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LotjaGi2g1v0067700.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0067700
Transcript ID LotjaGi2g1v0067700.1
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Receptor-kinase, putative; TAIR: AT4G20140.1 Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase; Swiss-Prot: sp|C0LGQ5|GSO1_ARATH LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO1; TrEMBL-Plants: tr|A0A1J7GNZ0|A0A1J7GNZ0_LUPAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0067700
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:15917290..15937940) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

GCCATCATGAGTTTCACTTATCAATTATTGACCCGGAAAAATAAGGACCACCAGTAGTTATTTAATAACAACGGTTCGAT TGGGAAAAAATTCTTGGACGGCTGAGATTAAAGACTTGTTAACTGAAAGCCAAAACTCATTCAACCAATCTTATACAGTT ACACATTTTGCAAAGAGACCCACGTTTACAGAATTGTAACCCTAAAAGGCATGGACGAGCGAGATCGATGGAGGAGCACT TTCCTTTACTCCGCCGCCGTCAGATTCGCCGTGTTCTCGCCGGAGCAGAACGGTGGGAGTTTCATGGCGTCCAATGGCTC ATTTTTTCATCGCCGGCGGTCATTGAGTCGGAGGAGAGGTTCGCCCCGTGCGACTGGCGAAGGTAAGACACCGTCGGTCA TTGTTGTTATCTTTACCTGTGAGTTTTCCATGATGATGATGATGCTTGTGGTGATGCAGGTAGAACGCGGTTGGTTGGAT TGGAAGTGAGGTAAATGGCTGATGAGTATAGAGTTGAGTTTTGATGGAAGAGTGATGTTAATGTTGAGATTTGAGAACAC CAAAGCTTCTGACAGAGAGAAATCGTGAAATCGAGAAGGTAATTTCAATTGCATAGTTTAACATTTTTTTTAATTGAGTG CATTGAGAGTTTCAATGGCGATTTATGTGATACTACAACAATAATAACAAAAGCCTTATCCCACTAAGTGAAGTCCGTTA TATGAATCACACTAAGCTCGATCAAAAACTAAATTATGTGTGATACTATTGATTTGTGTGATACTGCTAGATCCAATTTT AGGGCTTAAGGCAATCCTACAAAAGGAGTGGTACTATTTATGAGAAAAGGAGCAAGATTCCGATAAATAAATGCAATAGA TCAACTATATTGATCAGAATGTTAAATTATCTTCCTATATGTACAGGGAGATAGGAACAATCTGAATGGGAAGCTTTAAA 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AGACTTTTTGTTGAGAGTTTAAGGATCAATTTGGCAAAACAATTTGAGTTTGGCACCGAGATAATGCAAAAGAATATTTT CCATGTCGTTTACTTCAGTCTTGGCATCATATCAATCCAAAGTTTGAGAAGTTTAGCAAAGTTATTTAGGAGTTTTACAT GACTCATTGTGAAAAACATCACTAACTTCTTAAATGTTCATCACTAGTTAAATTTAGTTACCTTGTTGTGTATATGGATG ATTTTTTCATTACAGTTGATGATTAAAAAGGGATTGATTAGTTGAAACAACACTTGTTCAAGTATTTACAAACTAAAGAT TTGGGCTAATTACGAAACTTTCTCGTGATTGATGTAGCTCAAAGACGTGTGTTTCTATATCTCAAAGGAGATTTGTTCTT GATATTCTAGAAGAAGCTAGAATGCTTGATTGTATAGCTGTTGACACACCTATAGACCACAATTTGAAACTTCTTCCTAA TCAGGGGTATCTTGATCTAGGGAGGTACACAAGGTTAGTGGGGTTGTTGAATTATCTTAGGATGACTAGACCTAACATAG CCTTTTCAGTCAGTGCTGTGAGTCAGTTTCTTAACTCACCTTGTGATAGTAATTGGAATGCAGTCATCCGGATCCCAAGA TACTTAAAAGGATCACCCGAAAAAGAACTTGTTTACACGGATAAGGGTCATAATGATGTCCTTGGAATATGCTGATGCAT ATTGGGTAGGTGATGTTACTTAATACTAGGAGGATCACTACTGATTATTGTTTTCTTTTTGAGAAAAACCTAATATGTTT TCCTTTGTGCATACTAAGGATCAACTTGCAGATATGTTAACAAAGTCTTTATGGGGTCCAAGGATAACATATAGATGTCA CAAGTTTTGATAGATCCGATATATATACTCCAGCATCAAGAGAAGTGTTGAATATTTGTTATTAAATTTGTTATTTAGAT TAGCATAATCCTATAAAATTAGGAATTGAGTTTGTTACATAGTTTTTCTATTTAGATTAGTAATATCCCATTAAATTAGG GGTAGAATTATATTTGACTTAAGAATATCCTCTTTTATGTATTTATAAATTGCAAAAGTCATATGATGAAATATACACAG AAAATATATTAATCGCAATATCTTTCACACTTTTTATTTATTAAATGTGATCTAACAGTAATGTATTTTGTTTTCATATT TTATCTTTAAAAAAAATAGTGATATAAGAGTAATATAATATTTTTTTTTGCATGTAATAGAAAGTTATGTAAAGAGCGAA GATGATGATACTTGCATTTGCATACAGTAACAAGGACACCAAATTTTACTCTCTAAATGTTTTGCATAAAAACTAAAGTG TAGGAAGAGGATGTCACAGACACACACTGACACATGTGTACATATATATATGTATGAATAACCACTAGCTTTGTGTTGCA GAATTTGGATCGGAAGGCATTGTGTCCATTAAAGGAGATGTTTACAGCTTCGGTATTATGCTTATGGAACTATTTACAAC AAAGAGACCAACAGATCAAATGTTTGTAGGGGGAATAAGTTTAAGGTCATGGATCCAAGAGTCAATGCCAAATAAGATTA TTCAAGTTATAGACCCGAATCTGATGGAGGGAGAGGAACAATTTATTTCTGCCAAGGAAGCAGCTATATCAAATATCATG TTGTTGGCTTTGAATTGCTCTGCAGACTCCCTTGATGAGAGGATGAGTATGGATGAAGTCTTACGTCGCTTGATCAAAAT CAAAACCACATTTCAGCAAGGAAATTCAAGTTAGGAAAAACCATAAAGTCATATTGTATTGTCATAAAAGGCTTTTGTTG TAATAATCTATTTGTTGAAAATTCTCACACTACACAAAAAATGACCTTTATTGCACCTACTTTTAACAATTTTATGTGAA AGTACTAAATAACAATTTTATAGAAGTTAAAGAATTATGAATCTATTGTTTGAACTTTCCATGGTGTCCTTGTCCTCAAT TGTCCTTGGTGACGGGTCGTAAACTCACTTCCATGACTCGAGTGACTTCTTTATGGTCCCTCAAGTCATGGTCTCTTGTG TGAATCTCATGTAGCACTCTCATTCTCCTTTCATTGTTGCTCCACCTTAAGTTCCATACTAAGAATCTTGCAAAAGTAGA ATAATTATACCAGGTCATATATCTAAAAAGATACAATCTCAGTCCTCTGACGAACCTTTTGATACAAATCTCCTCTGTAA GAGGGTAAGGAGTACATTTAGATAGGTGGGTGAAATAGGTATTATGCTCTAAGGACCATCTTCTGGTTCAGAATGTCTAT CAGATAGAATGCAATCCATCTTATGAAATAAAAACATTAAGAATCTAATACTTTATTTTTCTTCTCTAGGCATTGAATTG ATAGAAGCTGA 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0067700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGAGAAAACTTGCTTCATCTTCATTCTTGTCTTGTCATTCCACCATATCATGGCAGCCCCAGACATAAGCAACACCAA TTCCACAGACCAATCTGCACTTCTTGCCTTCAAATCTTATATCACCTTTGATCCTCAAGATACCTTGACCAATAATTGGT CTACCTCTTCCTCTGTGTGCAACTGGTTTGGGGTAACTTGTGATGTCAAAAATGGGAGGGTCATAGGTGTAGCTCTCACC AACATGAAATTAAATGGGACCCTTCCACCTCACTTAGGAAACTTAACTTTCCTTGTTGATCTTGACCTTCACAACAATAG CTTTCATGGAACTTTACCAAAAGGGTTATCCTTGTTACCTAGATTGAAGGTGGTCAACTTGTGCACCAACAGTTTCGGTG GAGGATTTCCATCATGGATTGGGGAGTTATCTAAACTCCAAAATTTGAGTCTTTGCAATAACACTTTTTCAGGTTCAATT CCTTCATCCCTATCCAATTTGTCAGAACTGGAGGCTTTGGATTTGAGCTTTAATTTTTTATATGGAAGCATTCCACCTGA GCTTGGAAGGCTTCAAAATTTGAAGGTATTGAATTTGGGGTACAATCAACTTTCCAGTGATATCCCTTCTTCAATCTTCA ATATCTCCACGTTGGAAGTGATTAGATTGGAGTATAACTCTTTATCAGGAAGCATCCCTAAAAAACTTGGTGATCTACCA CAACTAAGAAGCATAAGTTTGAGCAAAAACAACCTTTCAGGCTCAATTCCGTCATCCTTCTTCAATTTGTCCACGCTTCA AGAGATTCAATTTATTTACAATAACCTATCTGGCTCGTTGCCACCGGATATGTGTCACACGTTTCCCATGCTTCAATTGC TTGACCTATCTGGGAATTCACTTTTTGGTCAAATTCCATCAAGTTTGAATCAATGTAAGGAGCTCAAGTATCTGAGGATG ATCAGTAATCGATTATCTGGAAACCTGCCCAGTGATGTCGGAAGATTATCTATGCTTGAGGAGTTGGACCTTAGTAACAA CAATCTAACAGGTTCACTTCCTCCGTCTCTTTTCAACATATCCTCTTTGAGACTAATAAATCTTCGAAACAACTTCTTCA ATGGCCAACTTCCTGAGGAGATGTGTCAGCATGCCAAGTCCCTCCAACAAATTTCTATCTTAAATAACAAAGTTGGGGGA ATCATTCCAAGGTCTATTAACAACTGCACCTCCCTCAAACGCTTATTTTTGGGAGGAAATTTTTTTACAGGTACCATACC TCATGAGATTGGTGACTACCTAAGAAACCTTGAAAAATTGCATTTGCAAGGTAACAGACTGAGAGGGTCTATTCCAACAA GCATCTTCAACATCTCAGGGCTAATTAGTTTGTCACTATCAAATAACCAACTGTCAGGCAACATTCCAATTAAAGCACAT CATAGCATGTCCAACCTCCAGTTCTTGTACCTTTCAGCTAACAATCTCAGTGGAGAAATTCCCAGTGGCCTTTTCAATGC TACAGAGCTTCTTGAACTAGTACTTGCCAACAATACATTAACAGGAATCATACCTGAATCAGTTGGGAATTTAAGAAATC TCCAACTCTTTTATCTGATAGGGAACCAATTGACTAGTGATCCAGCCTCTTCAGAAATGGGTTTCCTAACTTCATTGACC AATTGTAGACAATTGGAAAAAATTCTGCTATCATTCAATCCTCTTAACGGAACACTTCCAAATTCTATTGGAAACTTTTC AAACACTCTACAAACTTTGGATGCCTGGAGGTGTAATATCAAGGGTGAAATCCCTTCACAGATCGGCAATTTAAAGAACT TGTTTGACATCAATCTAAACGAAAACCAACTTACAGGTCATGTTCCTAGTACAATTGGCACTTTGCAGCTTCTCCAACGT TTGGATCTTTCATTCAACAAACTAAATGGTTTAATCCCAGATCAGATTTGCCATTTGCTTAAACTGAATGAGTTGCGCCT TAGCGAAAATCAGATTTCTGGGCCAGTTCCAGAATGCTTAAGGTTTCTTACTTCTCTAAGAAACCTTTACTTGGATTCCA ATTACTTGAACGCTACAATACCCTCTTCCCTTTGGAGCCTCACAGATATCTTGGAGGTGAACTTATCCTCTAATGGTTTT GTAGGGTCACTGCCAGATGAGTTAAGTGCCATGTTTGCTCTGATAAAATTGGACATATCAAACAATTACCTTTCAGGGGA ACTTCCAATTGGTATTGGTGGCTTGCAAAAGATAATGAACTTGTCGTTAGCTAATAATATGTTACAAGGGCGTATTCCTG ATTCAGTTGGAAACATGTTAAGCTTGGAATTTTTGGACCTTTCTCATAACCTTTTATCAGGCATCATCCCCAAGTCAATT GAGAAACTTCTTTATCTCAAATCCATCAACTTGTCTTATAATAAACTAGAAGGTGAAATTCCTTCTGGTGGCAGTTTCAT AAATTTCACAGCTCAATCCTTCAACATGAACTCAGCACTTTGTGGGAAACCTGAGCTAGAAGTACCACCATGTCCAAGTC ATAGTGCGAAACATAACAGGACAAGAAACAAACTTTTACTGAAATTGATTATACCATTAATTTTTGCTGGCATGTTTCTT GTTTTTGCAATTCTTCTGATATACCGGAAACAATGCAACAGAGGTTCAAATAACTTGGATTTTCCAACACTTCTAACTAC AAGTAGAATTCCCTACCATGAGCTTGTGGAGGCAACACATAAATTTGACGACAGCAATCTTGTTGGAAGAGGAAGTTTTG GTTCTGTGTACAAGGGTAAGCTTTCAAATGGACTAATGGTTGCAATTAAAGTATTCCATTTTGAGAATGAGCAAGAAACA TCAAGGAGTTTTGATAAGGAATGTGAAGCATTGTGCAATCTTCGCCATCGTAATCTAGTTAAAGTCATCACTAGTTGTTC CAATGCCTTTGATTTCAAGGCCCTGGTAATGGAATTTGTGCCTAACGGGGACTTGGAGAAGTGGTTGTATTCTCATAACT ATTTCCTAAGTTTCATGCAAAGACTAAACATAGTGATAGATATTGCATCTGCCTTGGAGTATCTCCATCATGATAACCCC AACTCTGTTGTGCACTGTGACCTGAAGCCAAGCAATGTTTTGTTGGATGAAGATATGGTAGCTCATGTGTGTGATTTTGG CATATCTAAACTCTTGGAAGAAGGGCAACTTCAAGTGCATACAAACACTCTTGCAACTCCTGGTTATATTGCACCAGAAT TTGGATCGGAAGGCATTGTGTCCATTAAAGGAGATGTTTACAGCTTCGGTATTATGCTTATGGAACTATTTACAACAAAG AGACCAACAGATCAAATGTTTGTAGGGGGAATAAGTTTAAGGTCATGGATCCAAGAGTCAATGCCAAATAAGATTATTCA AGTTATAGACCCGAATCTGATGGAGGGAGAGGAACAATTTATTTCTGCCAAGGAAGCAGCTATATCAAATATCATGTTGT TGGCTTTGAATTGCTCTGCAGACTCCCTTGATGAGAGGATGAGTATGGATGAAGTCTTACGTCGCTTGATCAAAATCAAA ACCACATTTCAGCAAGGAAATTCAAGTTAG 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0067700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MEKTCFIFILVLSFHHIMAAPDISNTNSTDQSALLAFKSYITFDPQDTLTNNWSTSSSVCNWFGVTCDVKNGRVIGVALT NMKLNGTLPPHLGNLTFLVDLDLHNNSFHGTLPKGLSLLPRLKVVNLCTNSFGGGFPSWIGELSKLQNLSLCNNTFSGSI PSSLSNLSELEALDLSFNFLYGSIPPELGRLQNLKVLNLGYNQLSSDIPSSIFNISTLEVIRLEYNSLSGSIPKKLGDLP QLRSISLSKNNLSGSIPSSFFNLSTLQEIQFIYNNLSGSLPPDMCHTFPMLQLLDLSGNSLFGQIPSSLNQCKELKYLRM ISNRLSGNLPSDVGRLSMLEELDLSNNNLTGSLPPSLFNISSLRLINLRNNFFNGQLPEEMCQHAKSLQQISILNNKVGG IIPRSINNCTSLKRLFLGGNFFTGTIPHEIGDYLRNLEKLHLQGNRLRGSIPTSIFNISGLISLSLSNNQLSGNIPIKAH HSMSNLQFLYLSANNLSGEIPSGLFNATELLELVLANNTLTGIIPESVGNLRNLQLFYLIGNQLTSDPASSEMGFLTSLT NCRQLEKILLSFNPLNGTLPNSIGNFSNTLQTLDAWRCNIKGEIPSQIGNLKNLFDINLNENQLTGHVPSTIGTLQLLQR LDLSFNKLNGLIPDQICHLLKLNELRLSENQISGPVPECLRFLTSLRNLYLDSNYLNATIPSSLWSLTDILEVNLSSNGF VGSLPDELSAMFALIKLDISNNYLSGELPIGIGGLQKIMNLSLANNMLQGRIPDSVGNMLSLEFLDLSHNLLSGIIPKSI EKLLYLKSINLSYNKLEGEIPSGGSFINFTAQSFNMNSALCGKPELEVPPCPSHSAKHNRTRNKLLLKLIIPLIFAGMFL VFAILLIYRKQCNRGSNNLDFPTLLTTSRIPYHELVEATHKFDDSNLVGRGSFGSVYKGKLSNGLMVAIKVFHFENEQET SRSFDKECEALCNLRHRNLVKVITSCSNAFDFKALVMEFVPNGDLEKWLYSHNYFLSFMQRLNIVIDIASALEYLHHDNP NSVVHCDLKPSNVLLDEDMVAHVCDFGISKLLEEGQLQVHTNTLATPGYIAPEFGSEGIVSIKGDVYSFGIMLMELFTTK RPTDQMFVGGISLRSWIQESMPNKIIQVIDPNLMEGEEQFISAKEAAISNIMLLALNCSADSLDERMSMDEVLRRLIKIK TTFQQGNSS 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 19 19 -
SignalP_EUK 1 19 19 -
SignalP_GRAM_NEGATIVE 1 19 19 -
Phobius 1 3 3 -
SignalP_GRAM_POSITIVE 1 19 19 -
Phobius 4 14 11 -
Phobius 15 19 5 -
Phobius 20 864 845 -
Gene3D 22 182 161 2.7E-47
SUPERFAMILY 27 286 260 9.86E-55
Pfam 28 68 41 1.6E-10
PANTHER 73 237 165 0.0
PANTHER 73 237 165 0.0
SMART 95 119 25 110.0
ProSiteProfiles 97 119 23 4.886
Pfam 120 178 59 1.8E-7
SMART 143 169 27 190.0
ProSiteProfiles 145 168 24 5.61
SMART 167 190 24 140.0
ProSiteProfiles 169 191 23 5.802
Gene3D 183 286 104 2.8E-31
SMART 191 217 27 48.0
SMART 191 215 25 0.8
ProSiteProfiles 193 215 23 6.988
SUPERFAMILY 197 584 388 1.41E-63
ProSiteProfiles 217 240 24 4.647
PANTHER 228 355 128 0.0
PANTHER 228 355 128 0.0
SMART 239 263 25 20.0
SMART 239 265 27 220.0
Pfam 240 301 62 1.4E-9
ProSiteProfiles 241 263 23 5.941
Gene3D 287 555 269 8.5E-73
SMART 288 312 25 41.0
ProSiteProfiles 290 312 23 5.81
PANTHER 322 430 109 0.0
PANTHER 322 430 109 0.0
SMART 336 362 27 110.0
SMART 336 360 25 1.6
ProSiteProfiles 338 360 23 7.111
PRINTS 339 352 14 3.7E-5
Pfam 339 357 19 0.2
PANTHER 422 546 125 0.0
PANTHER 422 546 125 0.0
SMART 434 460 27 38.0
SMART 434 458 25 6.1
Pfam 435 496 62 9.7E-8
ProSiteProfiles 436 458 23 6.418
ProSiteProfiles 460 482 23 5.918
SUPERFAMILY 481 822 342 1.26E-62
PANTHER 483 1182 700 0.0
PANTHER 483 1182 700 0.0
SMART 483 507 25 1.3
SMART 483 506 24 410.0
ProSiteProfiles 485 507 23 6.349
ProSiteProfiles 509 530 22 5.001
SMART 531 554 24 86.0
ProSiteProfiles 533 554 22 5.494
Gene3D 556 853 298 7.7E-86
SMART 635 658 24 43.0
ProSiteProfiles 637 658 22 5.956
Pfam 638 696 59 3.6E-9
SMART 659 682 24 180.0
ProSiteProfiles 661 681 21 5.587
SMART 683 707 25 8.6
ProSiteProfiles 685 708 24 5.502
ProSiteProfiles 733 756 24 4.801
Pfam 757 816 60 1.0E-6
SMART 779 802 24 25.0
SMART 779 800 22 270.0
PRINTS 779 792 14 3.7E-5
ProSiteProfiles 781 802 22 7.165
ProSiteProfiles 805 827 23 5.363
Phobius 865 888 24 -
TMHMM 869 888 20 -
Phobius 889 1209 321 -
Gene3D 896 999 104 3.6E-24
SUPERFAMILY 897 1201 305 2.83E-71
ProSiteProfiles 922 1203 282 37.29
SMART 922 1203 282 2.7E-36
Pfam 927 1195 269 2.3E-43
ProSitePatterns 928 950 23 -
Gene3D 1000 1208 209 4.4E-55
ProSitePatterns 1043 1055 13 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein kinase activity Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP.
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Protein phosphorylation The process of introducing a phosphate group on to a protein.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0067700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…