMILY | 60 | 335 | 276 | 1.06E-97 | ||
| ProSiteProfiles | 61 | 338 | 278 | 69.682 | ||
| Pfam | 62 | 335 | 274 | 4.3E-60 | ||
| TIGRFAM | 62 | 236 | 175 | 1.1E-25 | ||
| PRINTS | 65 | 78 | 14 | 8.5E-16 | ||
| CDD | 65 | 337 | 273 | 0.0 | – | |
| ProSitePatterns | 107 | 122 | 16 | - | ||
| PRINTS | 114 | 122 | 9 | 8.5E-16 | ||
| PRINTS | 134 | 144 | 11 | 8.5E-16 | ||
| PRINTS | 150 | 161 | 12 | 8.5E-16 | ||
| PRINTS | 186 | 195 | 10 | 8.5E-16 | ||
| SUPERFAMILY | 302 | 454 | 153 | 1.23E-29 | ||
| Gene3D | 347 | 457 | 111 | 2.5E-32 | – | |
| CDD | 364 | 444 | 81 | 5.65792E-49 | – | |
| Pfam | 377 | 443 | 67 | 1.2E-14 | ||
| SUPERFAMILY | 454 | 531 | 78 | 1.04E-21 | ||
| Pfam | 456 | 530 | 75 | 2.9E-31 | ||
| CDD | 457 | 532 | 76 | 7.86228E-40 | ||
| Gene3D | 458 | 532 | 75 | 7.5E-30 | – | |
| Pfam | 531 | 650 | 120 | 1.2E-37 | ||
| SUPERFAMILY | 531 | 653 | 123 | 2.02E-36 | ||
| SMART | 532 | 652 | 121 | 2.6E-52 | ||
| CDD | 535 | 650 | 116 | 1.55713E-61 | ||
| Gene3D | 536 | 740 | 205 | 7.5E-81 | ||
| SMART | 654 | 741 | 88 | 2.2E-34 | ||
| Pfam | 654 | 740 | 87 | 1.9E-26 | ||
| SUPERFAMILY | 654 | 746 | 93 | 8.63E-25 | ||
| CDD | 657 | 734 | 78 | 1.60689E-46 | ||
| Gene3D | 658 | 728 | 71 | 7.5E-81 | – | |
| Coils | 748 | 752 | 5 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Translation elongation factor activity | Functions in chain elongation during polypeptide synthesis at the ribosome. | ||
| Molecular function | GTPase activity | Catalysis of the reaction: GTP + H2O = GDP + phosphate. | ||
| Molecular function | GTP binding | Interacting selectively and non-covalently with GTP, guanosine triphosphate. | ||
| Biological process | Translational elongation | The successive addition of amino acid residues to a nascent polypeptide chain during protein biosynthesis. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0600400.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…