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LotjaGi1g1v0600400.5

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0600400
Transcript ID LotjaGi1g1v0600400.5
Related isoforms 14
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Elongation factor G; TAIR: AT2G45030.1 Translation elongation factor EFG/EF2 protein; Swiss-Prot: sp|F4IW10|EFGM2_ARATH Elongation factor G-2, mitochondrial; TrEMBL-Plants: tr|A0A0S3RVP1|A0A0S3RVP1_PHAAN Elongation factor G, mitochondrial; Found in the gene: LotjaGi1g1v0600400
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:114473701..114504378) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CCATCCATGGCTCGCAGGTCCTCGGCGCCGCGCCTCCTCTACGCACTCTACACCTCAGCCTCAGCCTCGGCCTCACCGTC TCCGGCGTCGTCTCTCCTCGGCGGCGCATTCCACCTCCGGCACTACTCGGCGGGGAGCGCGGCTCGCGCGAAGACGGAGG ATAAGGAGTCATGGTTGGAGTCGATGGCGAAGCTGCGGAACATTGGAATCTCGGCGCACATAGACTCCGGGAAGACGACG CTGACGGAGCGGGTGCTGTTCTACGCGGGTCGGATCCACGAGATCCACGAGGTGAGGGGCAGGGACGGCGTCGGCGCCAA GATGGACTCCATGGACTTGGAGAGGGAGAAAGGAATCACCATCCAGTCTGCCGCCACCTATTGTTCTTGGAAAGACTGTA AGGTAGTTACTGTTACATGCTCTCTATCAATTATTCATTCTTTGTTTTGTCTTTGCTCAATTCAACTTGAATTGAATTTT GAAGGGGTGATGAGCTTTTTTAGAATGATAAGAATCAAGGGAAAAAGGATAATTCTTGTTGCTCCAATGAAAAACAGTTG GTAATTTTTGCTCAAGCTTTAGTTGAAAATAATTTTATATTTTTTTCTTTCCCTTACTTTAATTTGAAAAATTACAAGCT AATAACTATTATGAAGTCCTAGGAGGATAGCTCAAGTGGTAGGAGCTGGGAGACATACGGGTTGGGTAGGGAGAGGTCCA GGGTTAGATTACTGGCGGGTGCAATTTATCTTTCCGATGTAACAAAAAAAAACTATTATGAATGATTACATAACATGGTA TTATGGCTTCGAGCCGATGAGAAAAGACTTGATTGTTGTTGTTCTCTCTCTTTCCATGAAGTGAAATTGGGATAGGTGAA TGAGTTTGAGGTTTTAGTTGAGGACAAGCTAAACTAGTGAAGTGTATTTTGAAGTGCTCGTGTTTTTAGAGTGATAGGGA 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0600400.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

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Protein sequence (LotjaGi1g1v0600400.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MARRSSAPRLLYALYTSASASASPSPASSLLGGAFHLRHYSAGSAARAKTEDKESWLESMAKLRNIGISAHIDSGKTTLT ERVLFYAGRIHEIHEVRGRDGVGAKMDSMDLEREKGITIQSAATYCSWKDCKINIIDTPGHVDFTIEVERALRVLDGAIL VLCSVGGVQSQSITVDRQMRRYDVPRLAFINKLDRMGADPWKVLNQARSKLRHHSAAIQVPIGLEDDFKGLIDLVELKAY YFHGSNGENIVIEEVPADMEALVAEKRRELIETVSEVDDVLAEAFLGDETISPADLEGVQPLLDGVVNYLPCPIEVKNYA LDQTKNEEKVELLGNPNGPLVALAFKLEEGRFGQLTYLRVYEGVIRKGDFIINVNTGKKIKVPRLVRMHSDEMEDIQEAH AGQIVAVFGVDCASGDTFTDGSVKYTMTSMNVPEPVMSLAVQPVSKDSGGQFSKALNRFQREDPTFRVGLDPESGQTIIS GMGELHLDIYVERIRREYKVDASVGKPRVNFRETVTQRADFDYLHKKQSGGQGQYGRVTGYIEPLPAGSPTKFEFENMIV GQAIPSNFIPAIEKGFKEAANSGALIGHPVENLRVVLTDGAAHAVDSSELAFKLASIYAFRQCYPASRPVILEPVMLVEL KVPTEFQGAVAGDLNKRKGVIVGNDQEGDDSVITAHVPLNNMFGYSTSLRSMTQGKGEFTMEYKEHSPVSHDVQTQLINT YKGNKAAE 

Domain prediction

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Gene3D 434 508 75 7.1E-30
SUPERFAMILY 507 629 123 1.92E-36
Pfam 507 626 120 1.1E-37
SMART 508 628 121 2.6E-52
CDD 511 626 116 7.07638E-62
Gene3D 512 716 205 7.1E-81
SUPERFAMILY 630 722 93 8.15E-25
SMART 630 717 88 2.2E-34
Pfam 630 716 87 1.8E-26
CDD 633 710 78 1.40397E-46
Gene3D 634 704 71 7.1E-81

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Translation elongation factor activity Functions in chain elongation during polypeptide synthesis at the ribosome.
Molecular function GTPase activity Catalysis of the reaction: GTP + H2O = GDP + phosphate.
Molecular function GTP binding Interacting selectively and non-covalently with GTP, guanosine triphosphate.
Biological process Translational elongation The successive addition of amino acid residues to a nascent polypeptide chain during protein biosynthesis.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0600400.5, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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